Upstream otevřený čtecí rámec - Upstream open reading frame

An upstream otevřený čtecí rámec (uORF) je otevřený čtecí rámec (ORF) v rámci 5 'nepřekládaná oblast (5'UTR) z mRNA. uORF mohou regulovat eukaryotický genová exprese.[1][2] Překlad uORF typicky inhibuje downstream expresi primárního ORF. v bakterie, jsou volány uORF vedoucí peptidy a byly původně objeveny na základě jejich dopadu na regulaci genů zapojených do syntézy nebo transportu aminokyseliny.

Přibližně 50% lidských genů obsahuje uORF ve své 5'UTR, a pokud jsou přítomny, způsobují snížení exprese proteinu.[3] Člověk peptidy odvozené z přeložených uORF mohou být detekovány z buněčného materiálu pomocí a hmotnostní spektrometr.[4]

Viz také

Reference

  1. ^ Vilela C, McCarthy JE (srpen 2003). "Regulace exprese fungálního genu prostřednictvím krátkých otevřených čtecích rámců v mRNA 5 'nepřekládané oblasti". Molekulární mikrobiologie. 49 (4): 859–67. doi:10.1046 / j.1365-2958.2003.03622.x. PMID  12890013.
  2. ^ Lovett PS, Rogers EJ (červen 1996). „Regulace ribozomu rodícím se peptidem“. Mikrobiologické recenze. 60 (2): 366–85. doi:10.1128 / MMBR.60.2.366-385.1996. PMC  239448. PMID  8801438.
  3. ^ Calvo SE, Pagliarini DJ, Mootha VK (květen 2009). „Upstream otevřené čtecí rámce způsobují rozsáhlou redukci exprese proteinu a jsou polymorfní mezi lidmi“ (PDF). Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. Sborník Národní akademie věd. 106 (18): 7507–12. Bibcode:2009PNAS..106,7507C. doi:10.1073 / pnas.0810916106. PMC  2669787. PMID  19372376.
  4. ^ Slavoff SA, Mitchell AJ, Schwaid AG, Cabili MN, Ma J, Levin JZ, Karger AD, Budnik BA, Rinn JL, Saghatelian A (leden 2013). "Peptidomický objev krátkých otevřených čtecích rámců kódovaných peptidů v lidských buňkách". Přírodní chemická biologie. 9 (1): 59–64. doi:10.1038 / nchembio.1120. PMC  3625679. PMID  23160002.