Desulfitobacterium dehalogenans - Desulfitobacterium dehalogenans

Desulfitobacterium dehalogenans
Vědecká klasifikace
Doména:	Bakterie
Kmen:	Firmicutes
Třída:	Clostridia
Objednat:	Clostridiales
Rodina:	Peptococcaceae
Rod:	Desulfitobacterium
Druh:	D. dehalogenany
Binomické jméno
	Desulfitobacterium dehalogenans; Utkin et al. 1994

Desulfitobacterium dehalogenans je druh bakterie.^[1] Jsou to fakultativní organohalogenidy dýchající bakterie schopné reduktivně dechlorovat chlorfenolický sloučeniny a tetrachlorethen. Jsou anaerobní, pohyblivý, Grampozitivní a tyčinkovité bakterie schopné využívat širokou škálu dárců a akceptorů elektronů.^[2] Typový kmen JW / IU-DC^T, DSM 9161, ID taxonomie NCBi 756499.

Existují dva popsané izoláty z tohoto druhu kmenů JW / IU-DC^T^[1] a PCE1.^[3] Genomy obou kmenů byly sekvenovány, žádný z kmenů nekóduje žádné plazmidy, kromě šesti reduktivní dehalogenázy, genomy kódují velké množství genů pro využití řady donorů a akceptorů elektronů.


Kmen	Zdroj	Velikost genomu, Mbp	Počet reduktivní dehalogenázy	DSM
JW / IU-DC^T	Sladkovodní rybník	4,3^[4]	6	9161
PCE1	Znečištěná duše	4,2^[5]	6	10344

Reference

^ ^A ^b Utkin I, Woese C, Wiegel J (říjen 1994). „Izolace a charakterizace Desulfitobacterium dehalogenans gen. Nov., Sp. Nov., Anaerobní bakterie, která reduktivně dechloruje chlorofenolické sloučeniny.“. International Journal of Systematic Bacteriology. 44 (4): 612–9. doi:10.1099/00207713-44-4-612. PMID 7981092.
^ Villemur R, Lanthier M, Beaudet R, Lépine F (září 2006). "Rod Desulfitobacterium". Recenze mikrobiologie FEMS. 30 (5): 706–33. doi:10.1111 / j.1574-6976.2006.00029.x. PMID 16911041.
^ Gerritse J, Renard V, Pedro Gomes TM, Lawson PA, Collins MD, Gottschal JC (únor 1996). „Desulfitobacterium sp. Kmen PCE1, anaerobní bakterie, která může růst redukční dechlorací tetrachlorethenu nebo orthochlorovaných fenolů“. Archiv mikrobiologie. 165 (2): 132–40. doi:10,1007 / s002030050308. PMID 8593100. S2CID 29965475.
^ Kruse T, van de Pas BA, Atteia A, Krab K, Hagen WR, Goodwin L, Chain P, Boeren S, Maphosa F, Schraa G, de Vos WM, van der Oost J, Smidt H, Stams AJ (březen 2015) . „Genomická, proteomická a biochemická analýza organohalidové dýchací cesty v Desulfitobacterium dehalogenans“. Journal of Bacteriology. 197 (5): 893–904. doi:10.1128 / JB.02370-14. PMC 4325113. PMID 25512312.
^ Kruse T, Goris T, Maillard J, Woyke T, Lechner U, de Vos W, Smidt H (prosinec 2017). "Srovnávací genomika rodu Desulfitobacterium". Ekologie mikrobiologie FEMS. 93 (12). doi:10.1093 / femsec / fix 135. PMID 29040502.

Další čtení

Wiegel J, Zhang X, Wu Q (květen 1999). „Anaerobní dehalogenace hydroxylovaných polychlorovaných bifenylů pomocí Desulfitobacterium dehalogenans“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 65 (5): 2217–21. doi:10.1128 / AEM.65.5.2217-2221.1999. PMC 91319. PMID 10224022.
Mackiewicz M, Wiegel J (leden 1998). „Srovnání energetických a růstových výnosů pro Desulfitobacterium dehalogenans během používání chlorofenolu a různých tradičních akceptorů elektronů“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 64 (1): 352–5. doi:10.1128 / AEM.64.1.352-355.1998. PMC 124717. PMID 16349491.
Bergey DH, Krieg NR, Holt JG (1989). Bergeyův manuál systematické bakteriologie. 3. Baltimore, MD: Williams a Wilkins. str. 2250–2251.
Gerritse J, Renard V, Pedro Gomes TM, Lawson PA, Collins MD, Gottschal JC (únor 1996). „Desulfitobacterium sp. Kmen PCE1, anaerobní bakterie, která může růst redukční dechlorací tetrachlorethenu nebo orthochlorovaných fenolů“. Archiv mikrobiologie. 165 (2): 132–40. doi:10,1007 / s002030050308. PMID 8593100. S2CID 29965475.

externí odkazy

Tento Clostridiales související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[UtkinWoese1994-1] A ^b Utkin I, Woese C, Wiegel J (říjen 1994). „Izolace a charakterizace Desulfitobacterium dehalogenans gen. Nov., Sp. Nov., Anaerobní bakterie, která reduktivně dechloruje chlorofenolické sloučeniny.“. International Journal of Systematic Bacteriology. 44 (4): 612–9. doi:10.1099/00207713-44-4-612. PMID 7981092.

[2] Villemur R, Lanthier M, Beaudet R, Lépine F (září 2006). "Rod Desulfitobacterium". Recenze mikrobiologie FEMS. 30 (5): 706–33. doi:10.1111 / j.1574-6976.2006.00029.x. PMID 16911041.

[3] Gerritse J, Renard V, Pedro Gomes TM, Lawson PA, Collins MD, Gottschal JC (únor 1996). „Desulfitobacterium sp. Kmen PCE1, anaerobní bakterie, která může růst redukční dechlorací tetrachlorethenu nebo orthochlorovaných fenolů“. Archiv mikrobiologie. 165 (2): 132–40. doi:10,1007 / s002030050308. PMID 8593100. S2CID 29965475.

[4] Kruse T, van de Pas BA, Atteia A, Krab K, Hagen WR, Goodwin L, Chain P, Boeren S, Maphosa F, Schraa G, de Vos WM, van der Oost J, Smidt H, Stams AJ (březen 2015) . „Genomická, proteomická a biochemická analýza organohalidové dýchací cesty v Desulfitobacterium dehalogenans“. Journal of Bacteriology. 197 (5): 893–904. doi:10.1128 / JB.02370-14. PMC 4325113. PMID 25512312.

[5] Kruse T, Goris T, Maillard J, Woyke T, Lechner U, de Vos W, Smidt H (prosinec 2017). "Srovnávací genomika rodu Desulfitobacterium". Ekologie mikrobiologie FEMS. 93 (12). doi:10.1093 / femsec / fix 135. PMID 29040502.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]