Brokovnicová lipidomika - Shotgun lipidomics
v lipidomika, proces brokovnicová lipidomika (pojmenováno analogicky s sekvenování brokovnice ) používá analytickou chemii ke zkoumání biologické funkce, významnosti a následků změn v lipidy a protein složky zprostředkující metabolismus lipidů, obchodování nebo biologickou funkci v buňkách.[1][2]Lipidomika byla značně usnadněna nedávným pokrokem a novými aplikacemi ionizace elektrosprejem hmotnostní spektrometrie (ESI / MS).[3]
Lipidomika je výzkumné pole, které ve velkém měřítku studuje cesty a sítě buněčných lipidů v biologických systémech (tj. Lipidomy). Zahrnuje identifikaci a kvantifikaci tisíců buněčných lipidových molekulárních druhů a jejich interakcí s jinými lipidy, proteiny a jinými skupinami in vivo. Vyšetřovatelé lipidomiky zkoumají struktury, funkce, interakce a dynamiku buněčných lipidů a dynamické změny, ke kterým dochází během patofyziologických poruch. Lipidomické studie hrají zásadní roli při definování biochemických mechanismů chorobných procesů souvisejících s lipidy prostřednictvím identifikace alterací buněčného metabolismu lipidů, obchodování a homeostázy. Dvě hlavní platformy, které se v současné době používají pro lipidomické analýzy, jsou HPLC-MS a brokovnicová lipidomika.
Dějiny
Brokovnicová lipidomika byla vyvinuta Richardem W. Grossem a Xianlinem Hanem za použití technik separace ESI intrasource. Jednotlivé molekulární druhy většiny hlavních a mnoha menších lipidových tříd mohou být otisky prstů a kvantifikovány přímo z biologických lipidových extraktů bez nutnosti chromatografického čištění.
Výhody
Brokovnická lipidomika je rychlá, vysoce citlivá a dokáže identifikovat stovky lipidů vynechaných jinými metodami - to vše s mnohem menším vzorkem tkáně, aby bylo možné vyšetřit konkrétní buňky nebo vzorky minutové biopsie.
Reference
- ^ Han X, Gross RW (2005). „Brokovnicová lipidomika: elektrosprejová ionizační hmotnostní spektrometrická analýza a kvantifikace buněčných lipidomů přímo ze surových extraktů biologických vzorků“. Mass Spectrom Rev. 24 (3): 367–412. doi:10.1002 / mas.20023. PMID 15389848. Archivovány od originál dne 05.01.2013.
- ^ Han X, Gross RW (duben 2005). „Brokovnicová lipidomika: vícerozměrná MS analýza buněčných lipidomů“. Expert Rev Proteomics. 2 (2): 253–64. doi:10.1586/14789450.2.2.253. PMID 15892569. S2CID 29752390.
- ^ Han X, Gross RW (červen 2003). „Globální analýzy buněčných lipidomů přímo ze surových extraktů biologických vzorků hmotnostní spektrometrií ESI: most k lipidomii“. J. Lipid Res. 44 (6): 1071–9. doi:10.1194 / jlr.R300004-JLR200. PMID 12671038.
Další čtení
- Střelba za tuky
- Gross RW, Han X (2007). "Lipidomika při cukrovce a metabolickém syndromu". Pervitin Enzymol. Metody v enzymologii. 433: 73–90. doi:10.1016 / S0076-6879 (07) 33004-8. ISBN 9780123739667. PMID 17954229.
- Han X, Yang J, Cheng H, Ye H, Gross RW (červenec 2004). "Směrem k otiskům prstů buněčných lipidomů přímo z biologických vzorků pomocí dvourozměrné elektrosprejové ionizační hmotnostní spektrometrie". Anální. Biochem. 330 (2): 317–31. doi:10.1016 / j.ab.2004.04.004. PMID 15203339.