Superpočítačové zařízení pro bioinformatiku a výpočetní biologii - Supercomputing Facility for Bioinformatics and Computational Biology
जैवसूचना विज्ञान एवं अभिकलनी जीवविज्ञान हेतु अतिअभिकलन सुविधा, भारतीय प्रौद्योगिकी संस्थान नई दिल्ली | |
 | |
| Typ | Veřejnost Výzkum |
|---|---|
| Založeno | 31. července 2002 |
| Koordinátor | Prof. B. Jayaram |
| Umístění | , |
| Kampus | Městský |
| Přidružení | Indický technologický institut v Dillí |
| webová stránka | SCFBio |
Superpočítačové zařízení pro bioinformatiku a výpočetní biologii, také známý jako SCFBio IIT Delhi, je centrem pro bioinformatiku a výpočetní biologii v Indický technologický institut, Dillí. Toto zařízení bylo založeno v roce 2002 pod záštitou Department of Chemistry, IIT Delhi. Oddělení biotechnologie jej uznává jako centrum excelence v bioinformatice (DBT ), Indická vláda.
Dějiny
Superpočítačové zařízení pro bioinformatiku a výpočetní biologii (SCFBio), IIT Delhi, bylo založeno v červenci 2002 s financováním z Ústav biotechnologie pod vedením profesora B. Jayarama. Zaměřuje se na vývoj nových vědeckých metod a nového softwaru pro analýzu genomu, predikci struktury proteinů a pro návrh léků na bázi silika. Zařízení bylo slavnostně otevřeno čestným ministrem vědy a technologie a rozvojem lidských zdrojů Shri Murli Manohar Joshi V březnu 2003 přijala IITD SCFBio jako ústřední nástroj národního významu.
Program SCFBio byl upgradován na zařízení pro více teraFLOP v rámci podpory programu od DBT a slavnostně zahájen v září 2009 čestným tajemníkem DBT, Dr. M K Bhan. Celková výpočetní síla zařízení je více než 6 teraFLOPS s datovým úložištěm přes 50 terabajtů a moderním datovým centrem. Zařízení je připojeno prostřednictvím vyhrazené linky 10MbPS. V poslední době je počet rozšířen o 10 teraFLOPS clusteru založeného na GPU spolu se 150 terabajty paralelního úložiště systému souborů.
Vidění
„Genome to Drug“ (Dhanvantari) předpokládá dodávku molekul léků do společnosti z genomových / proteomických informací. Skládá se hlavně ze tří fází:
- interpretace jazyka genomové DNA a identifikace léčivého genu kódujícího protein (Chemgenome) pro nemoci / poruchy,
- stanovení trojrozměrné struktury proteinového cíle (Bhageerath-H) a
- vytváření malých molekul (léčiv), které se mohou vázat s vysokou afinitou a specificitou na cíl protein / DNA, ale s nejnižší toxicitou pro člověka (Sanjeevini).
Vyvíjet nové vědecké metody a vysoce účinné algoritmy kombinující principy chemie a biologie s informačními technologiemi pro analýzu genomu, predikcí struktury proteinů a cíleně zaměřeným designem léčiv, který sleduje sen poskytnout společnosti GENOME DRUG.
Školení lidských zdrojů
Osmnáct doktorandů dokončilo doktorát. V současné době devět studentů sleduje doktorát v oblastech genomiky, proteomiky a designu léčiv. Více než 600 účastníků bylo proškoleno v různých aspektech bioinformatiky prostřednictvím krátkodobých vzdělávacích programů. SCFBio uspořádalo několik workshopů a mezinárodních konferencí včetně InCoB 2006.
Ze SCFBio se zatím vyvinuly dvě začínající společnosti (Leadinvent a novoinformatika). Má také plodnou spolupráci s Dabur, HCl Life Sciences a NIIT. Tvoří výpočetní páteř School of Biological Sciences, IIT Delhi vytvoření silné spolupráce mezi výpočetní a experimentální biologií.
Vlastní software
ChemgenomBhageerath-HSanjeevini