Virus Escherichia HK97 - Escherichia virus HK97

Virus Escherichia HK97
Klasifikace virů
(bez hodnocení):	Virus
Oblast:	Duplodnaviria
Království:	Heunggongvirae
Kmen:	Uroviricota
Třída:	Caudoviricetes
Objednat:	Caudovirales
Rodina:	Siphoviridae
Rod:	Hendrixvirus
Druh:	Virus Escherichia HK97

Virus Escherichia HK97, často zkrácený na HK97, je druh virus který infikuje Escherichia coli a související bakterie. Je pojmenován po Hongkong (HK), kde byl poprvé umístěn. HK97 má dvouvláknový genom DNA.

Sestavení a zrání

Virus Escherichia HK97, jak je patrné z transmisní elektronová mikroskopie (TEM), s zvětšení 300 000x.

Hlavní kapsid protein HK97, nazývaný gp5, zesíťuje po zrání za vzniku a řetězová pošta jako struktura.^[1] Zatímco se DNA balí do kapsidy, kapsida se rozpíná o téměř 5 nm a mění se ze sférického na ikosahedrický tvar.

Cesta sestavení HK97 začíná samostatným sestavením gp5 do pentamerů a hexamerů. Proteáza zvaná gp4 štěpí gp5 na svém N-konec. Připevnění portálového proteinu, gp3, spojené s konformačními změnami vede k tvorbě a postup nebo prokapsid, který je předchůdcem zralé kapsidy.^[2]A lešení protein není vyžadováno pro montáž kapsidy.^[3] Studie účinků delece delta domény hlavního kapsidového proteinu nebo jeho částí však naznačují, že je to nezbytné pro sestavení.^[4]

Reference

^ Helgstrand, Charlotte; Wikoff, William R.; Duda, Robert L; Hendrix, Roger W; Johnson, John E; Liljas, Lars (1. prosince 2003). „Rafinovaná struktura proteinového katenanu: bakteriofágový kapsid HK97 v rozlišení 3,44Å“. Journal of Molecular Biology. 334 (5): 885–899. doi:10.1016 / j.jmb.2003.09.035. PMID 14643655.
^ Hendrix, RW; Johnson, JE (2012). "Sestavení a zrání kapsidy bakteriofága HK97". Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 726: 351–63. doi:10.1007/978-1-4614-0980-9_15. ISBN 978-1-4614-0979-3. PMID 22297521.
^ Duda RL, Martincic K, Hendrix RW (1995). "Genetický základ sestavy bakteriofága HK97 prohead". J. Mol. Biol. 247 (4): 636–47. doi:10.1006 / jmbi.1994.0169. PMID 7723020.
^ Oh B, Moyer CL, Hendrix RW, Duda RL (2014). „Delta doména hlavního kapsidového proteinu HK97 je nezbytná pro sestavení“. Virologie. 456-457: 171–8. doi:10.1016 / j.virol.2014.03.022. PMC 4044616. PMID 24889236.

Další čtení

externí odkazy

UniProt Taxonomy: Enterobacteria phage HK97

[1] Helgstrand, Charlotte; Wikoff, William R.; Duda, Robert L; Hendrix, Roger W; Johnson, John E; Liljas, Lars (1. prosince 2003). „Rafinovaná struktura proteinového katenanu: bakteriofágový kapsid HK97 v rozlišení 3,44Å“. Journal of Molecular Biology. 334 (5): 885–899. doi:10.1016 / j.jmb.2003.09.035. PMID 14643655.

[2] Hendrix, RW; Johnson, JE (2012). "Sestavení a zrání kapsidy bakteriofága HK97". Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 726: 351–63. doi:10.1007/978-1-4614-0980-9_15. ISBN 978-1-4614-0979-3. PMID 22297521.

[pmid7723020-3] Duda RL, Martincic K, Hendrix RW (1995). "Genetický základ sestavy bakteriofága HK97 prohead". J. Mol. Biol. 247 (4): 636–47. doi:10.1006 / jmbi.1994.0169. PMID 7723020.

[pmid24889236-4] Oh B, Moyer CL, Hendrix RW, Duda RL (2014). „Delta doména hlavního kapsidového proteinu HK97 je nezbytná pro sestavení“. Virologie. 456-457: 171–8. doi:10.1016 / j.virol.2014.03.022. PMC 4044616. PMID 24889236.

[1]

[2]

[3]

[4]