Rodina holinů A2 - A2 holin family

The Předpokládaná rodina Archaeal 2 TMS Holin (A2-Hol) (TC # 9.B.109 ) se skládá z několika domnělých holínů z Thaumarchaeota v rozmezí velikosti od přibližně 130 do 165 aminoacylových zbytků (aas) a vykazujících 2 transmembránové segmenty (TMS). Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny A2-Hol lze nalézt v Databáze klasifikace transportérů. The archaeon Candidatus Nitrosoarchaeum limnia, kóduje sousední geny označené Toxin Sekrece / Lysis Holin. Gen „toxinu" kóduje rozpustný protein 325 aas, o kterém se uvádí, že patří do „superrodiny typu glykosyltransferázy GBT". Tento protein přináší další glykosyltransferázy při hledání NCBI BLAST. Sousední gen kóduje malý protein 132 aas a 2 TMS (TC # 9.B.109.1.1 ), který by mohl být holinem na základě jeho velikosti a topologie. Tento protein má přístupové číslo pro UniProt S2E3C4. Paralogy se nacházejí ve stejném organismu (Candidatus Nitrosoarchaeum koreensis) a další blízce příbuzné druhy.^[1]

Viz také

• Holin
• Lysin
• Databáze klasifikace transportérů

Další čtení

• Saier, Milton H .; Reddy, Bhaskara L. (01.01.2015). „Holins in Bacteria, Eukaryotes, and Archaea: Multifunctional Xenologues with Potential Biotechnological and Biomedical Applications“. Journal of Bacteriology 197(1): 7–17. doi:10.1128 / JB.02046-14. ISSN  0021-9193. PMC  4288690. PMID  25157079.
• Wang, I.N .; Smith, D.L .; Young, R. (01.01.2000). „Holiny: proteinové hodiny bakteriofágových infekcí“. Výroční přehled mikrobiologie 54: 799–825. doi:10,1146 / annurev.micro. 54.1.799. ISSN  0066-4227. PMID  11018145.

Reference

Do tato úprava, tento článek používá obsah z "9.B.109. Předpokládaná rodina Archaeal 2 TMS Holin (A2-Hol)", který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.