Umit Catalyurek - Umit Catalyurek

„Vyjměte V. Çatalyürek
Alma mater	Univerzita v Bilkentu
Známý jako	Rozdělení grafů a hypergrafů, vysoce výkonné výpočty, kombinatorické vědecké výpočty a biomedicínská informatika
Manžel (y)	Gamze Çatalyürek
Ocenění	Člen IEEE KARIÉRA NSF Cena Lumley za mezioborový výzkum
Vědecká kariéra
Pole	Výpočetní technika, elektrotechnika a výpočetní technika, biomedicínská informatika
Instituce	Ohio State University Gruzínský technologický institut
Teze	Modely Hypergraph pro rozdělení a přeuspořádání řídkých matic
Doktorský poradce	Cevdet Aykanat

„Vyjměte V. Çatalyürek je profesorem informatiky na Gruzínský technologický institut a mimořádný profesor na katedře biomedicínské informatiky na VŠE Ohio State University. Je známý svou prací v oblasti analytiky grafů, paralelních algoritmů pro vědecké aplikace, datově náročných výpočtů a rozsáhlých genomických a biomedicínských aplikací. Byl ředitelem High Performance Computing Lab na Ohio State University. Byl jmenován Člen Institutu elektrotechnických a elektronických inženýrů (IEEE) v roce 2016^[1] za příspěvky do kombinatorických vědeckých výpočtů a paralelních výpočtů.

Vzdělávání

Çatalyürek dokončil B.S. v oboru počítačového inženýrství a informační vědy na univerzitě v Bilkentu v roce 1992 a získal titul Ph.D. v oboru počítačového inženýrství a informační vědy z Univerzita v Bilkentu v roce 2000 pod dohledem Cevdeta Aykanata. Jeho disertační práce byla publikována na Bilkent University jako Hypergraph Models for Sparse Matrix Partitioning and Reordering.^[2]

Kariéra

Çatalyürek zahájil svou kariéru v roce 1992 jako výzkumný pracovník na Katedře počítačového inženýrství a informační vědy na Bilkent University v Turecku. Poté nastoupil jako hostující vědecký pracovník na UMIACS, výzkumný ústav v College Parku na University of Maryland a výzkumný pracovník na Johns Hopkins Medical Institutions v roce 1999. Catalyurek se později přestěhoval do Columbusu, kde se v roce 2001 připojil k Ohio State University, jako odborný asistent, kde na této pozici zůstal až do roku 2007, poté byl povýšen na docenta na katedře biomedicínské informatiky. Působil na různých pozicích na Ohio State University, poté nastoupil jako profesor na Georgia Institute of Technology v roce 2016, kde se později stal přidruženým předsedou akademických programů na Georgia Institute of Technology.^[2]

Çatalyürek je šéfredaktorem časopisu Elsevier's Parallel Computing. Působil také jako člen redakční rady pro IEEE Transactions on Parallel and Distributed Computing, Journal of Parallel and Distributed Computing a SIAM Journal of Scientific Computing.

Ceny a vyznamenání

• Çatalyürek je držitelem ceny NSF CAREER Award v roce 2007.^[3]
• V roce 2015 byl jmenován členem IEEE. Získal také cenu OSU Lumley Interdisciplinary Research Award.
• V letech 2016–2017 byl zvolen jako předseda Technického výboru IEEE CS pro paralelní zpracování. V letech 2015–2017 byl také zvolen místopředsedou pro zvláštní zájmovou skupinu ACM ACM pro bioinformatiku, výpočetní biologii a biomedicínskou informatiku.

Vybrané publikace

Çatalyürek je spoluautorem více než 200 článků v recenzovaných časopisech a konferencích.^[4]

• Catalyurek, U. V .; Aykanat, C. (červenec 1999). "Hypergraph-partitioning-based decomposition for parallel sparse-matrix vector multiplication". Transakce IEEE na paralelních a distribuovaných systémech. 10 (7): 673–693. CiteSeerX  10.1.1.67.2498. doi:10.1109/71.780863. hdl:11693/25158. ISSN  1045-9219.
• Yoo, A .; Chow, E .; Henderson, K .; McLendon, W .; Hendrickson, B .; Catalyurek, U. (listopad 2005). Škálovatelný distribuovaný paralelní vyhledávací algoritmus s šířkou první na BlueGene / L. Supercomputing, 2005. Sborník příspěvků z konference ACM / IEEE SC 2005. p. 25. doi:10.1109 / SC.2005.4. ISBN  978-1-59593-061-3. S2CID  602651.
• Beynon, Michael D; Kurc, Tahsin; Catalyurek, Umit; Chang, Chialin; Sussman, Alan; Saltz, Joel (2001-10-01). Msgstr "Distribuované zpracování velmi velkých datových sad pomocí DataCutter". Parallel Computing. Klastry a výpočetní mřížky pro vědecké výpočty. 27 (11): 1457–1478. doi:10.1016 / S0167-8191 (01) 00099-0.
• Devine, K. D.; Boman, E. G .; Heaphy, R. T .; Bisseling, R. H .; Catalyurek, U. V. (duben 2006). Paralelní dělení hypergrafů pro vědecké výpočty. Sborník 20. IEEE International Parallel Distributed Processing Symposium. str. 10 str .–. CiteSeerX  10.1.1.61.429. doi:10.1109 / IPDPS.2006.1639359. ISBN  978-1-4244-0054-6. S2CID  2444665.
• Sertel, O .; Kong, J .; Shimada, H .; Catalyurek, U. V .; Saltz, J. H .; Gurcan, M. N. (01.06.2009). „Počítačem podporovaná prognóza neuroblastomu na celoplošných obrázcích: Klasifikace stromálního vývoje“. Rozpoznávání vzorů. Digitální zpracování obrazu a techniky rozpoznávání vzorů pro detekci rakoviny. 42 (6): 1093–1103. doi:10.1016 / j.patcog.2008.08.027. PMC  2678741. PMID  20161324.
• Aykanat, C .; Pinar, A .; Çatalyürek, Ü. (01.01.2004). "Permutace řídkých obdélníkových matic do blokové diagonální formy". SIAM Journal on Scientific Computing. 25 (6): 1860–1879. CiteSeerX  10.1.1.10.9163. doi:10.1137 / S1064827502401953. ISSN  1064-8275.
• Sertel, Olcay; Kong, červen; Catalyurek, Umit V .; Lozanski, Gerard; Saltz, Joel H .; Gurcan, Metin N. (2009-04-01). "Histopatologická analýza obrazu pomocí modelových intermediálních reprezentací a barevné textury: třídění folikulárního lymfomu". Journal of Signal Processing Systems. 55 (1–3): 169. doi:10.1007 / s11265-008-0201-r. ISSN  1939-8018. S2CID  207252800.
• Hatem, Ayat; Bozdağ, Doruk; Toland, Amanda E .; Çatalyürek, Ümit V. (06.06.2013). „Porovnávací nástroje pro mapování krátkých sekvencí“. BMC bioinformatika. 14: 184. doi:10.1186/1471-2105-14-184. ISSN  1471-2105. PMC  3694458. PMID  23758764.
• Eren, K .; Deveci, M .; Kucuktunc, O .; Catalyurek, U. V. (2013-05-01). „Srovnávací analýza algoritmů biclusteringu pro data genové exprese“. Briefings in Bioinformatics. 14 (3): 279–292. doi:10.1093 / bib / bbs032. ISSN  1467-5463. PMC  3659300. PMID  22772837.

Reference