Alishewanella fetalis - Alishewanella fetalis
Alishewanella fetalis | |
---|---|
A. fetalis pěstované na BHI agarové plotně vizualizované pomocí transmisní elektronová mikroskopie | |
Vědecká klasifikace | |
Doména: | |
Kmen: | |
Třída: | |
Objednat: | |
Rodina: | |
Rod: | |
Druh: | A. fetalis |
Binomické jméno | |
Alishewanella fetalis Fonnesbech Vogel a kol. 2000[1] |
Rod Alishewanella je jednou z hlavních větví rodiny Alteromonadaceae. Bylo navrženo ubytování A. fetalis, izolovaný z pitvy lidského plodu, v roce 2000.[2] V roce 2009, A. aestuarii byl izolován z přílivového plochého sedimentu a označen jako zástupce Alishewanella.[3] Třetí Alishewanella druh byl izolován z gajami sikhae, a korejština fermentované potraviny, v roce 2009 a dostalo jméno A. jeotgali.[2] Nejnověji, v roce 2010, čtvrtý v současné době izolovaný druh Alishewanella, A. agri, byl izolován ze skládkové půdy v Korea.[4] V současné době jsou to pouze čtyři izolované a charakterizované druhy rodu Alishewanella.
Identifikace
Alishewanella fetalis je gramnegativní, nepohyblivý, fakultativně anaerobní, tyčový bakterie. Tyto tyče mají délku asi 2 μm a šířku 0,5-1 μm. Obvykle se vyskytují jako jedna buňka.[5] Zpočátku byl nesprávně označen jako Shewanella putrefaciens, dříve známé jako Pseudomonas putrefaciens, kvůli přítomnosti podobných mastné kyseliny[5] ve své membráně lipidy. Po dalším vyhodnocení však bylo zjištěno, že se jedná o nový druh. Kvůli příbuznosti k Shewanella, rod byl pojmenován Alishewanella. Také poté, co byl původně izolován z pitva lidského plodu v roce 1992 v Švédsko, dostal název druhu fetalis.[5]
Růst
A. fetalis roste při teplotách mezi 25 ° a 42 ° C, s optimálním růstem při 37 ° C. Nemůže růst pod 20 ° C.[5] Je fakultativně anaerobní a může využívat akceptory elektronů, jako je trimethylaminoxid (TMAO), dusičnan, dusitany, a thiosíran, ale ne siřičitan nebo železité železo.[6] Je nejen halotolerantní, ale pro svůj růst vyžaduje NaCl. Tolerují se koncentrace NaCl až 8%, ale ne 10%.[5] A. fetalis je oxidáza - a kataláza -pozitivní, ale neprodukuje indol a β-galaktosidáza. Nemůže kvasit sacharidy.[5] Podle těchto výsledků A. fetalis velmi úzce souvisí s oběma Shewanella putrefaciens a Řasy Shewanella.[5] Nicméně, A. fetalis se liší od Shewanella rod schopností produkovat H2S.[5]
Genom
Studie z A. fetalis ukázat, že Obsah GC genomu je 50,6%,[6] který se velmi liší od toho Shewanella putrefaciens, s Obsah GC 42-47%.[5] Ukazuje vztah k oběma Rheinheimara baltica přes 16S rRNA,[6] a rodině Vibrionaceae přes gyrázu B.[5] S ohledem na ostatní Alishewanella druh, A. fetalis úzce souvisí s Alishewanella jeotgali (98.04%),[2] Alishewanella aestuarii (98.3%),[3] a Alishewanella agri (98.7%)[4] podle 16S rRNA.
Reference
- ^ Parte, A.C. "Alishewanella". LPSN.
- ^ A b C Min-Soo Kim; Seong Woon Roh; Young-Do Nam; Ho-Won Chang; Kyoung-Ho Kim; Mi-Ja Jung; Jung-Hye Choi; Park Eun-Jin; Jin-Woo Bae (2009). „Alishewanella jeotgali sp. Nov., Izolovaný z tradičních fermentovaných potravin a upravený popis rodu Alishewanella“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 59: 2313–2316. doi:10.1099 / ijs.0.007260-0. PMID 19620373. Archivovány od originál dne 15. dubna 2013. Citováno 19. listopadu 2012.
- ^ A b Seong Woon Roh; Young-Do Nam; Ho-Won Chang; Kyoung-Ho Kim; Min-Soo Kim; Hee-Mock Oh; Jin-Woo Bae (2009). „Alishewanella aestuarii sp. Nov., Izolovaný z přílivového plochého sedimentu a upravený popis rodu Alishewanella“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 59: 421–424. doi:10.1099 / ijs.0.65643-0. PMID 19196789. Citováno 26. listopadu 2012.[trvalý mrtvý odkaz ]
- ^ A b Min-Soo Kim; Seon Kyung Jo; Seong Woon Roh; Jin-Woo Bae (2010). „Alishewanella agri sp. Nov., Izolovaný ze skládkové půdy“. 60. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2199–2203. Citováno 26. listopadu 2012.[trvalý mrtvý odkaz ]
- ^ A b C d E F G h i j Birte Fonnesbech Vogel; Kasthuri Venkateswaran; Henrik Christensen; Enevold Falsen; Gunna Christiansen; Lone Gram (2000). „Polyfázický taxonomický přístup při popisu Alishewanella fetalis gen. Nov., Sp. Nov., Izolovaného z lidského plodu“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 50: 1133–1142. doi:10.1099/00207713-50-3-1133. PMID 10843055.[trvalý mrtvý odkaz ]
- ^ A b C Brettar, Ingrid; Christen, Richard; Höfle, Manfred (2002). „Rheinheimera baltica gen. Nov., Sp. Nov., Modrobarevná bakterie izolovaná ze středního Baltského moře“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52: 1851–1857. doi:10.1099 / ijs.0.02151-0. Archivovány od originál dne 15. 4. 2013.