Prvek FIE3 (nestabilita ftz 3 ') - FIE3 (ftz instability element 3′) element

Prvek FIE3 (nestabilita ftz prvek 3 ')
RF00227.jpg
Identifikátory
SymbolFIE3
RfamRF00227
Další údaje
RNA typCis-reg
DoményEukaryota
TAKSO: 0000233
PDB strukturPDBe

The Prvek FIE3 (nestabilita ftz prvek 3 ') je RNA element nalezen v 3 'UTR z fushi tarazu mRNA Gen fushi tarazu je nezbytný pro založení Drosophila plán embryonálního těla. Při prvním vyjádření na začátku embryogeneze, mRNA fushi tarazu je rovnoměrně rozložena na většinu z embryo. Následně se exprese mRNA fushi tarazu rychle vyvíjí do vzoru sedmi pruhů, které obklopují embryo. Nestabilita mRNA fushi tarazu může přispět k lokalizaci tohoto vzorce výraz, ale je nepravděpodobné, že by to byl dominantní efekt, protože prvek zebřího pruhu o délce 744 párů bází může řídit ektopickou expresi reportérového konstruktu (se strukturou mRNA zcela nesouvisející s přepisem ftz) v kvalitativně velmi podobném vzoru.[1] Experimenty poskytují důkazy o nejméně dvou destabilizujících prvcích v mRNA fushi tarazu, z nichž jeden je umístěn v 5′ jedna třetina mRNA a druhá poblíž 3 'konec (označeno FIE3 pro prvek nestability ftz 3 '). FIE3 leží uvnitř 201-nukleotid sekvence těsně před polyadenylace signál a může působit autonomně k destabilizaci heterologní mRNA. Dále vymazání konstrukty identifikovaly základní 68-nukleotidový prvek v rámci FIE3.[2] Ačkoli se předpokládá, že tento prvek obsahuje sekundární strukturu, obsahuje také sekvenci bohatou na GU (UGUUUUGUUU), která je podobná prvkům nestability GU bohatým následně identifikovaným v jiných systémech.[3]

Reference

  1. ^ Brown JL, Sonoda S, Ueda H, Scott MP, Wu C (březen 1991). „Represe segmentačního genu Drosophila fushi tarazu (ftz)“. Časopis EMBO. 10 (3): 665–674. PMC  452699. PMID  2001679.
  2. ^ Riedl A, Jacobs-Lorena M (červen 1996). „Determinanty nestability mRNA Drosophila fushi tarazu“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (6): 3047–3053. doi:10,1128 / mcb.16.6.3047. PMC  231299. PMID  8649416.
  3. ^ Vlasova-St Louis I, Bohjanen PR (srpen 2011). „Souřadnicová regulace rozpadových sítí mRNA pomocí prvků bohatých na GU a CELF1“. Aktuální názor na genetiku a vývoj. 21 (4): 444–451. doi:10.1016 / j.gde.2011.03.002. PMC  3146975. PMID  21497082.

externí odkazy