Tetraparvovirus - Tetraparvovirus

Tetraparvovirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Monodnaviria
Království:Shotokuvirae
Kmen:Cossaviricota
Třída:Quintoviricetes
Objednat:Piccovirales
Rodina:Parvoviridae
Podčeleď:Parvovirinae
Rod:Tetraparvovirus
Zadejte druh
Primát tetraparvovirus 1

Tetraparvovirus jsou rodem virů v rodině Parvoviridae.[1][2] V současné době existuje šest uznávaných druhů: Chiropteran tetraparvovirus 1, Primát tetraparvovirus 1, Kopytník tetraparvovirus 1, Kopytník tetraparvovirus 2, Kopytník tetraparvovirus 3, a Kopytník tetraparvovirus 4.[3]

Dějiny

První člen tohoto rodu byl identifikován v roce 2001 v prasečím séru a označen jako prasečí parvovirus 2.[4] První lidský tetraparvovirus, PARV4, byl popsán v roce 2005.[5] Bylo zjištěno, že tyto nové viry souvisejí se známými parvoviry, ale liší se od nich. Byli izolováni od skupiny pacientů, kteří se účastnili vysoce rizikového chování. Ostatní členové této skupiny byli izolováni ze zvířecích zdrojů v Hongkongu.[6] Tyto izoláty byly původně označovány jako Hokoviry. Byli izolováni od divokých prasat v Německu[7] a šimpanzi a paviáni.[8] Byly také izolovány z ovcí[9] a prasata.[10] Nakonec byly také identifikovány u netopýrů.[11]

Popis

Tetraparvoviry jsou malé neobalené zvířecí viry s jednořetězcovým genomem DNA o délce 4 až 6 kb.[2] K dispozici jsou 2 otevřené čtecí rámce (ORF) přítomné v genomu. ORF1 kóduje nestrukturální protein (NS1) a ORF2 kóduje virové kapsidové proteiny (VP1 / VP2). Inverzní koncové repetice jsou přítomny na 5 'a 3' konci genomu. V této rodině leží třetí ORF ležící ve VP1.

Protein NS1 má obojí helikáza a ATPáza domén. Má ~ 652 aminokyselinových zbytků a molekulovou hmotnost 70–75 kilodaltonů (kDa). Protein VP1 obsahuje 900–950 aminokyselinových zbytků a má molekulovou hmotnost ~ 100 kDa. VP1 má konzervovaný fosfolipáza Doména A2, kterou virion používá k úniku z domény endosom.

Třetí ORF kóduje malý protein s jedinou transmembránovou spirálou překlenující 20 aminokyselinových zbytků ve středu. Jeho molekulová hmotnost je ~ 10 kDa. Funkce tohoto proteinu není známa.

Virologie

Tyto viry byly izolovány z krve, jater, sleziny, lymfatických uzlin a kostní dřeně.

Klinický

Tyto viry nebyly dosud spojeny s onemocněním u žádného ze svých známých hostitelů.

Reference

  1. ^ Cotmore, SF; Agbandje-McKenna, M; Canuti, M; Chiorini, JA; Eis-Hubinger, A; Hughes, J; Mietzsch, M; Modha, S; Ogliastro, M; Pénzes, JJ; Pintel, DJ; Qiu, J; Soderlund-Venermo, M; Tattersall, P; Tijssen, P; a konsorcium zpráv ICTV (2019). „Profil taxonomie virů ICTV: Parvoviridae". Journal of General Virology. 100 (3): 367–368. doi:10.1099 / jgv.0.001212. PMC  6537627. PMID  30672729.
  2. ^ A b „10. zpráva ICTV (2018)“.
  3. ^ „10. zpráva ICTV (2018)“ Tetraparvovirus"".
  4. ^ Hijikata M, Abe K, Win KM, Shimizu YK, Keicho N, et al (2001) Identifikace nové sekvence DNA parvoviru v prasečích séru z Myanmaru. Jpn J. Infect. Dis 54: 244-245.
  5. ^ Jones MS, Kapoor A, Lukashov VV, Simmonds P, Hecht F, et al (2005) Nové DNA viry identifikované u pacientů se syndromem akutní virové infekce. J Virol 79: 8230–8236.
  6. ^ Lau SK, Woo PC, Tse H, Fu CT, Au WK, et al (2008) Identifikace nových prasečích a hovězích parvovirů úzce souvisejících s lidským parvovirem 4. J Gen Virol 89: 1840–1848
  7. ^ Adlhoch C, Kaiser M, Ellerbrok H, Pauli G (2010) Vysoká prevalence prasečího hokoviru v populacích německých divočáků. Virol J 7: 171
  8. ^ Sharp CP, LeBreton M, Kantola K, Nana A, Diffo Jle D a kol. (2010) Rozšířená infekce s homology lidských parvovirů B19, PARV4 a lidským bocavirem šimpanzů a goril ve volné přírodě. J Virol 84: 10289–10296
  9. ^ Tse H, Tsoi HW, Teng JL, Chen XC, Liu H, Zhou B, Zheng BJ, Woo PC, Lau SK, Yuen KY (2011) Objev a genomická charakterizace nového ovčího partetraviru a nového genotypu hovězího partetraviru. PLoS One 6 (9): e25619.
  10. ^ Li B, Ma J, Xiao S, Wen L, Ni Y, Zhang X, Fang L, He KJ (2012) Genomová sekvence vysoce převládajícího prasečího partetraviru v Číně. Virol 86 (3): 1899
  11. ^ Canuti, Marta; Eis-Huebinger, Anna Maria; Deijs, Martin; de Vries, Michel; Drexler, Jan Felix; Oppong, Samuel K .; Müller, Marcel A .; Klose, Stefan M .; Wellinghausen, Nele (2011-12-27). „Dva románové parvoviry v netopýřích vlcích nového a starého světa“. PLOS ONE. 6 (12): e29140. doi:10.1371 / journal.pone.0029140. PMC  3246463. PMID  22216187.