BioKreativa - BioCreative

BioKREATIVITA Kritické hodnocení metod dolování textu v systému Windows molekulární biologie ) spočívá v celospolečenském úsilí o hodnocení extrakce informací a dolování textu vývoj v biologické doméně.[1]

Při první výzvě BioCreAtIvE byly položeny tři hlavní úkoly: úkol extrakce entit,[2] úkol normalizace genového jména,[3][4] a funkční anotace úkolu genových produktů.[5] Datové soubory vytvořené v této soutěži slouží jako tréninková a testovací sada Zlatého standardu pro hodnocení a školení nástrojů Bio-NER a nástrojů pro extrakci anotací.

Druhý BioCreAtIvE zahrnoval tři úkoly organizované Lynette Hirschman a Alex Morgan z MITER; Alfonso Valencia a Martin Krallinger CNIO ve Španělsku; a W. John Wilbur, Lorrie Tanabe a Larry Smith z NIH.

BioCreative V bude mít 5 různých skladeb, popsaných na:https://biocreative.bioinformatics.udel.edu/events/biocreative-v/CFP/

Viz také

Reference

  1. ^ Hirschman, L .; Yeh, A .; Blaschke, C .; Valencia, A. (2005). "Přehled BioCreAtIvE: Kritické hodnocení extrakce informací pro biologii". BMC bioinformatika. 6: S1. doi:10.1186 / 1471-2105-6-S1-S1. PMC  1869002. PMID  15960821.
  2. ^ Yeh, A .; Morgan, A .; Colosimo, M .; Hirschman, L. (2005). „BioCreAtIvE Úkol 1A: Gene uveďte hodnocení nálezu“. BMC bioinformatika. 6: S2. doi:10.1186 / 1471-2105-6-S1-S2. PMC  1869012. PMID  15960832.
  3. ^ Hirschman, L .; Colosimo, M .; Morgan, A .; Yeh, A. (2005). "Přehled úlohy 1C BioCreAtIvE: Normalizované seznamy genů". BMC bioinformatika. 6: S11. doi:10.1186 / 1471-2105-6-S1-S11. PMC  1869004. PMID  15960823.
  4. ^ Colosimo, M. E.; Morgan, A. A .; Yeh, A. S .; Colombe, J. B .; Hirschman, L. (2005). „Příprava dat a dohoda interannotator: BioCreAtIvE Task 1B“. BMC bioinformatika. 6: S12. doi:10.1186 / 1471-2105-6-S1-S12. PMC  1869005. PMID  15960824.
  5. ^ Blaschke, C .; Leon, E .; Krallinger, M .; Valencia, A. (2005). „Hodnocení hodnocení BioCreAtIvE úkolu 2“. BMC bioinformatika. 6: S16. doi:10.1186 / 1471-2105-6-S1-S16. PMC  1869008. PMID  15960828.

externí odkazy