Potlačení CG - CG suppression

Jak methylace CpG míst následovaná spontánní deaminací vede k nedostatku CpG míst v methylované DNA. Výsledkem je, že v oblastech, kde je methylace vzácná, vznikají zbytkové ostrovy CpG a stránky CpG se drží.

Potlačení CG je termín pro fenomén, který CG dinukleotidy jsou ve většině částí města velmi neobvyklé obratlovců genomy.

V dospělých somatických tkáních mohou být zbytky cytosinu methylovaný, a k tomu dochází téměř výlučně v symetrickém kontextu CpG.^[1] Methylované zbytky C spontánně deaminují za vzniku zbytků T; proto CpG dinukleotidy stabilně mutují na TpG dinukleotidy, což vede k nedostatečnému zastoupení CpG dinukleotidů v lidském genomu (vyskytují se pouze na 21% očekávané frekvence).^[2] (Na druhou stranu, spontánní deaminace nemetylovaných zbytků C vede ke zbytkům U, mutaci, která je buňkou rychle rozpoznána a opravena).

v člověk a myš, CG jsou nejméně časté dinukleotid, tvoří méně než 1% všech dinukleotidů. GC jsou druhé nejběžnější a tvoří více než 4% všech dinukleotidů, takže CG jsou více než čtyřnásobně méně časté než všechny ostatní dinukleotidy.

Viz také

• CpG ostrov

Reference