Rodina antiporterů základních aminokyselin - Basic amino acid antiporter family

The Rodina základních aminokyselinových antiporterů (ArcD) (TC # 2.A.118) je složkou IT nadčeleď.[1][2][3] Tato rodina se skládá z proteinů z Gramnegativní a Grampozitivní bakterie (např., Streptococcus, Escherichia, Salmonella, Fusobacterium a Borrelia druh). Proteiny mají délku přibližně 480 aminoacylových zbytků (aas) a mají 10 až 12 domnělých transmembránových segmentů (TMS). Funkčně charakterizované homology jsou v DcuC (TC # 2.A.61 ) a ArsB (TC # 2.A.4 ) rodiny. Někteří členové rodiny pravděpodobně katalyzují antiport arginin / ornithin nebo citrulin / ornithin.[4][5]

Viz také

Reference

  1. ^ Lolkema, Juke S .; Slotboom, Dirk Jan (11.04.2003). „Klasifikace 29 rodin sekundárních transportních proteinů do jedné strukturní třídy pomocí analýzy profilu hydropatie“ (PDF). Journal of Molecular Biology. 327 (5): 901–909. doi:10.1016 / s0022-2836 (03) 00214-6. ISSN  0022-2836. PMID  12662917.
  2. ^ Prakash, Shraddha; Cooper, Garret; Singhi, Soumya; Saier, Milton H. (2003-12-03). „Nadrodina iontových transportérů“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembrány. 1618 (1): 79–92. doi:10.1016 / j.bbamem.2003.10.010. ISSN  0006-3002. PMID  14643936.
  3. ^ Rabus, R .; Jack, D. L .; Kelly, D. J .; Saier, M. H. (01.12.1999). „TRAP transportéry: prastará rodina sekundárních aktivních transportérů závislých na extracytoplazmatickém rozpustném receptoru“. Mikrobiologie. 145 (Pt 12) (12): 3431–3445. doi:10.1099/00221287-145-12-3431. ISSN  1350-0872. PMID  10627041.
  4. ^ Gupta, Radha; Yang, červen; Dong, Yimin; Swiatlo, Edwin; Zhang, Jing-Ren; Metzger, Dennis W .; Bai, Guangchun (01.10.2013). „Odstranění arcD u Streptococcus pneumoniae D39 zhoršuje jeho pouzdro a tlumí virulenci“. Infekce a imunita. 81 (10): 3903–3911. doi:10.1128 / IAI.00778-13. ISSN  1098-5522. PMC  3811789. PMID  23918778.
  5. ^ Rimaux, Tom; Rivière, Audrey; Hebert, Elvira María; Mozzi, Fernanda; Weckx, Stefan; De Vuyst, Luc; Leroy, Frédéric (01.04.2013). „Putativní transportní protein je zapojen do vylučování a zpětného vychytávání citrulinu během aktivity dráhy argininiminiminázy u Lactobacillus sakei“. Výzkum v mikrobiologii. 164 (3): 216–225. doi:10.1016 / j.resmic.2012.11.004. ISSN  1769-7123. PMID  23178175.

Do tato úprava, tento článek používá obsah z „2.A.118 Základní rodina aminokyselinových antiporterů (ArcD)“, který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.