Kritické hodnocení predikce interakcí - Critical Assessment of Prediction of Interactions
Kritické hodnocení předvídání interakcí (CAPRI) je experiment v rámci celé komunity při modelování molekulární struktura z proteinové komplexy, jinak známý jako dokování protein – protein.
CAPRI[1] je pokračující řada událostí, ve kterých se vědci v celé komunitě pokoušejí ukotvit stejné proteiny, jaké poskytli hodnotitelé. Kola se konají přibližně každých šest měsíců. Každé kolo obsahuje jeden až šest komplexů cílových proteinů a proteinů, jejichž struktury byly nedávno stanoveny experimentálně. Souřadnice a jsou drženy soukromě hodnotiteli ve spolupráci s strukturní biologové kdo je určil. Experiment CAPRI je dvojitě zaslepený, v tom smyslu, že zadavatelé neznají řešenou strukturu a hodnotitelé neznají shodu mezi podáním a identitou jeho tvůrce.
Viz také
- Kritické hodnocení technik pro predikci struktury proteinů (CASP) - podobné cvičení v oblasti predikce struktury proteinů
- Kritické posouzení funkční anotace (CAFA)
Reference
- ^ Janin J, Henrick K, Moult J, Eyck LT, Sternberg MJ, Vajda S, Vakser I, Wodak SJ (2003). „CAPRI: kritické hodnocení předvídaných interakcí“. Proteiny. 52 (1): 2–9. CiteSeerX 10.1.1.461.3355. doi:10,1002 / prot.10381. PMID 12784359.
externí odkazy
Seznam předpovědních serverů účastnících se CAPRI
- ClusPro
- GRAMM-X
- FireDock
- HADDOCK - DOCKING protein – protein s vysokou nejednoznačností
- pyDockWEB - Strukturální predikce interakcí protein-protein
- PatchDock
- SmoothDock
- 3D zahrada - Globální a omezený dokovací průzkum Nexus
- SwarmDock
- DOCK / PIE
 | Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |