Mapování mazání - Deletion mapping - Wikipedia

tento článek ne uvést žádný Zdroje. Prosím pomozte vylepšit tento článek podle přidávání citací ke spolehlivým zdrojům. Zdroj bez zdroje může být napaden a odstraněn. Najít zdroje: „Mapování mazání“  – zprávy  · noviny  · knihy  · učenec  · JSTOR (Květen 2019) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony)

v genetika a hlavně genetické inženýrství, mapování mazání je technika používaná ke zjištění mutace weby v rámci a gen.

Princip mapování delece zahrnuje křížení kmene, který má a bodová mutace v genu s více kmeny, z nichž každý nese a vymazání v jiné oblasti stejného genu. Kdekoli rekombinace dochází mezi dvěma kmeny k produkci a divoký typ (+) gen (bez ohledu na frekvenci), bodová mutace nemůže ležet v oblasti delece. Pokud rekombinace nemůže produkovat žádné geny divokého typu, je rozumné dojít k závěru, že bodová mutace a delece se nacházejí ve stejném úseku DNA.

Tento příklad by měl ukázat, jak princip funguje:

Předpokládejme, že máte gen X, které ve formě divokého typu (+) lze zobrazit lineárně takto:

5'-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3' gen X, +

Předpokládejme, že kmen organismů má bodovou mutaci v genu (nyní nazývanou gen X, - k označení, že již nejde o divoký typ):

5 '------------------------------------------------ ----X--------------------------------------------- ----------------- 3 ' gen X, -

Nyní předpokládejme, že máte dva kmeny organismů, každý s delecemi v genu X na různých místech, tzv del-1 a del-2(tečkovaná čára označuje místo odstranění):

5'-------------------(..............................................)------------------------------------------------3' del-1

5'------------------------------------------------------------(............................................)---------3' del-2

Protože bodová mutace spočívá v deleci del-1, nebudou mezi bodovou mutantou a del-1 mutantem žádné rekombinanty divokého typu (+). Avšak při křížení mezi bodovým mutantem a del-2 mutantem by mohlo dojít k úspěšnému produkci divokého typu (+) rekombinantu.

V případě genetické rekombinace, pokud je mutovaná alela v dárci v sekvenci odpovídající oblasti odstraněné v příjemci, nebudou získány žádné (+) rekombinanty (jako v křížení s del-1). Chcete-li opravit deleci rekombinací, musí mít dárce sekvenci divokého typu DNA v oblasti odpovídající DNA odstraněné u příjemce (jako v případě křížení s del-2). Jinými slovy, existuje reálná možnost rekombinace mezi bodovou mutantou a del-2, ve které by mohla být vytvořena délka DNA, která by neobsahovala ani bodovou mutaci, ani deleci, což naznačuje, že mutace v těchto dvou kmenech nemohou být v stejný region.

Všimněte si, že ne všechny přechody mezi bodovým mutantem a del-2 poskytnou (+) rekombinanty; v tomto případě by divokou sekvenci zdědily pouze ty události křížení, které se vyskytnou mezi bodovým mutantem a 5 'koncem delece.