Chromozomové skoky - Chromosome jumping

Chromozomové skoky je nástroj molekulární biologie, který se používá ve fyzice mapování z genomy. Souvisí to s několika dalšími nástroji používanými pro stejný účel, včetně chůze chromozomů.

Chromozomové skoky se používají k obejití regionů, které jsou obtížné klon, jako jsou například ty, které obsahují opakující se DNA, které nelze snadno mapovat chůzí chromozomu, a je užitečné při rychlém pohybu po chromozomu při hledání konkrétního gen.

Chromozomální skákání umožňuje rychlejší pohyb skrz genom ve srovnání s jinými technikami, jako je chůze chromozomů, a lze je použít ke generování genomových markerů se známými chromozomálními místy.[1]

Skákání chromozomu umožňuje klonovat dva konce sekvence DNA bez střední části. Genomická DNA může být částečně štěpena pomocí restrikčních endonukleáz a pomocí DNA ligázy jsou fragmenty cirkularizovány.[2] Ze známého sekvence, a primer je navržen tak, aby sekvence přes kruhový spoj. Tento primer se používá ke skoku 100 kb Intervaly -300 kb: sekvence vzdálená 100 kb by se při cirkulaci přiblížila známé sekvenci. Sekvence, které nejsou dosažitelné chůzí chromozomu, tedy mohou být sekvenovány. Chromozomální chůzi lze použít k vyhledání z nové polohy skoku (v obou směrech) gen Sekvence podobné typu nebo další skoky lze použít k dalšímu postupu podél chromozomu.

Viz také

Reference

  1. ^ Drumm, Mitchell (květen 2001). Jednotka 5.4 Konstrukce skoků chromozomů a propojování knihoven v E. coli. Současné protokoly v lidské genetice. Kapitola 5. s. Jednotka 5.4. doi:10.1002 / 0471142905.hg0504s01. ISBN  978-0471142904. PMID  18428292.
  2. ^ Encyklopedie genetiky, genomiky, proteomiky a informatiky. Springer Nizozemsko. 2008-04-25. str.354. ISBN  978-1-4020-6753-2.