Cathy H. Wu - Cathy H. Wu
![]() | Tento životopisný článek je psáno jako životopis.Prosinec 2016) ( |
Cathy H. Wu | |
---|---|
Vědecká kariéra | |
Pole | Výpočetní biologie Biochemie Onkologie Bioinformatika |
Instituce | University of Delaware Georgetown University Medical Center |
Cathy H. Wu je předsedou Edwarda G. Jeffersona a profesorem a ředitelem Centra pro bioinformatiku a výpočetní biologii (CBCB) na University of Delaware. Je také ředitelkou Zdroj informací o bílkovinách (PIR) a výbor pro spolupráci na severovýchodě bioinformatiky a mimořádný profesor na Georgetown University Medical Center.[1]
raný život a vzdělávání
Wu je prostředním dítětem pěti dcer a synem v její rodině. Odpověděla nejlepšími známkami na Národní tchajwanská univerzita a ukázal smysl pro vědu, logiku a výpočty. Její otec byl letecký inženýr.[2] Promovala s BS v Patologie rostlin na Národní tchajwanská univerzita v roce 1978, a SLEČNA v patologii rostlin na Purdue University v roce 1982 a následně s PhD na stejné univerzitě v roce 1984. Poté obdržela a Postdoc vzdělání v oboru Molekulární biologie na Michiganská státní univerzita v roce 1986 a SLEČNA v Počítačová věda na University of Texas (UT) v Tyleru v roce 1989.[1]
Kariéra
V roce 1989 dokončila Wu diplomovou práci o používání umělých neuronových sítí ke klasifikaci proteinů. Její diplomový poradce George M. Witson III, předseda katedry informatiky v UT přijal ji poté, co ukončila studium v roce 1989. Poté učila informatiku jako odborná asistentka na katedře výpočetní techniky v UT Tyler v letech 1989 až 1994. Působila také jako odborná asistentka v letech 1990 až 1994, docentka v letech 1994 až 1998, a profesor v letech 1998 až 1999 na zdravotním středisku Biomathematics University of Texas v Tyleru. Prováděla výzkum na Vysoké škole zdravotnických věd UT Tyler pod epidemiologie a biomatematika profesor Jerry McClarty. Dirigovala bioinformatika výzkum z roku 1990 a vyvinuli několik systémů a databází klasifikace proteinů. Od roku 1999 také řídila velké softwarové a databázové projekty vedoucí v oblasti bioinformatiky Protein Information Resource (PIR) a od roku 2001 do roku 2002 se stala ředitelkou PIR a viceprezidentkou Národní nadace pro biomedicínský výzkum ve Washingtonu. , je profesorkou katedry Biochemie & Molecular Biology a ředitel PIR Georgetown University Medical Center (GUMC). V současné době působí také jako profesorka na katedře Onkologie a člen Komplexní onkologické centrum v Lombardi, GUMC od roku 2002. V roce 2009 byl Wu přijat na pozici předsedy bioinformatiky a výpočetní biologie Edwarda G. Jeffersona na University of Delaware (UD).[1][3]
Ocenění udělena
- Červenec 2012 až červen 2017 - 1144726, NSF / DGE, IGERT: Systémová biologie buněk v inženýrských prostředích (SBE2). Role: Co-PI
- Září 2011 až srpen 2015 - 2R01GM080646-06 a 3R01GM80646-07S1, NIH / NIGMS, PRO: Proteinová ontologie v otevřených biomedicínských ontologiích. Role: PI
- Červenec 2011 až červen 2015 - 1062520, NSF / DBI, ABI Development: Integrative Bioinformatics for Knowledge Discovery of PTM Networks. Role: PI
- Září 2011 až srpen 2014 - DOE / FOA-0000368, Experimental Systems-Biology Approaches for Clostridia-Based Bioenergy Production. Role: Co-PI
- Listopad 2009 až únor 2014 - 8P20GM103446, NIH / NIGMS, Delaware INBRE Role: hlavní ředitel bioinformatiky
- Srpna 2010 až 2013 - 1G08 LM010720-01, NIH / NLM, Linking Text Mining and Data Mining for Biomedical Knowledge Discovery. Role: PI
- Září 2010 až červenec 2013 - 1U41HG006104-01, NIH / NHGRI, UniProt: Centralizovaná sekvence proteinů a zdroj funkcí. Role: Co-PI
- Září 2009 až srpen 2012 - DBI-0850319, NSF / DBI, Propojení těžby textu s ontologií a systémovou biologií. Role: PI
- Červen 2011 až květen 2012 - 1137427, NSF / IIS, III: Small: Women in Bioinformatics Initiative at ACM BCB 2011. Role: Co-PI
- Září 2009 až duben 2012 - 3R01GM080646-04S2, NIH / NIGMS, Pro: A Protein Ontology in Open Biomedical Ontologies. Role: PI[4]
Knihy a publikace
Knihy
- Bioinformatika pro srovnávací proteomiku (metody v molekulární biologii), 19. listopadu 2010, autorka: Cathy H. Wu (redaktorka), Chuming Chen (redaktorka), ISBN 978-1607619765
- Výpočetní biologie a genomová informatika, Února 2003, autorky: Cathy H. Wu (autorka), Paul P. Wang (autorka), Jason T. L. Wang (redaktorka), ISBN 978-9812382573
- Neuronové sítě a genomová informatika, svazek 1 (Metody ve výpočetní biologii a biochemii), 5. října 2000, autor: C.H. Wu (redaktor), J.W. McLarty (redaktor), ISBN 978-0080428000[1]
Publikace
- UniProt: centrum pro informace o proteinech. Konsorcium UniProt. Nucleic Acids Res. 28. ledna; 43 (vydání databáze) (2015)
- Suzek, BE; Wang, Y; Huang, H; McGarvey, PB; Wu, CH (2014). „Klastry UniRef: komplexní a škálovatelná alternativa pro zlepšení vyhledávání podobnosti sekvencí“. Bioinformatika. 31 (6): 926–32. doi:10.1093 / bioinformatika / btu739. PMC 4375400. PMID 25398609.
- Natale, DA; Arighi, CN; Blake, JA; Bult, CJ; Christie, KR; Cowart, J; D'Eustachio, P; Diehl, AD; Drabkin, HJ; Helfer, O; Huang, H; Masci, AM; Ren, J; Roberts, NV; Ross, K; Ruttenberg, A; Shamovsky, V; Smith, B; Yerramalla, MS; Zhang, J; AlJanahi, A; Celen, já; Gan, C; Lv, M; Schuster-Lezell, E; Wu, CH (2014). „Proteinová ontologie: řízená strukturovaná síť proteinových entit“. Nucleic Acids Res. 42: D415–21. doi:10.1093 / nar / gkt1173. PMC 3964965. PMID 24270789.
- „Aktivity na univerzálním zdroji bílkovin (UniProt)“. Nucleic Acids Res. 42: D191–8. 2014. doi:10.1093 / nar / gkt1140. PMC 3965022. PMID 24253303.[3]
Reference
- ^ A b C d „Centrum pro bioinformatiku a výpočetní biologii“. Citováno 15. února 2015.
- ^ „Cathy Wu na křižovatce“. Citováno 15. února 2015.
- ^ A b „Protein Information Resource, Cahty H. Wu, Ph.D.“ Citováno 15. února 2015.
- ^ „University of Delaware Directory, Cathy Wu, Grant Awards“. Archivovány od originál dne 02.04.2015. Citováno 15. února 2015.