CALCOCO2 - CALCOCO2

CALCOCO2
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3VVV, 3VVW, 4GXL, 4HAN, 2MXP, 4XKL
Identifikátory
Aliasy	CALCOCO2, NDP52, vazba vápníku a doména coiled-coil 2
Externí ID	OMIM: 604587 HomoloGene: 31339 Genové karty: CALCOCO2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	48,866,522 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita homodimerizace proteinu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • perinukleární oblast cytoplazmy; • autofagozom; • autofagosomová membrána; • cytoskelet; • membrána; • cytoplazmatický váček; • buněčné jádro; • intracelulární membránou vázaná organela; • cytosol;
Biologický proces	• autofagie; • GO: virový proces 0022415; • pozitivní regulace dozrávání autofagosomu; • reakce na interferon-gama; • xenofágie;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10241
	n / a
	ENSG00000136436
	n / a
	Q13137
	n / a
	NM_001261390; NM_001261391; NM_001261393; NM_001261395; NM_005831
	n / a
	NP_001248319; NP_001248320; NP_001248322; NP_001248324; NP_005822
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Protein vázající vápník a navinutá cívka na doménu 2 je protein že u lidí je kódován CALCOCO2 gen.^[3]^[4]

Protein kódovaný tímto genem je podjednotkou těl jaderné domény 10 (ND10). Těla ND10 jsou jaderné domény, které se imunohistochemicky objevují jako deset teček na jádro. Oni jsou věřil být spojován s jaderná matice na základě jejich odporu vůči nukleáza trávení a extrakce solí. ND10 proteiny jsou odstraněny z jádra pomocí HSV-1 infekce a může hrát roli ve virových životních cyklech.^[4]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136436 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Korioth F, Gieffers C, Maul GG, Frey J (červenec 1995). „Molekulární charakterizace NDP52, nového proteinu jaderné domény 10, který se redistribuuje po virové infekci a léčbě interferonem“. J Cell Biol. 130 (1): 1–13. doi:10.1083 / jcb.130.1.1. PMC 2120522. PMID 7540613.
^ ^A ^b „Entrez Gene: vazba vápníku CALCOCO2 a doména coiled-coil 2“.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Sternsdorf T, Jensen K, Züchner D, Will H (1997). "Buněčná lokalizace, exprese a struktura jaderného tečkového proteinu 52". J. Cell Biol. 138 (2): 435–48. doi:10.1083 / jcb.138.2.435. PMC 2138200. PMID 9230084.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Florin L, Schäfer F, Sotlar K a kol. (2002). "Reorganizace jaderné domény 10 indukovaná papilomavirovým kapsidovým proteinem l2". Virologie. 295 (1): 97–107. doi:10.1006 / viro.2002.1360. PMID 12033769.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Di Y, Li J, Zhang Y a kol. (2004). „Protein HCAP1 asociovaný s HCC, varianta GEMIN4, interaguje s proteiny se zinkovým prstem“. J. Biochem. 133 (6): 713–8. doi:10.1093 / jb / mvg091. PMID 12869526.
Everett RD, Sourvinos G, Leiper C a kol. (2004). „Tvorba jaderných ložisek regulačního proteinu viru herpes simplex typu 1 ICP4 v časných dobách infekce: lokalizace, dynamika, nábor ICP27 a důkazy de novo indukce komplexů podobných ND10“. J. Virol. 78 (4): 1903–17. doi:10.1128 / JVI.78.4.1903-1917.2004. PMC 369473. PMID 14747555.
Colland F, Jacq X, Trouplin V a kol. (2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Morriswood B, Ryzhakov G, Puri C a kol. (2007). „T6BP a NDP52 jsou vazební partneři myosinu VI s potenciální rolí v signalizaci cytokinů a adhezi buněk“. J. Cell Sci. 120 (Pt 15): 2574–85. doi:10.1242 / jcs.007005. PMC 2621013. PMID 17635994.

externí odkazy

CALCOCO2 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
CALCOCO2 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136436 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7540613-3] Korioth F, Gieffers C, Maul GG, Frey J (červenec 1995). „Molekulární charakterizace NDP52, nového proteinu jaderné domény 10, který se redistribuuje po virové infekci a léčbě interferonem“. J Cell Biol. 130 (1): 1–13. doi:10.1083 / jcb.130.1.1. PMC 2120522. PMID 7540613.

[entrez-4] A ^b „Entrez Gene: vazba vápníku CALCOCO2 a doména coiled-coil 2“.

[1]

[2]

[3]

[4]