BLUPF90 - BLUPF90

The BLUPF90 rodina programů je statistický softwarový balíček používaný v kvantitativní genetika pro zvíře a pěstování rostlin.[1][2] To se vejde smíšené modely použitím omezená maximální věrohodnost stejně jako Gibbsův odběr vzorků odhadnout složky odchylek a předpovědět hodnoty rozmnožování pomocí nejlepší lineární nezaujatá předpověď (BLUP).

Kódováno Fortran, může hrát genomický výběr na stovkách tisíc genotypizovaný Jednotlivci.[3]

Zkompilované verze BLUPF90 jsou volně dostupné pro výzkum a lze je použít na GNU / Linux, Microsoft Windows a Mac OS X.[4][5] Existuje také doplněk k R (programovací jazyk).[6]

Reference

  1. ^ Misztal, Ignacy (1999). „Složité modely, více dat: jednodušší programování?“. Bulletin Interbull. 20: 33–42.
  2. ^ Misztal, I; Tsuruta, S; Strabel, T; Auvray, B; Druet, T; Lee, DH (2002). BLUPF90 a související programy (BGF90). 7. světový kongres o genetice aplikované na živočišnou výrobu. Montpellier, Francie.
  3. ^ Aguilar, I; Misztal, I; Tsuruta, S; Legarra, A; Wang, H (2014). PREGSF90 - POSTGSF90: Výpočtové nástroje pro implementaci jednokrokové genomické selekce a genomové asociace s negenotypovanými jedinci v programech BLUPF90 (PDF). 10. světový kongres genetiky aplikovaný na živočišnou výrobu. Americká společnost pro vědu o zvířatech, Champaign, IL.
  4. ^ http://nce.ads.uga.edu/software/
  5. ^ http://nce.ads.uga.edu/wiki/doku.php?id=start
  6. ^ https://famuvie.github.io/breedR/

externí odkazy