Thioalkalivibrio - Thioalkalivibrio
| Thioalkalivibrio nitratis | |
|---|---|
| Vědecká klasifikace | |
| Království: | |
| Kmen: | |
| Třída: | |
| Objednat: | |
| Rodina: | |
| Rod: | Thioalkalivibrio Sorokin a kol. 2001[1] |
| Zadejte druh | |
| Thioalkalivibrio versutus[1] | |
| Druh[1] | |
T. denitrificans | |
| Synonyma | |
Thioalcalovibrio[2] | |
Thioalkalivibrio je Gramnegativní, většinou halofilní bakteriální rod rodiny Ectothiorhodospiraceae.[1][2][3][4]
Výskyt
V posledním desetiletí několik druhů Thioalkalivibrio byly objeveny, ale tyto chemolithoautotrofní, haloalkalifilní síry oxidující bakterie byly nalezeny pouze v sodných jezerech v alkalických a solných stanovištích. Sorokin a kolegové (2012) však izolovali a vyrostli z románu Thioalkalivibrio sulfidiphilus, kmen HL-EbGr7T, z bioreaktoru odpadních vod v plném rozsahu po odstranění plynného sirovodíku /[5]
Struktura
The Thioalkalivibrio sulfidiphilus kmen HL-EbGr7T Buňky jsou dlouhé, štíhlé, mírně zakřivené, tyčinkovité bakterie s polárním bičíkem pro motilitu. Má gramnegativní buněčnou stěnu a kolonie mají průměr až 2 mm.[5]
Genetika
Thioalkalivibrio sulfidiphilus kmen HL-EbGr7T úzce souvisí s Thioalkalivibrio denitrificans v rámci Gammaproteobacteria na základě genu 16S rRNA. Obsahuje singulární chromozom, který je 3,46 Mbp s obsahem G + C 65,06% a 3 366 genů.[6]
Metabolismus
Kmen HL-EBGrtT byl obligátně aerobní, nemohl jako zdroj dusíku používat dusitany nebo dusičnany, ale mohl používat močovinu a amoniak. Rostl na thiosíranu i na sulfidu, což dává přednost sulfidu. Rovněž oxidoval polysulfid, elementární síru a tetrathionát. Byl citlivý na plně aerobní podmínky, optimálně rostl při pH 10, obsahu solí 0,4 M a optimální teplotě 35 ° C. Byl citlivý na chloramfenikol a odolný vůči ampicilinu, kanamycinu, tetracyklinu a rifampicinu.[5]
Reference
- ^ A b C d "Rod Thioalkalivibrio". LPSN. Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře.
- ^ A b „Taxonomy - Thioalkalivibrio“. UniProt.
- ^ Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT (2005). Bergeyův manuál systematické bakteriologie (2. vyd.). New York: Springer. ISBN 0-387-28022-7.
- ^ Seckbach J, Oren A, Stan-Lotter H (2013). Život polyextremofilů za různých forem stresu. Dordrecht: Springe r. ISBN 978-94-007-6488-0.
- ^ A b C Sorokin DY, Muntyan MS, Panteleeva AN, Muyzer G (srpen 2012). „Thioalkalivibrio sulfidiphilus sp. Nov., Haloalkalifilní, sírou oxidující gamaproteobakterium z alkalických stanovišť“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 62 (Pt 8): 1884–9. doi:10.1099 / ijs.0.034504-0. PMID 21984678.
- ^ Muyzer G, Sorokin DY, Mavromatis K, Lapidus A, Clum A, Ivanova N a kol. (Únor 2011). "Kompletní sekvence genomu" Thioalkalivibrio sulfidophilus "HL-EbGr7". Standardy v genomických vědách. 4 (1): 23–35. doi:10,4056 / sigs.1483693. PMC 3072093. PMID 21475584.
Další čtení
- Berben T, Sorokin DY, Ivanova N, Pati A, Kyrpides N, Goodwin LA a kol. (26. října 2015). „Částečná sekvence genomu Thioalkalivibrio thiokyanodenitrificans ARhD 1 (T), chemolithoautotrofní haloalkalifilní bakterie oxidující síru schopná úplné denitrifikace“. Standardy v genomických vědách. 10 (1): 84. doi:10.1186 / s40793-015-0080-3. PMC 4624374. PMID 26512309.
- Koki H, Garabed A, Alan T B, Frank T R, Karl O S (2010). Příručka extremofilů. Springer Science & Business Media. ISBN 978-4-431-53897-4.
- Atlas RM (2010). Příručka mikrobiologických médií (4. vydání). Washington, D.C .: Boca Raton, Florida. ISBN 978-1-4398-0408-7.
- Kroneck PM, Torres ME (2014). Kovem řízená biogeochemie plynných sloučenin v životním prostředí. Springer. ISBN 978-94-017-9269-1.
| Tento Chromatiales článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |