Ontologie nemoci - Disease Ontology - Wikipedia

The Ontologie nemoci (DO) je formální ontologie člověka choroba.^[1]^[2]^[3] The Projekt Ontology nemoci je umístěn na Institute for Genome Sciences na Lékařská fakulta University of Maryland.

Projekt Disease Ontology byl původně vyvinut v roce 2003 na adrese Northwestern University řešit potřebu účelové ontologie, která pokrývá celé spektrum konceptů nemocí anotovaných v biomedicínských úložištích v ontologickém rámci, který je rozšiřitelný tak, aby vyhovoval potřebám komunity.

The Disease Ontology is a OBO (Otevřené biomedicínské ontologie) Slévárna ontologie.

Identifikátory ontologie nemoci (DOID) se skládají z předpony DOID: následované číslem, například Alzheimerova choroba má stabilní identifikátor DOID: 10652. DO je křížový odkaz v několika zdrojích, jako je UniProt.

Příklad termínu

Záznam Ontology nemoci pro onemocnění motorických neuronů ve formátu OBO je uveden níže a ukazuje odkazy na další klasifikační schémata, včetně ICD-9, ICD-10, Pletivo, SNOMED a UMLS.

id: DOID: 231

název: onemocnění motorických neuronů

def: "Neurodegenerativní onemocnění, které se nachází v motorických neuronech." Onemocnění motorických neuronů

xref: ICD10CM: G12.2

xref: ICD10CM: G12.20

xref: ICD9CM: 335.2

xref: MSH: D016472

xref: SNOMEDCT_US_2016_03_01: 155015007

xref: SNOMEDCT_US_2016_03_01: 192888001

xref: SNOMEDCT_US_2016_03_01: 192889009

xref: SNOMEDCT_US_2016_03_01: 192890000

xref: SNOMEDCT_US_2016_03_01: 37340000

xref: UMLS_CUI: C0085084

is_a: DOID: 1289! neurodegenerativní onemocnění

Viz také

Projekt Ontology nemoci

Reference

^ Schriml, Lynn Marie; Arze, Cesar; Nadendla, Suvama; Chang, Yu-Wei Wayne; Mazaitis, Mark; Felix, Victor; Feng, Gang; Kibbe, Warren Alden (leden 2012). „Ontologie nemoci: páteř pro sémantickou integraci nemoci“. Výzkum nukleových kyselin. 40 (Problém s databází): D940 – D946. doi:10.1093 / nar / gkr972. PMC 3245088. PMID 22080554.
^ Osborne, John D; Flatow, Jared; Holko, Michelle; Lin, Simon M; Kibbe, Warren A; Zhu, Lihua (Julie); Danila, Maria I; Feng, Gang; Chisholm, Rex L (7. července 2009). „Anotace lidského genomu pomocí Ontology nemoci“. BMC Genomics. 10 Suppl 1: S6. doi:10.1186 / 1471-2164-10-s1-s6. PMC 2709267. PMID 19594883.
^ Kibbe, Warren A .; Arze, Cesar; Felix, Victor; Mitraka, Elvira; Bolton, Evan; Fu, Gang; Mungall, Christopher J .; Binder, Janos X .; Malone, James; Vasant, Drashtti; Parkinson, Helen; Schriml, Lynn M. (leden 2015). „Aktualizace Disease Ontology 2015: rozšířená a aktualizovaná databáze lidských nemocí pro propojení biomedicínských znalostí s údaji o nemoci“. Výzkum nukleových kyselin. 43 (Problém s databází): D1071 – D1078. doi:10.1093 / nar / gku1011. PMC 4383880. PMID 25348409.

externí odkazy

[1] Schriml, Lynn Marie; Arze, Cesar; Nadendla, Suvama; Chang, Yu-Wei Wayne; Mazaitis, Mark; Felix, Victor; Feng, Gang; Kibbe, Warren Alden (leden 2012). „Ontologie nemoci: páteř pro sémantickou integraci nemoci“. Výzkum nukleových kyselin. 40 (Problém s databází): D940 – D946. doi:10.1093 / nar / gkr972. PMC 3245088. PMID 22080554.

[2] Osborne, John D; Flatow, Jared; Holko, Michelle; Lin, Simon M; Kibbe, Warren A; Zhu, Lihua (Julie); Danila, Maria I; Feng, Gang; Chisholm, Rex L (7. července 2009). „Anotace lidského genomu pomocí Ontology nemoci“. BMC Genomics. 10 Suppl 1: S6. doi:10.1186 / 1471-2164-10-s1-s6. PMC 2709267. PMID 19594883.

[3] Kibbe, Warren A .; Arze, Cesar; Felix, Victor; Mitraka, Elvira; Bolton, Evan; Fu, Gang; Mungall, Christopher J .; Binder, Janos X .; Malone, James; Vasant, Drashtti; Parkinson, Helen; Schriml, Lynn M. (leden 2015). „Aktualizace Disease Ontology 2015: rozšířená a aktualizovaná databáze lidských nemocí pro propojení biomedicínských znalostí s údaji o nemoci“. Výzkum nukleových kyselin. 43 (Problém s databází): D1071 – D1078. doi:10.1093 / nar / gku1011. PMC 4383880. PMID 25348409.

[1]

[2]

[3]