Zoo blot - Zoo blot - Wikipedia

A zoo blot nebo zahradní skvrna je typ Southern blot který ukazuje podobnost mezi specifickým, obvykle kódujícím protein, DNA sekvence různých druhů. Blot zoo porovnává druhy zvířat, zatímco skvrna zahrady porovnává druhy rostlin. Účelem zoo blot je detekovat zachování požadovaného genu (genů) v průběhu vývoje různých druhů.[1]

Abychom pochopili, do jaké míry je konkrétní gen podobný od druhu k druhu, jsou izolovány extrakty DNA ze souboru druhů a rozšířeny po povrchu. Poté je označena a umožněna genová sonda specifická pro jeden z druhů hybridizovat k připravené DNA. Sonda je obvykle označena a radioaktivní izotop fosforu. Po hybridizaci autoradiografie nebo jiné zobrazovací techniky se používají k identifikaci úspěšně hybridizovaných sond, důkaz podobnosti mezi genomy druhů.[2]

K hybridizaci mezi sondou a segmentem DNA dojde, i když jsou vlákna podobná, ale ne identická. Výsledkem je, že blotování v zoo se používá k detekci podobných nebo přesných vztahů mezi příslušnou DNA a jinými organismy. Může také pomoci určit umístění intronů a exonů, protože ty budou mnohem konzervovanější než ty první.[3]

Viz také

Reference

  1. ^ Khan, Firdos Alam (20. září 2011). Základy biotechnologie. CRC Press. p. 563. ISBN  978-1-4398-2009-4. OCLC  708544338.
  2. ^ Walker, John M .; Rapley, Ralph, eds. (2008). Příručka molekulárních biometod (PDF). Příručky Springer Protocols. Totowa, NJ: Humana Press. p. 8. doi:10.1007/978-1-60327-375-6. ISBN  978-1-60327-370-1. OCLC  304561650.
  3. ^ Alberts, Bruce; et al. (7. srpna 2017). Molekulární biologie buňky. CRC Press. str. 1107–1110. ISBN  978-1-317-56374-7. OCLC  1001364893.