Bacilladnaviridae - Bacilladnaviridae
| Bacilladnaviridae | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Monodnaviria |
| Království: | Shotokuvirae |
| Kmen: | Cressdnaviricota |
| Třída: | Arfiviricetes |
| Objednat: | Baphyvirales |
| Rodina: | Bacilladnaviridae |
Bacilladnaviridae je rodina jednovláknové DNA viry které primárně infikují rozsivky.[1][2]
Vlastnosti
Genom těchto virů se jeví jako jedinečný. Skládá se z jediné molekuly kovalentně uzavřené kruhové jednořetězcové DNA o velikosti 4,5–6 kilobází a ze segmentu lineární ssDNA o velikosti asi 1 kilobáze. Lineární segment je komplementární k části uzavřeného kruhu a vytváří tak částečně dvouvláknovou oblast. V genomu jsou alespoň tři hlavní otevřené čtecí rámce.
Podobně jako u jiných eukaryotických virů ssDNA je pravděpodobné, že bacilladnaviry replikují své genomy mechanismem klouzavého kruhu, který je iniciován virovou kódovanou endonukleázou (Rep). Posledně uvedený protein bacilladnavirů však vykazuje jedinečné konzervované motivy a ve fylogenetických stromech tvoří monofyletický clade oddělený od ostatních skupin ssDNA virů. Kapsidový protein bacilladnavirů má skládací želé a nejtěsněji souvisí s odpovídajícími proteiny členů rodiny Nodaviridae, které mají ssRNA genomy.[3]
Viriony mají průměr asi 34 nanometrů (nm) a hromadí se v jádře. Zralé viriony se uvolňují lýzou hostitelské buňky.
Taxonomie
Rozpoznávají se tyto rody:
- Diatodnavirus, jeden druh; druh druhu: Chaetoceros diatodnavirus 1
- Kieseladnavirus, jeden druh; druh druhu: Kieseladnavirus spojený s ústí řeky Avon-Heathcote
- Protobacilladnavirus, 7 druhů; druh druhu: Chaetoceros protobacilladnavirus 1
Reference
- ^ „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 25. dubna 2020.
- ^ Tomaru, Y; Takao, Y; Suzuki, H; Nagumo, T; Koike, K; Nagasaki, K (2011). „Izolace a charakterizace jednovláknového viru DNA infikujícího Chaetoceros lorenzianus Grunow“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 77 (15): 5285–5293. doi:10.1128 / AEM.00202-11. PMC 3147440. PMID 21666026.
- ^ Kazlauskas, D; Dayaram, A; Kraberger, S; Goldstien, S; Varsani, A; Krupovic, M (2017). „Evoluční historie bacilladnavirů ssDNA je charakteristická horizontálním získáváním kapsidového genu z nodavirů ssRNA“. Virologie. 504: 114–121. doi:10.1016 / j.virol.2017.02.001. PMID 28189969.