Překladový prvek nezávislý na čepici - Cap-independent translation element

V molekulární biologii, a překladový prvek nezávislý na čepici (UVÉST nebo 3'CITE) je RNA sekvence nalezen v 3'UTR z mnoha RNA rostlina viry.

Eukaryotický mRNA obsahovat a Struktura 5 'čepice který je vyžadován pro efektivní navázání faktory iniciace překladu. Mnoho virových mRNA postrádá 5 'víčko, zvířecí virové mRNA často obsahují interní místo vstupu ribozomu který funguje při zahájení překladu. Mnoho rostlinných virových mRNA obsahuje translační prvek nezávislý na víčku.^[1] Tyto prvky zprostředkovávají iniciaci překlad z bílkoviny kódován v mRNA buď náborem iniciačních faktorů translace, nebo Ribosomální podjednotka 60S k virové RNA.^[2] V RNA2 z Virus nekrotické mozaiky červeného jetele (RCNMV) je pro syntézu RNA s negativním řetězcem vyžadován translační prvek nezávislý na čepici.^[3]

Existuje mnoho různých strukturálních tříd elementu nezávislého na překladu bez zjevné strukturální nebo sekvenční podobnosti:^[1]^[2]

Struktura	Ukázkové druhy
TED (doména zesilovače překladu)	Satelitní virus nekrózy tabáku (STNV)
BTE (překladový prvek podobný BYDV)	Virus žlutého trpaslíka (BYDV)
PTE (PMV-like translation element)	Virus mozaiky panicum (PMV)
TSS (struktura ve tvaru T)	Virus řepky (TCV)
Ve tvaru Y.	Rajčatový hustý kousek viru (TBSV)
Ve tvaru I.	Virus nekrotické pruhy kukuřice (MNeSV)

Viz také

Luteovirus cap-independent translation element (BTE)

Další čtení

Nicholson, BL; Zaslaver, O; Mayberry, LK; Browning, KS; White, KA (únor 2013). „Tombusvirus Y-Shaped Translational Enhancer Forms a Complex with eIF4F and can be be funkčně nahrazen Heterologous Transal Enhancers“. Journal of Virology. 87 (3): 1872–1883. doi:10.1128 / JVI.02711-12. PMC 3554133. PMID 23192876.

Reference

^ ^A ^b Miller, WA; Wang, Z; Treder, K (prosinec 2007). „Úžasná rozmanitost translačních prvků nezávislých na čepici ve 3'-nepřekládaných oblastech rostlinných virových RNA“. Transakce biochemické společnosti. 35 (Pt 6): 1629–1633. doi:10.1042 / BST0351629. PMC 3081161. PMID 18031280.
^ ^A ^b Nicholson, BL; White, KA (listopad 2011). "3 'Zesilovače nezávislé na translaci rostlinných virů s pozitivním řetězcem RNA". Aktuální názor na virologii. 1 (5): 373–380. doi:10.1016 / j.coviro.2011.10.002. PMID 22440838.
^ An, M; Iwakawa, HO; Důl, A; Kaido, M; Mise, K; Okuno, T (15. září 2010). „Struktura RNA ve tvaru Y v 3 'nepřekládané oblasti spolu s trans-aktivátorem a jádrovým promotorem viru RNA2 nekrotické mozaiky červeného jetele je nutná pro syntézu RNA s negativním řetězcem“ (PDF). Virologie. 405 (1): 100–109. doi:10.1016 / j.virol.2010.05.022. PMID 20561661.

[a1-1] A ^b Miller, WA; Wang, Z; Treder, K (prosinec 2007). „Úžasná rozmanitost translačních prvků nezávislých na čepici ve 3'-nepřekládaných oblastech rostlinných virových RNA“. Transakce biochemické společnosti. 35 (Pt 6): 1629–1633. doi:10.1042 / BST0351629. PMC 3081161. PMID 18031280.

[a2-2] A ^b Nicholson, BL; White, KA (listopad 2011). "3 'Zesilovače nezávislé na translaci rostlinných virů s pozitivním řetězcem RNA". Aktuální názor na virologii. 1 (5): 373–380. doi:10.1016 / j.coviro.2011.10.002. PMID 22440838.

[3] An, M; Iwakawa, HO; Důl, A; Kaido, M; Mise, K; Okuno, T (15. září 2010). „Struktura RNA ve tvaru Y v 3 'nepřekládané oblasti spolu s trans-aktivátorem a jádrovým promotorem viru RNA2 nekrotické mozaiky červeného jetele je nutná pro syntézu RNA s negativním řetězcem“ (PDF). Virologie. 405 (1): 100–109. doi:10.1016 / j.virol.2010.05.022. PMID 20561661.

[1]

[2]

[3]