CspA mRNA 5 'UTR - CspA mRNA 5′ UTR
| cspA 5 'UTR | |
|---|---|
 Zachovaná sekundární struktura 5 'UTR cspA RNA | |
| Identifikátory | |
| Symbol | cspA 5'UTR |
| Rfam | RF01766 |
| Další údaje | |
| RNA typ | Cis-reg; Termoregulátor; |
| Domény | Enterobacteriales |
| PDB struktur | PDBe |
cspA mRNA 5 'UTR je nepřeložená oblast z cspA gen, což je důležité v chladný šok odpověď v Enterobacteriales jako E-coli. 5 'UTR prvek funguje jako RNA teploměr, regulující výraz z cspA v reakci na teplotu.[1] Regulací teploty plní proteiny cspA zásadní funkci homeostáza.
5 'UTR bylo poprvé podezření, že je významné, když mutace v této oblasti cspA významně zvýšila stabilitu přepisu v 37 ° C.[2]
Sekundární struktura cspA mRNA změny v reakci na teplotu; při 37 ° C je přepis nestabilní a méně efektivní přeloženo než při nižších teplotách.[3] Na rozdíl od jiných teploměrů RNA (např FourU ), sekundární struktura není závislá na tání a sponka do vlasů aby to ovlivnilo genová exprese. Místo toho při teplotách pod 20 ° C a cis-regulační oblast ncRNA v 5 'UTR z cspA představuje Sekvence Shine-Dalgarno a AUG spustit kodon do ribozom přístupnějším způsobem. Přesný mechanismus pro změnu konformace mRNA není znám.[1] Protein cspA je poté produkován ve významně větším množství a tvoří více než 2% buňky proteom během studeného šoku.[4] cspA protein se váže Hfq, která zvyšuje produkci sigma faktory které zprostředkovávají stresovou reakci.[5]
Viz také
Reference
- ^ A b Giuliodori AM, Di Pietro F, Marzi S a kol. (Leden 2010). „CspA mRNA je termosenzor, který moduluje translaci proteinu studeného šoku CspA“. Mol. Buňka. 37 (1): 21–33. doi:10.1016 / j.molcel.2009.11.033. PMID 20129052.
- ^ Yamanaka K, Mitta M, Inouye M (říjen 1999). "Mutační analýza 5 'nepřekládané oblasti mRNA cspA mRNA za studeného šoku Escherichia coli". J. Bacteriol. 181 (20): 6284–6291. PMC 103761. PMID 10515916. Citováno 2010-07-23.
- ^ Breaker RR (leden 2010). „RNA se přepíná v chladu“. Mol. Buňka. 37 (1): 1–2. doi:10.1016 / j.molcel.2009.12.032. PMC 5315359. PMID 20129048.
- ^ Brandi A, Spurio R, Gualerzi CO, Pon CL (březen 1999). „Masivní přítomnost„ hlavního proteinu studeného šoku “CspA v Escherichia coli za nestresových podmínek“. EMBO J.. 18 (6): 1653–1659. doi:10.1093 / emboj / 18.6.1653. PMC 1171252. PMID 10075935.
- ^ Hankins JS, Denroche H, Mackie GA (květen 2010). "Interakce proteinu Hfq vázajícího RNA s cspA mRNA kódující hlavní protein chladného šoku". J. Bacteriol. 192 (10): 2482–2490. doi:10.1128 / JB.01619-09. PMC 2863566. PMID 20233932. Citováno 2010-07-23.
Další čtení
- Goldstein J, Pollitt NS, Inouye M (leden 1990). „Protein Escherichia coli z bílého šoku“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (1): 283–287. Bibcode:1990PNAS ... 87..283G. doi:10.1073 / pnas.87.1.283. PMC 53247. PMID 2404279. Citováno 2010-07-23.
- Gualerzi CO, Giuliodori AM, Pon CL (srpen 2003). "Transkripční a post-transkripční kontrola genů studeného šoku". J. Mol. Biol. 331 (3): 527–539. doi:10.1016 / S0022-2836 (03) 00732-0. PMID 12899826.
- Narberhaus F, Waldminghaus T, Chowdhury S (leden 2006). "RNA teploměry". FEMS Microbiol. Rev. 30 (1): 3–16. doi:10.1111 / j.1574-6976.2005.004.x. PMID 16438677. Archivovány od originál dne 05.01.2013. Citováno 2010-07-23.
- De La Fuente, M .; Valera, S .; Martínez-Guitarte, J. L. (2012). „NcRNA a termoregulace: Pohled u prokaryot a eukaryot“. FEBS Dopisy. 586 (23): 4061–4069. doi:10.1016 / j.febslet.2012.10.018. PMID 23098758.