Inhibitor karboxypeptidázy A. - Carboxypeptidase A inhibitor

Inhibitor karboxypeptidázy A.
PDB 4cpa EBI.jpg
rafinovaná krystalová struktura komplexu bramborových inhibitorů karboxypeptidázy a při rozlišení 2,5 angstromů
Identifikátory
Symbol?
PfamPF02977
Pfam klanCL0096
InterProIPR004231
SCOP24cpa / Rozsah / SUPFAM

V molekulární biologii se inhibitor karboxypeptidázy A rodina je rodina proteinů, kterou představuje dobře charakterizovaná metalokarboxypeptidáza Inhibitor (MCPI) z brambor, který patří do rodiny inhibitorů MEROPS I37, klan IE. To inhibuje metalopeptidázy patřící do rodiny peptidů MEROPS M14, karboxypeptidáza A. v Russet Burbank brambory, je to směs přibližně stejného množství dvou polypeptid řetězce obsahující 38 nebo 39 aminokyselina zbytky. Řetězy se liší svými amino terminál pouze sekvence [1] a jsou odolné vůči fragmentaci proteázy.[2] The struktura z komplex mezi hovězí karboxypeptidáza A a inhibitor karboxypeptidázy A s 39 aminokyselinami z brambor byl stanoven na 2,5-Angstrom rozlišení.[3]

The brambor Inhibitor je syntetizován jako prekurzor, který má N-koncový signální peptid s 29 aminokyselinami, pro-peptid s 27 aminokyselinami, zralý inhibiční region s 39 aminokyselinami a C-terminální prodloužení se 7 aminokyselinami. C-koncová extenze o 7 aminokyselinách se podílí na inaktivaci inhibitoru a může být nutná pro zacílení na vakuola kde se akumuluje zralý aktivní inhibitor.[4]

N-koncová oblast a zralý inhibitor jsou slabě příbuzné ostatním solný bílkoviny nalezené v této rodině, z brambor, rajčat a slepice, které byly nesprávně popsány jako metalokarboxypeptidáza inhibitory.[5]

Reference

  1. ^ Hass GM, Nau H, Biemann K, Grahn DT, Ericsson LH, Neurath H (březen 1975). "Aminokyselinová sekvence inhibitoru karboxypeptidázy z brambor". Biochemie. 14 (6): 1334–42. doi:10.1021 / bi00677a036. PMID  1122280.
  2. ^ Leary TR, Grahn DT, Neurath H, Hass GM (květen 1979). „Struktura inhibitoru bramborové karboxypeptidázy: párování disulfidů a expozice aromatických zbytků“. Biochemie. 18 (11): 2252–6. doi:10.1021 / bi00578a018. PMID  444453.
  3. ^ Rees DC, Lipscomb WN (srpen 1980). „Struktura komplexu bramborových inhibitorů karboxypeptidázy A v rozlišení 2,5-A“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 77 (8): 4633–7. doi:10.1073 / pnas.77.8.4633. PMC  349899. PMID  6933511.
  4. ^ Villanueva J, Canals F, Prat S, Ludevid D, Querol E, Aviles FX (listopad 1998). "Charakterizace rány indukovaného inhibitoru metalokarboxypeptidázy z brambor. CDNA sekvence, indukce genové exprese, subcelulární imunolokalizace a potenciální role C-koncového propeptidu". FEBS Lett. 440 (1–2): 175–82. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 01447-1. PMID  9862450.
  5. ^ Molnár A, Lovas A, Banfalvi Z, Lakatos L, Polgar Z, Horvath S (červen 2001). „Tkáňově specifické signály aktivují promotor genové rodiny inhibitoru metalokarboxypeptidázy v hlízách brambor a bobulích“. Plant Mol. Biol. 46 (3): 301–11. doi:10.1023 / A: 1010649503229. PMID  11488477. S2CID  27506112.

externí odkazy

Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR004231