Rodina holinů DP-1 - Dp-1 holin family

The Rodina Bacterophase Dp-1 Holin (Dp-1 Holin) (TC # 1.E.24 ) je rodina proteinů přítomných v několika Grampozitivní bakterie (tj., Enterococcus faecalis ) a jejich fág.[1][2] Geny kódující lytický systém pneumokokové fág, Dp-1, byl klonován a charakterizován.[3] Holin fága Dp-1 je 74 aminoacylových zbytků (aas) dlouhých se dvěma domnělými transmembránovými segmenty (TMS) (zbytky 12-32 a 39-57). Lytický enzym Dp-1 (Pal), an N-acetyl-muramoyl-L-alanin amidáza, ukazuje modulární organizaci podobnou organizaci popsané pro lytické enzymy z Streptococcus pneumoniae a jeho bakteriofág ve kterém změna v pořadí funkčních domén mění specifičnost enzymu.[2] Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny Dp-1 lze nalézt v Databáze klasifikace transportérů.[4]

Viz také

Reference

  1. ^ Labrie, Steve; Vukov, Natasa; Loessner, Martin J .; Moineau, Sylvain (2004-04-01). "Distribuce a složení lyzační kazety fágů Lactococcus lactis a funkční analýza bakteriofága ul36 holin". Mikrobiologické dopisy FEMS. 233 (1): 37–43. doi:10.1016 / j.femsle.2004.01.038. ISSN  0378-1097. PMID  15043867.
  2. ^ A b Paulsen, I. T .; Banerjei, L .; Myers, G. S. A .; Nelson, K.E .; Seshadri, R .; Read, T. D .; Fouts, D. E.; Eisen, J. A .; Gill, S. R. (2003-03-28). "Role mobilní DNA ve vývoji vankomycinu rezistentního Enterococcus faecalis". Věda. 299 (5615): 2071–2074. Bibcode:2003Sci ... 299.2071P. doi:10.1126 / science.1080613. ISSN  1095-9203. PMID  12663927. S2CID  45480495.
  3. ^ Sheehan, M. M .; García, J. L .; López, R .; García, P. (01.08.1997). „Lytický enzym pneumokokového fága Dp-1: chimérický lysin intergenerického původu“. Molekulární mikrobiologie. 25 (4): 717–725. doi:10.1046 / j.1365-2958.1997.5101880.x. ISSN  0950-382X. PMID  9379901.
  4. ^ „1.E.24 Bakterofázová rodina Dp-1 Holin (Dp-1 Holin)“. Databáze klasifikace transportérů. Citováno 2016-03-28.

Do tato úprava, tento článek používá obsah z „1.E.24 Bakterofázová rodina Dp-1 Holin (Dp-1 Holin)“, který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.