Carolyn J. Brown - Carolyn J. Brown

Carolyn J. Brown
Alma materUniversity of Guelph, BA
University of Toronto, PhD
Stanfordská Univerzita, PhD
Vědecká kariéra
PoleGenetika člověka, Epigenetika, X-inaktivace
Akademičtí poradciHunt Willard
webová stránkaWebová stránka laboratoře
Webová stránka univerzity

Carolyn J. Brown (narozen v roce 1961, Ontario ) je kanadský genetik a profesor na katedře lékařské genetiky u University of British Columbia. Brown je známá svými studiemi na Inaktivace X-chromozomu poté, co objevil člověka XIST gen v roce 1990.

Vzdělání a časná kariéra

Brown získala bakalářský titul v roce Genetika v roce 1983 od University of Guelph, Ontario. Svou disertační práci zahájila na University of Toronto v roce 1983 pod dohledem Hunt Willard, a uzavřel to na Stanfordská Univerzita, po přestěhování Willardovy laboratoře v roce 1989. Brown zahájil studie X chromozom v laboratoři a její disertační práce měla název „Studie deaktivace lidských X-chromozomů“. Její práce zahrnovala analýzu genů, které „unikají“ z inaktivace X-chromozomu, které jsou vyjádřeny z (jinak) neaktivního X chromozomu, stejně jako molekulární charakterizace centra X-inaktivace, genetického lokusu nezbytného pro umlčení chromozomu. Tato dvě témata se sblížila při objevu XIST gen, který se lokalizuje do centra X-inaktivace a je exprimován pouze z neaktivního X chromozomu. Tento objev byl zaznamenán ve dvou příspěvcích v roce Příroda v roce 1991.[1][2]

Willard označil Browna jako „kritického jedince, který transformoval studium inaktivace X“.[3] Brown se stal výzkumným spolupracovníkem v roce 1990 na Stanfordském oddělení genetiky a o dva roky později se přestěhoval s Willardovou laboratoří na oddělení genetiky Case Western Reserve University, Ohio, kde pokračovala ve studiu XIST dlouhé nekódující RNA. Brown se stal asistentem (1994) a docentem (1999) na Ústavu lékařské genetiky UK University of British Columbia, ve Vancouveru, a v roce 2004 byla povýšena na profesorku. V letech 2011 až 2014 byla vedoucí katedry. Ve své laboratoři dohlížela na více než dvacet postgraduálních studentů a postgraduálních studentů.

Výzkum

Brownův výzkum je zaměřen na Inaktivace X-chromozomu proces u lidí. Její laboratoř identifikovala kritické rozdíly mezi inaktivací myší a lidských X-chromozomů, jako je absence otcovské inaktivace X v lidských extraembryonálních tkáních, vyšší podíl lidských „uprchlíků“ a identifikace různých regulační sekvence lidského XIST a myší Xist.[4][5] Její laboratoř katalogizovala únikové geny pomocí exprese i Methylace DNA analýza r k určení, které geny přispívají k rozdílům mezi pohlavími v náchylnosti k chorobám a na které oblasti DNA jsou náchylné nebo rezistentní epigenetický umlčování genů.[6][7][8][9] Protože člověk embryonální kmenové buňky jsou epigeneticky nestabilní, Brown a jeho kolegové vyvinuli alternativní modelové systémy ke studiu lidské inaktivace, včetně indukovatelných transgenů XIST u člověka somatické buňky, člověče hybridy somatických buněk zachování aktivního nebo neaktivního X chromozomu a myší buňky s X-vazbou transgeny lidské DNA.[10] Její laboratoř spolupracuje s dalšími výzkumnými skupinami na Dětská nemocnice B. C. a BC Cancer Agency zkoumat klinický význam inaktivace a exprese vázané na X při predispozici onemocnění, progresi rakoviny a X-spojené nemoci, chromozomové přesmyky a aneuploidie.[11][12][13][14][15][16]

Ceny a vyznamenání

  • 1983-1987: NSERC Stipendium stého výročí 1967
  • 1988: Pre-doctoral Basic Science Presentation Award od Americká společnost lidské genetiky
  • 1995-2000: Stipendium MRC
  • 1999: Cena katederní pedagogiky
  • 2001: Early Career Scholar, Peter Wall Institute for Advanced Studies, UBC
  • 2008: UBC Killam Teaching Prize
  • 2018: čestná pobočka Canadian College of Medical Genetics

Reference

  1. ^ Brown, Carolyn J .; Ballabio, Andrea; Rupert, James L .; Lafreniere, Ronald G .; Grompe, Markus; Tonlorenzi, Rossana; Willard, Huntington F. (1991). „Gen z oblasti lidského inaktivačního centra X je exprimován výhradně z neaktivního chromozomu X“. Příroda. 349 (6304): 38–44. Bibcode:1991 Natur.349 ... 38B. doi:10.1038 / 349038a0. PMID  1985261.
  2. ^ Brown, Carolyn J .; Lafreniere, Ronald G .; Powers, Vicki E .; Sebastio, Gianfranco; Ballabio, Andrea; Pettigrew, Anjana L .; Ledbetter, David H .; Levy, Elaine; Craig, Ian W .; Willard, Huntington F. (1991). "Lokalizace inaktivačního centra X na lidském chromozomu X v Xq13". Příroda. 349 (6304): 82–84. Bibcode:1991 Natur.349 ... 82B. doi:10.1038 / 349082a0. PMID  1985270.
  3. ^ Willard, Huntington F. (2010). „Adresa Williama Allana za rok 2009: Život v pískovišti: Nedokončené podnikání“. American Journal of Human Genetics. 86 (3): 318–327. doi:10.1016 / j.ajhg.2010.01.037. PMC  2833390.
  4. ^ Yen, Z. C .; Meyer, I.M .; Karalic, S .; Brown, C. J. (2007). "Mezidruhové srovnání inaktivace X-chromozomů v Eutherii". Genomika. 90 (4): 453–63. doi:10.1016 / j.ygeno.2007.07.002. PMID  17728098.
  5. ^ Chang, S. C .; Brown, C. J. (2010). „Identifikace regulačních prvků lemujících lidský XIST odhaluje druhové rozdíly“. BMC Molekulární biologie. 11: 20. doi:10.1186/1471-2199-11-20. PMC  2841178. PMID  20211024.
  6. ^ Kutsche, R .; Brown, C. J. (2000). "Stanovení stavu deaktivace X-chromozomu pomocí X-vázaných exprimovaných polymorfismů identifikovaných prohledáváním databáze". Genomika. 65 (1): 9–15. doi:10,1006 / geno.2000.6153. PMID  10777660.
  7. ^ Cotton, A. M .; Lam, L .; Affleck, J. G .; Wilson, I. M .; Peñaherrera, M. S .; McFadden, D. E .; Kobor, M. S .; Lam, W. L .; Robinson, W. P .; Brown, C. J. (2011). „Analýza methylace DNA v celém chromozomu předpovídá inaktivaci X specifické pro lidskou tkáň“. Genetika člověka. 130 (2): 187–201. doi:10.1007 / s00439-011-1007-8. PMC  3132437. PMID  21597963.
  8. ^ Cotton, A. M .; Ge, B .; Light, N .; Adoue, V .; Pastinen, T .; Brown, C. J. (2013). „Analýza exprimovaných SNP identifikuje variabilní rozsah exprese z lidského neaktivního chromozomu X“. Genome Biology. 14 (11): R122. doi:10.1186 / gb-2013-14-11-r122. PMC  4053723. PMID  24176135.
  9. ^ Cotton, A. M .; Price, E. M .; Jones, M. J .; Balaton, B. P .; Kobor, M. S .; Brown, C. J. (2015). „Krajina methylace DNA na chromozomu X odráží hustotu CpG, funkční stav chromatinu a inaktivaci chromozomu X“. Lidská molekulární genetika. 24 (6): 1528–39. doi:10,1093 / hmg / ddu564. PMC  4381753. PMID  25381334.
  10. ^ Tinker, A. V .; Brown, C. J. (1998). "Indukce exprese XIST z lidského aktivního chromozomu X v hybridech myší / lidských somatických buněk pomocí demetylace DNA". Výzkum nukleových kyselin. 26 (12): 2935–40. doi:10.1093 / nar / 26.12.2935. PMC  147638. PMID  9611238.
  11. ^ Dawson, A. J .; Wickstrom, D.E .; Riordan, D .; Cardwell, S .; Casey, R .; Baldry, S .; Brown, C. (2004). "Unikátní pacient s variantou Ullrich-Turnerova syndromu a mozaikou pro malé r (X) a částečnou proximální duplikaci 1q". American Journal of Medical Genetics. Část A. 124A (3): 303–6. doi:10,1002 / ajmg.a.20302. PMID  14708105.
  12. ^ Gibb, E. A .; Vucic, E. A .; Enfield, K. S .; Stewart, G. L .; Lonergan, K. M .; Kennett, J. Y .; Becker-Santos, D. D .; MacAulay, C. E .; Lam, S .; Brown, C. J .; Lam, W. L. (2011). „Lidská rakovina, dlouhé nekódující RNA transkriptomy“. PLOS ONE. 6 (10): e25915. Bibcode:2011PLoSO ... 625915G. doi:10.1371 / journal.pone.0025915. PMC  3185064. PMID  21991387.
  13. ^ Cheung, K. J .; Johnson, N. A .; Affleck, J. G .; Severson, T .; Steidl, C .; Ben-Neriah, S .; Schein, J .; Morin, R. D .; Moore, R .; Shah, S. P .; Qian, H .; Paul, J. E.; Telenius, A .; Relander, T .; Lam, W .; Savage, K .; Connors, J. M .; Brown, C .; Marra, M. A .; Gascoyne, R. D .; Horsman, D. E. (2010). „Získané mutace TNFRSF14 ve folikulárním lymfomu jsou spojeny s horší prognózou“. Výzkum rakoviny. 70 (22): 9166–74. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-10-2460. PMID  20884631.
  14. ^ Johnson, N. A .; Al-Tourah, A .; Brown, C. J .; Connors, J. M .; Gascoyne, R. D .; Horsman, D. E. (2008). "Prognostický význam sekundárních cytogenetických změn ve folikulárních lymfomech". Geny, chromozomy a rakovina. 47 (12): 1038–48. doi:10,1002 / gcc.20606. PMID  18720523.
  15. ^ Hatakeyama, C .; Anderson, C. L .; Beever, C. L .; Peñaherrera, M. S .; Brown, C. J .; Robinson, W. P. (2004). „Dynamika vychýlení inaktivace X s věkem žen“. Klinická genetika. 66 (4): 327–32. doi:10.1111 / j.1399-0004.2004.00310.x. PMID  15355435.
  16. ^ Beever, C. L .; Stephenson, M. D .; Peñaherrera, M. S .; Jiang, R. H .; Kalousek, D. K .; Hayden, M .; Field, L .; Brown, C. J .; Robinson, W. P. (2003). „Šikmá inaktivace X-chromozomu je spojena s trizomií u žen zjištěnou na základě opakovaných spontánních potratů nebo chromozomálně abnormálních těhotenství“. American Journal of Human Genetics. 72 (2): 399–407. doi:10.1086/346119. PMC  379232. PMID  12497247.