Dieter Ebert - Dieter Ebert

Dieter Ebert
Prof. Dr. Dieter Ebert.jpg
narozený
Německo
Alma materTechnická univerzita v Mnichově (1988)
Známý jakoVýzkum v oblasti interakce hostitel-parazit
koevoluce
Vědecká kariéra
Poleevoluční biologie
genomika
ekologie z metapopulace
InstituceKatedra environmentálních věd, zoologie, at University of Basel (Švýcarsko)
Doktorský poradceStephen C. Stearns
Ostatní akademičtí poradciJürgen Jacobs, W. D. Hamilton, John Lawton

Dieter Ebert je profesorem zoologie a evoluční biologie na Zoologickém ústavu v Praze University of Basel v Basilej, Švýcarsko. Je to evoluční ekolog a genetik, známý svým výzkumem o interakce hostitel-patogen a koevoluce, hlavně s využitím modelového systému Dafnie a jeho parazity.

Vzdělání a akademické pozice

Ebert získal v roce 1988 diplom v oboru zoologie a ekologie Technická univerzita v Mnichově, Německo. Během postgraduálního studia strávil rok na University of South Alabama, Alabama. V roce 1991 získal doktorát z evoluční biologie ve skupině Stephen C. Stearns na univerzitě v Basileji ve Švýcarsku. V roce 1991 strávil Ebert šest měsíců na Vavilovově ústavu obecné genetiky v Moskvě v Rusku. Poté následovalo stipendijní stipendium na Smithsonian Tropical Research Institute v Panama. V roce 1992 se Ebert připojil k výzkumné skupině William (Bill) Hamilton na University of Oxford, kde začal pracovat na interakcích hostitel - parazit. Další postdoktorand absolvoval v Centru populační biologie NERC (CPB) Silwood Park s Johnem Lawtonem, než se stal asistentem na univerzitě v Basileji ve Švýcarsku. V roce 2001 se stal řádným profesorem na University of Fribourg Ve Švýcarsku, ale v roce 2004 se vrátil na Basilejskou univerzitu.

Výzkum

Ebert je známý především svou prací na koevoluci hostitel - parazit. Během postdoktorátu na Oxfordské univerzitě vyvinul systém parazitů Daphnia jako nový model experimentálních studií. Zejména Daphnia magna se stal modelovým systémem pro pochopení genetiky, evoluce a ekologie interakce hostitel-parazit.....[1] Na přírodních stanovištích jsou Dafnie často infikovány různými mikroparazity,[2] a řada těchto parazitů může být použita jako modely v laboratoři a v terénu (viz část Parazitismus na Daphnia magna ) využívající observační, experimentální a genomické přístupy.

Práce z jeho výzkumné skupiny vyústila v řadu důležitých zjištění.

  • Paraziti jsou většinou virulentnější v hostitelské populaci, kde se vyvinuli, než v jiných nových populacích, což ukazuje, že na rozdíl od předchozího názoru paraziti nevyvíjejí avirulenci, zatímco se přizpůsobují svým hostitelům.[3]
  • The Monokultura účinky se objevují také v případě, že hostitelská populace není prostorově strukturovaná, což zdůrazňuje důraz na absenci genetické struktury hostitelské populace.[4]
  • Mateřská zkušenost ovlivňuje odolnost potomků vůči bakteriálním parazitům.[5]
  • Princip masové akce, široce používaný nástroj v epidemiologii, byl poprvé podpořen silnými experimentálními daty s použitím Daphnia magna a jeho bakteriálního patogenu Pasteuria ramosa[6]
  • Koevoluci parazitů a jejich hostitelů lze vysledovat ve vrstvených sedimentech rybníků po několik desetiletí a podporuje Hypotéza Rudé královny koevoluce[7][8]
  • Mikrobioty jsou životně důležité D. magna také. Bez mikroflóry hostitelé rostou pomaleji, mají sníženou plodnost a vyšší úmrtnost ve srovnání s hostitelem s mikroflórou.[9][10]
  • V posledních letech byly genetické a genomické nástroje používány k pochopení způsobu dědičnosti, dominance a epistázy lokusů rezistence na parazity v hostitelském genomu.[11][12][13] Současně skupina Eberta mapovala umístění genu rezistence v genomu[14][15] a objevil a Supergen se shlukem tří genů rezistence ve silné fyzické vazbě[16]

Mentoring

Ebert je známý tím, že má vysokou míru umisťování účastníků na akademické pozice. Předchozí účastníci (bývalí doktorandi a postdoktorandi) pokračovali na pozicích PI v institucích po celém světě, například Tom Little (University of Edinburgh), Christoph Haag (CNRS, Montpellier), Marco Archetti (University of East Anglia, UK & Penn) State University, USA), Florian Altermatt (University of Zürich), Pepijn Luijckx (Trinity College, Dublin), Laurence Mouton (University of Lyon), Sabrina Gaba (INRA Dijon), Karen Haag (University de Rio Grande de Sol, Brazil) , Frida Ben-Ami (Tel Aviv University), Mathew Hall (Monash University, Austrálie), Jason Andras (Mount Holyoke, USA), Anne Roulin (University of Zurich), Hirumo Ito (Nagasaki University, Japonsko) a Marilou Sison-Mangus (University of California, Santa Cruz, USA).

Od roku 2001 je Dieter Ebert hlavním organizátorem letní školy Guarda v evoluční biologii,[17] mistrovská třída pro postgraduální studenty evoluční biologie, která se koná v odlehlé švýcarské alpské vesnici Guarda, Švýcarsko, Kanton Graubünden. Tuto letní školu zahájil Stephen Stearns v roce 1987 a představovala vynikající výběr evolučního biologa na její fakultě, včetně John Maynard Smith Georg Williams, W. D. Hamilton, Richard Lenski a Peter a Rosemary Grant.[18]

Uznání

Dieter Ebert je členem Akademie věd Leopoldina,[19] the Evropská organizace pro molekulární biologii (EMBO),[20] a je stálým spolupracovníkem Berlínský institut pro pokročilé studium[21]

externí odkazy

Reference

  1. ^ Ebert, Dieter (01.01.2005). Ekologie, epidemiologie a vývoj parazitismu v Dafniích. Národní centrum pro biotechnologické informace (USA). ISBN  1932811060.
  2. ^ Stirnadel, Heide A .; Ebert, Dieter (1997). „Prevalence, specificita hostitele a dopad na plodnost hostitele mikroparazitů a epibiontů u tří druhů sympatrických dafnií“. Journal of Animal Ecology. 66 (2): 212–222. doi:10.2307/6023. JSTOR  6023.
  3. ^ Ebert D (1994). Virulence a lokální adaptace horizontálně přenášeného parazita. Science 265: 1084-1086
  4. ^ Altermatt F, Ebert D (2008). Genetická rozmanitost populací Daphnia magna zvyšuje odolnost vůči parazitům. Ecol Lett 11: 918-928. Doi 10.1111 / J.1461-0248.2008.01203.X
  5. ^ Ben-Ami F, Ebert D, Regoes RR (2010). Křivky infekčnosti dávky patogenu jako metoda pro analýzu distribuce náchylnosti hostitele: Kvantitativní posouzení účinků na matku po stresu z jídla a expozici patogenům. Am Nat 175: 106-115. 10.1086 / 648672
  6. ^ Regoes RR, Hottinger JW, Sygnarski L, Ebert D (2003). Míra infekce Daphnia magna Pasteuria ramosa odpovídá principu masové akce. Epidemiol Infect 131: 957-966
  7. ^ Decaestecker E, Gaba S, Raeymaekers JAM, Stoks R, Van Kerckhoven L, Ebert D et al (2007). Dynamika hostitelského parazita „Red Queen“ archivovaná v sedimentu rybníka. Nature 450: 870-873
  8. ^ Ebert D (2008). Koevoluce hostitel-parazit: Pohledy z modelového systému parazitů Daphnia. Curr Opin Mircobiol 11: 290-301
  9. ^ Sison-Mangus MP, Mushegian AA, Ebert D (2015). Vodní blechy vyžadují pro přežití, růst a reprodukci mikroflóru. ISME Journal 9: 59-67. 10.1038 / ismej.2014.116
  10. ^ Mushegian AA, Walser JC, Sullam KE, Ebert D (2018). Mikrobiota diapauzy: Jak se asociace hostitel-mikrob vytváří po klidu ve vodním korýši. J Anim Ecol 87: 400-413. 10.1111 / 1365-2656.12709
  11. ^ Luijckx P, Ben-Ami F, Mouton L, Du Pasquier L, Ebert D (2011). Klonování nekultivovatelného parazita Pasteuria ramosa a jeho hostitele Daphnia odhaluje extrémní interakce genotyp-genotyp. Ecol Lett 14: 125-131. 10.1111 / j.1461-0248.2010.01561.x
  12. ^ Luijckx P, Fienberg H, Duneau D, Ebert D (2012). Rezistence na bakteriálního parazita u korýšů Daphnia magna ukazuje dominanci Mendelovy segregace. Dědičnost 108: 547-551. 10.1038 / hdy.2011.122
  13. ^ Metzger CMJA, Luijckx P, Bento G, Mariadassou M, Ebert D (2016). Červená královna žije: Epistáza mezi propojenými lokusy odporu. Evoluce 70: 480-487. 10.1111 / evo.12854
  14. ^ Routtu J, Ebert D (2015). Genetická architektura rezistence hostitelů Daphnia proti dvěma druhům hostitelských specifických parazitů. Dědičnost 114: 241-248. 10.1038 / hdy.2014.97
  15. ^ Krebs M, Routtu J, Ebert D (2017). QTL mapování přirozeného genetického polymorfismu pro dlouhodobou perzistenci parazitů v populacích dafnií. Parasitology 144: 1686-1694. 10.1017 / s0031182017001032
  16. ^ Bento G, Routtu J, Fields PD, Bourgeois Y, Du Pasquier L, Ebert D (2017). Genetický základ rezistence a interakce alely systému hostitel-parazit: model Daphnia magna-Pasteuria ramosa. PLoS Genet 13. ARTN e1006596, DOI: 10,1371 / journal.pgen.1006596
  17. ^ [1], 24. února 2019
  18. ^ Guarda letní škola, [2], 24. února 2019
  19. ^ Webové stránky Leopoldiny, [3], Leopoldina, 24. února 2019
  20. ^ Webová stránka EMBO, [4], EMBO, 24. února 2019
  21. ^ Wissenschaftskolleg zu Berlin, „Stálí spolupracovníci“, Dieter Ebert, 24. února 2019