MAPA - AMAP
| Vývojáři | Ariel Schwartz (UC Berkeley ), Lior Pachter (UC Berkeley ) |
|---|---|
| Stabilní uvolnění | 2.0 |
| Operační systém | UNIX, Linux, Mac |
| Typ | Bioinformatický nástroj |
| Licence | Otevřený zdroj |
| webová stránka | Stažení AMAP |
MAPA je vícenásobné zarovnání sekvence program založený na sekvenční žíhání.[1] Tento přístup spočívá v sestavení vícenásobného zarovnání po jedné shodě, čímž se obejde mnoho problémů s postupným zarovnáváním. Parametry AMAP lze použít k vyladění kompromisu specifičnosti citlivosti.
Program lze použít prostřednictvím webového serveru AMAP nebo jako samostatný program, který lze nainstalovat se zdrojovým kódem.
Vstup výstup
Tento program přijímá sekvence v Formát FASTA.
Výstupní formát zahrnuje: Formát FASTA, Clustal.
Reference
- ^ S. Schwartz, A .; Pachter, L. (19. ledna 2007). "Vícenásobné zarovnání podle žíhání sekvence". Bioinformatika. 23 (2): e24 – e29. doi:10.1093 / bioinformatika / btl311.