Auxin vázající protein - Auxin binding protein

Auxin vázající protein
PDB 1lrh EBI.jpg
krystalová struktura proteinu vázajícího auxin v komplexu s kyselinou 1-naftalen-octovou
Identifikátory
SymbolAuxin_BP
PfamPF02041
Pfam klanCL0029
InterProIPR000526
SCOP21lr5 / Rozsah / SUPFAM

V molekulární biologii se protein vázající auxin rodina je rodina proteinů, které se vážou auxin.[1] Jsou umístěny v lumen z endoplazmatické retikulum (ER). The primární struktura těchto proteinů obsahuje N-terminál hydrofobní vedoucí sekvence 30-40 aminokyselin, která by mohla představovat signál pro translokaci proteinu do ER.[2][3] Zralý protein obsahuje přibližně 165 zbytků a obsahuje řadu potenciálních látek N-glykosylace stránky. In vitro doprava studie prokázaly kotranslační glykosylaci.[3] Retence v lumenu ER koreluje s dalším signálem umístěným na C konci, představovaným sekvence Lys-Asp-Glu-Leu, o kterém je známo, že je odpovědný za prevenci vylučování z bílkoviny z lumen ER v eukaryotický buňky.[2][3]

Reference

  1. ^ Woo EJ, Marshall J, Bauly J, Chen JG, Venis M, Napier RM a kol. (2002). "Krystalová struktura proteinu vázajícího auxin 1 v komplexu s auxinem". EMBO J.. 21 (12): 2877–85. doi:10.1093 / emboj / cdf291. PMC  126050. PMID  12065401.
  2. ^ A b Hesse T, Feldwisch J, Balshusemann D, Bauw G, Puype M, Vandekerckhove J, Lobler M, Klambt D, Schell J, Palme K (září 1989). „Molekulární klonování a strukturní analýza genu ze Zea mays (L.) kódujícího domnělý receptor pro rostlinný hormon auxin“. EMBO J.. 8 (9): 2453–61. PMC  401229. PMID  2555179.
  3. ^ A b C Palme K, Hesse T, Campos N, Garbers C, Yanofsky MF, Schell J (únor 1992). „Molekulární analýza genu proteinu vázajícího auxin umístěného na chromozomu 4 Arabidopsis“. Rostlinná buňka. 4 (2): 193–201. doi:10,1105 / tpc.4.2.193. PMC  160120. PMID  1321684.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR000526