BED zinkový prst - BED zinc finger
zf-BED | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Struktura roztoku domény zinkového prstu BED domény se zinkovým prstem obsahující protein 1 | |||||||||
Identifikátory | |||||||||
Symbol | zf-BED | ||||||||
Pfam | PF02892 | ||||||||
Pfam klan | CL0361 | ||||||||
InterPro | IPR003656 | ||||||||
|
V molekulární biologii Doména se zinkovým prstem typu BED je proteinová doména který byl pojmenován po Drosophila bílkoviny BÝTAF a DREF, se nachází v jedné nebo více kopiích v buněčný regulační faktory a transpozázy z rostlin, zvířata a houby. BED prst je asi 50 až 60 aminokyselina zbytky doména, která obsahuje charakteristický motiv se dvěma vysoce konzervativní aromatické pozice, stejně jako sdílený vzorec cysteiny a histidiny o kterém se předpokládá, že vytvoří zinkový prst. Protože různé prsty BED jsou schopné vázat DNA, bylo navrženo, že vazba DNA je obecnou funkcí této domény.[1] Některé proteiny, o nichž je známo, že obsahují BED doménu, zahrnují zvířecí, rostlina a houby AC1 a hobosovité transpozázy; Caenorhabditis elegans Dpy-20 protein, předpokládaný kutikulární gen transkripční regulátor; Drosophila BEAF (faktor spojený s hraničním prvkem), o kterém se předpokládá, že se podílí na izolaci chromatinu; Drosophila DREF, transkripční regulátor pro geny S-fáze; a tabák 3AF1 a rajče E4 / E8-BP1, proteiny vázající DNA regulované světlem a ethylenem, které obsahují dva prsty BED. Předpokládá se, že většina genů v této rodině se vyvinula z čepice rodina Transpozony DNA.[2]
Viz také
Reference
- ^ Aravind L (září 2000). „Prst BED, nová doména vázající DNA v proteinech a transpozázách vázajících chromatin-hraniční prvky.“. Trendy v biochemických vědách. 25 (9): 421–3. doi:10.1016 / s0968-0004 (00) 01620-0. PMID 10973053.
- ^ Hayward, Alexander; Ghazal, Awaisa; Andersson, Göran; Andersson, Leif; Jern, Patric; Robinson-Rechavi, Marc (22. března 2013). „Evoluce ZBED: Opakované využití transpozonů DNA jako regulátorů různých funkcí hostitele“. PLOS ONE. 8 (3): e59940. doi:10,1371 / journal.pone.0059940. PMC 3606216. PMID 23533661.