Transfer gen - Transfer gene
Přenos genů nebo tra geny (taky přenos operonů nebo tra operony), jsou některé geny nezbytné pro nesexuální přenos genetického materiálu v obou grampozitivní a gramnegativní bakterie. Tra lokus zahrnuje gen pilinu a regulační geny, které společně tvoří pili na buněčném povrchu, polymerní proteiny, které se mohou připojit k povrchu F-bakterií a zahájit konjugaci. Existence tra regionu a plazmid genom poprvé objevili v roce 1979 David H. Figurski a Donald R. Helinski[1] V průběhu své práce Figurski a Helinski také objevili druhý klíčový fakt o regionu Tra - že může působit v trans na značku mobilizace, kterou ovlivňuje.[1]
Toto zjištění naznačuje, že existují dva základní aspekty nezbytné pro to, aby se plazmid pohyboval z jedné buňky do druhé:
- An původ převodu - Místo oriT (nebo bom) musí být umístěno na samotném plazmidu, aby bylo možné rozpoznat plazmid a zahájit přenos.[2] Plazmid bez počátku přenosu je nemobilizovatelný.
- Přenosové geny - Ačkoli je pro přenos plazmidů nezbytná funkční sada tra genů, mohou být umístěny na různých místech včetně dotyčného plazmidu, jiného plazmidu ve stejné hostitelské buňce nebo dokonce v bakteriálním genomu.[3]
Tra geny kódují proteiny, které jsou užitečné pro množení plazmidu z hostitelské buňky na kompatibilní donorovou buňku nebo pro udržení plazmidu. Ne všechny přenosové operony jsou stejné. Některé geny se vyskytují pouze u několika druhů nebo jedinců rod bakterií, zatímco ostatní (např traL) se vyskytují ve velmi podobných formách u mnoha bakteriálních druhů. Mnoho přenosových systémů je nekompatibilních. Například, oriT a bom jsou dva počátky přenosu, které interagují s různými sadami přenosových genů. Plazmid s mobovým webem (jako mnoho jiných nalezených v Rhodococcus druhy) nelze přenést prostřednictvím přenosových genů, které normálně interagují s místem oriT (což je běžné v E-coli)[3]
| Role některých proteinů kódovaných tragenem:[4] | |
| Montáž a výroba Pili | traA, traB, traE, traC, traF, traG, traH, traK, traL, traQ, traU, traV, traW, |
| Vnitřní membránové proteiny | traB, traE, traG, traL, traP |
| Periplazmatické proteiny | traC, traF, traH traK, traU, traW |
| Přenos DNA | traC, traD, traI, traM, traY |
| Proteiny vylučující povrch | traS, traT |
| Stabilizace párového páření | traN, traG |
Každý z jednotlivých genů v tra operon kódy pro jiný proteinový produkt. Tyto produkty mohou provádět řadu úkolů, včetně vzájemné interakce za účelem provádění funkcí párování párů a regulace různých oblastí samotného operátoru,[5] nebo konjugativní metabolismus DNA a vyloučení povrchu.[4] Všimněte si také, že některé proteiny plní více funkcí nebo jsou úzce spojeny s proteiny, které mají podobné funkce.
Reference
- ^ A b Figurski D, Helinski D (1979). "Replikace derivátu obsahujícího původ plazmidu RK2 v závislosti na funkci plazmidu v trans". PNAS. 76 (4): 1648–1652. doi:10.1073 / pnas.76.4.1648. PMC 383447. PMID 377280.
- ^ Fu YH, Tsai MM, Luo YN, Deonier RC (1. února 1991). „Analýza delece lokusu F plasmidu oriT“. Journal of Bacteriology. 173 (3): 1012–1020. doi:10.1128 / jb.173.3.1012-1020.1991. PMC 207219. PMID 1991706.
- ^ A b Simon R, Priefer U, Puhler A (1983). "Široký mobilizační systém pro hostitele pro In Vivo Genetické inženýrství: Transposonová mutageneze u gramnegativních bakterií ". Přírodní biotechnologie. 1 (9): 784–791. doi:10.1038 / nbt1183-784.
- ^ A b Clewell D a kol. (1993). Bakteriální konjugace. Plenum Press, New York. ISBN 978-0-306-44376-3.
- ^ Grohmann E, Muth G, Espinosa M (2003). "Konjugativní přenos plazmidu v grampozitivních bakteriích". Recenze mikrobiologie a molekulární biologie. 67 (2): 277–301. doi:10.1128 / MMBR.67.2.277-301.2003. PMC 156469. PMID 12794193.