Thiobacillus - Thiobacillus
| Thiobacillus | |
|---|---|
| Vědecká klasifikace | |
| Království: | |
| Kmen: | |
| Třída: | |
| Objednat: | |
| Rodina: | |
| Rod: | Thiobacillus |
| Druh | |
Thiobacillus thioparus | |
Thiobacillus je rod Gramnegativní Betaproteobakterie. Thiobacilus thioparus je druh druhu rodu a jeho typovým kmenem je StarkeyT kmen, izolovaný Robert Starkey ve třicátých letech z pole v Rutgersova univerzita v Spojené státy americké. Zatímco více než 30 „druhů“ bylo v tomto rodu pojmenováno od doby, kdy byl definován Martinus Beijerinck v roce 1904,[1][2] (první kmen byl pozorován biologickým oceánografem Alexander Nathansohn v roce 1902 - pravděpodobně to, co bychom nyní nazvali Halothiobacillus neapolitanus[3]), většina jmen nebyla nikdy platně ani účinně zveřejněna. Zbytek byl buď překlasifikován do Paracoccus, Starkeya (oba v Alphaproteobacteria ); Sulfuriferula, Annwoodia, Thiomonas (v Betaproteobakterie ); Halothiobacillus, Guyparkeria (v Gammaproteobakterie ), nebo Thermithiobacillus nebo Acidithiobacillus (v Acidithiobacillia ). Velmi volně definovaný „druh“ Thiobacillus trautweinii kde oxidovala síra heterotrofy a chemolithoheterotrofy byli přiděleni v éře 1910-1960, většina z nich byla pravděpodobně Pseudomonas druh.[4] Mnoho druhů pojmenovaných v tomto rodu nebylo nikdy uloženo do služebních sbírek a bylo ztraceno.[4][3]
Všechny druhy jsou povinnými autotrofy[1][2][3] (za použití transaldoláza forma Calvin-Benson-Basshamův cyklus[4]) používající jako zdroje energie elementární síru, thiosíran nebo polythionáty - první Thiobacillus aquaesulis může slabě růst na komplexním médiu jako heterotrof, ale byl překlasifikován na Annwoodia aquaesulis. Některé kmeny (E6 a Tk-m) druhu Thiobacillus thioparus může použít síru z dimethylsulfid, dimethyldisulfid nebo sirouhlík na podporu autotrofního růstu - oxidují uhlík z těchto druhů na oxid uhličitý a asimilovat to. Oxidace síry se dosahuje pomocí Kelly-Trudingerova cesta.
Překlasifikace
Jako výsledek 16S ribozomální RNA sekvenční analýza, mnoho členů Thiobacillus byly přiděleny.[5][4][6]
- Thiobacillus versutus na Paracoccus
- Thiobacillus acidophilus na Acidiphilium
- Thiobacillus intermedius, Thiobacillus perometabolis, Thiobacillus thermosulfatus, a Thiobacilus cuprinus na Thiomonas
- Thiobacillus thiooxidans, Thiobacillus ferrooxidans, Thiobacillus caldus, a Thiobacillus albertensis na Acidithiobacillus
- Thiobacillus aquaesulis na Annwoodia aquaesulis.[4]
- Thiobacillus neapolitanus na Halothiobacillus
- Thiobacillus thyasiris na Thiomicrospira thyasirae[7]
- Thiobacillus hydrothermalis a Thiobacillus halophilus nejprve k Halothiobacillus a později do Guyparkeria[6]
- Thiobacillus tepidarius na Thermithiobacillus[5]
Reference
- ^ A b Beijerinck MW (1904). „Phénomènes de réduction produits par les microbes“. Arch Neel Sci Exact Nat (část 2). 9: 131–157.
- ^ A b Beijerinck MW (1904). „Ueber die Bakterien, welche sich im Dunkeln mit Kohlensäure als Kohlenstoffquelle ernähren können“. Centralbl Bakteriol Parasitenkd Infektionskr Hyg Abt II. 11: 592–599.
- ^ A b C Boden R (2017). „115 let metabolismu síry“. Mikrobiologické dopisy FEMS. 364: fnx043. doi:10.1093 / femsle / fnx043.
- ^ A b C d E Boden R, Hutt LP, Rae AW (2017). "Reklasifikace Thiobacillus aquaesulis (Wood & Kelly, 1995) as Annwoodia aquaesulis gen. nov., hřeben. nov., převod Thiobacillus (Beijerinck, 1904) z Hydrogenophilales do Nitrosomonadales, návrh Hydrogenophilalia třída. listopad. v rámci Proteobakteriea čtyři nové rodiny v rámci objednávek Nitrosomonadales a Rhodocykly". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 67: 1191–1205. doi:10.1099 / ijsem.0.001927. PMID 28581923.
- ^ A b Kelly DP; Wood AP (2000). "Reklasifikace některých druhů Thiobacillus do nově určených rodů Acidithiobacillus gen. listopad., Halothiobacillus gen. listopad. a Thermithiobacillus gen. listopad". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 50: 511–516. doi:10.1099/00207713-50-2-511. PMID 10758854. Citováno 19. prosince 2015.
- ^ A b Boden R (2017). "Reklasifikace Halothiobacillus hydrothermalis a Halothiobacillus halophilus na Guyparkeria gen. listopad. v Thioalkalibacteraceae fam. listopadu, s upravenými popisy rodu Halothiobacillus a rodina Halothiobacillaceae". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 67: 3919–3928. doi:10.1099 / ijsem.0.002222. PMID 28884673. Citováno 9. prosince 2017.
- ^ Kelly DP; WoodAP (1993). „Reklasifikace Thiobacillus thyasiris jako Thiomicrospira thyasirae, nová kombinace, organismus vykazující pleomorfismus v reakci na podmínky prostředí“. Archiv mikrobiologie. 159: 45–47. doi:10.1007 / BF00244262.