Cerato-platanin - Cerato-platanin

Cerato-platanin
Identifikátory
SymbolCerato-platanin
PfamPF07249
Pfam klanCL0199
InterProIPR010829

V molekulární biologii se cerato-platanin rodina bílkoviny zahrnuje fytotoxin cerato-platanin (CP) produkovaný Ascomycete Ceratocystis platani. CP homology se také nacházejí jak v Ascomycota, tak v Basidiomycota pobočky Dikarya.[1] Tento toxin způsobuje těžké nemoc rostlin: rakovina skvrna. Tento protein se vyskytuje v buněčná stěna z houba a podílí se na interakci hostitel-patogen a indukuje obě buňky nekróza a fytoalexin syntéza, která je jednou z prvních událostí souvisejících s obranou rostlin. CP, stejně jako jiné povrchové proteiny hub, se dokáže samo sestavit in vitro.[2] CP je 120 aminokyselina protein obsahující 40% hydrofobní zbytky. Je to jeden z mála příkladů bílkovin, ve kterém obsahuje a Hopfův odkaz.[3] Odkaz je tvořen kovalentními smyčkami - kousky páteř bílkovin zavřeno dvěma disulfidové vazby[4] (vytvořeno ze čtyř cystein zbytky). N-terminální oblast CP je velmi podobná cerato-ulminu, fytotoxickému proteinu produkovanému Ofiostom druh patřící k hydrofobin rodina, která se také sama sestavuje.[5]

Reference

  1. ^ Chen, Hongxin; Kovalchuk, Andriy; Keriö, Susanna; Asiegbu, Fred O. (20. ledna 2017). „Distribuce a bioinformatická analýza rodiny proteinů cerato-platanin v Dikaryi“. Mykologie. 105 (2013): 1479–1488. doi:10.3852/13-115. PMID  23928425. S2CID  23984426.
  2. ^ Sbrana F, Bongini L, Cappugi G, Fanelli D, Guarino A, Pazzagli L, Scala A, Vassalli M, Zoppi C, Tiribilli B (září 2007). „Mikroskopické snímky atomové síly naznačují agregační mechanismus v cerato-plataninu“ (PDF). Eur. Biophys. J. 36 (7): 727–32. doi:10.1007 / s00249-007-0159-x. PMID  17431609. S2CID  11585837.
  3. ^ Dabrowski-Tumanski, Pawel; Sulkowska, Joanna I. (2017-03-28). "Topologické uzly a vazby v proteinech". Sborník Národní akademie věd. 114 (13): 3415–3420. doi:10.1073 / pnas.1615862114. ISSN  0027-8424. PMC  5380043. PMID  28280100.
  4. ^ Pazzagli L, Cappugi G, Manao G, Camici G, Santini A, Scala A (srpen 1999). „Čištění, charakterizace a aminokyselinová sekvence cerato-plataninu, nového fytotoxického proteinu z Ceratocystis fimbriata f. Sp. Platani“. J. Biol. Chem. 274 (35): 24959–64. doi:10.1074 / jbc.274.35.24959. PMID  10455173.
  5. ^ Carresi L, Pantera B, Zoppi C, Cappugi G, Oliveira AL, Pertinhez TA, Spišská A, Scala A, Pazzagli L (říjen 2006). „Cerato-platanin, fytotoxický protein z Ceratocystis fimbriata: exprese v Pichia pastoris, čištění a charakterizace“. Protein Expr. Purif. 49 (2): 159–67. doi:10.1016 / j.pep.2006.07.006. PMID  16931046.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR010829