Saccharomyces kudriavzevii - Saccharomyces kudriavzevii - Wikipedia
Saccharomyces kudriavzevii | |
---|---|
Vědecká klasifikace | |
Království: | Houby |
Divize: | Ascomycota |
Třída: | Saccharomycetes |
Objednat: | Saccharomycetales |
Rodina: | Saccharomycetaceae |
Rod: | Saccharomyces |
Druh: | S. kudriavzevii |
Binomické jméno | |
Saccharomyces kudriavzevii Naumov a kol. 2000 |
Saccharomyces kudriavzevii, je druh droždí v Saccharomyces sensu stricto komplex.[1] Jeho typový kmen je NCYC 2889T. Používá se při výrobě alkoholických nápojů, včetně ležáckých piv a vína Pinot noir. Je izolován široce od kůry dubů (rodina Quercus).
Etymologie
"Saccharomyces"pochází z Latinsky řecký a znamená „cukrová forma“ nebo „cukrová houba“, Saccharo (σάκχαρις) je kombinační forma „cukr“ a myces (μύκης, genitiv μύκητος) je „houba“.
“Kudriavzevii ” byl pojmenován na počest VI Kudriavzeva, ruského vědce, který pracoval s taxonomií a ekologií kvasinek, a také hrál velkou roli při zavádění divokého kmene S. paradoxus do vědy (Naumov et al., 2000).
Jiná jména zahrnují:
· S. kudriavzevii je běžný vědecký název
· Ležák
· Pinot Noir droždí
Dějiny
Saccharomyces kudriavzevii byl původně izolován ze zkaženého listu (Kaneko & Banno, 1991), ale je často izolován z kůry dubů (Sampaio & Gonçalves, 2008).
Popis
Tento druh kvasinek je uvnitř Saccharomyces clade a lze jej izolovat z různých substrátů a je jedinečný tím, že nemůže žít na galaktóze a je kryotolerant. Na obrázku 2 je uveden souhrn aktivity při pěstování na různých substrátech. S. kudriavzevii, ve srovnání s S. cerevisiae.
Biologie
Ekologie
Buňky kvasinek lze izolovat z různých přírodních substrátů - prakticky ze všeho, co obsahuje cukry - jako je rozkládající se ovoce, kůra a půda. Optimální růst pro mnoho kvasinek nastává při 30 - 35 ° C, ale S. kudriavzevii je přizpůsoben k růstu při mnohem chladnějších teplotách (Hittinger, 2013).
Životní cyklus a páření
Existují dvě formy, ve kterých existují kvasinkové buňky - haploidní a diploidní - každá z nich je součástí reprodukčního cyklu organismu. Tyto značky mají co do činění s počtem kopií chromozomů, které buňka drží, diploidy s 2n, haploidy s 1n. Haploidní buňky jsou ty, které mají schopnost páření s haploidy opačného typu páření za vzniku diploidů. Bylo také zjištěno, že jsou tvrdší, když jsou vystaveni různým a extrémním podmínkám, takže diploidní kvasinky mohou projít meiózou, procesem buněčné reprodukce, když jsou vystaveny těmto podmínkám, aby vytvořily čtyři haploidní spory.
Hybridizace
Mnoho druhů v rámci Saccharomyces sensu stricto bylo zjištěno, že clade hybridizuje s jinými druhy, S. kudriavzevii zahrnuta. Zejména hybridizuje s S. cerevisiae (Belloch et al., 2009). Tato hybridizace je jedinečná v tom, že pravděpodobně vyplynula z jediné hybridizace dokonce zahrnující vytvoření chimérických chromozomů, které některé obsahují S. kudriavzevii geny a některé S. cerevisiae geny (Belloch et al., 2009).
V biologickém výzkumu
Hybridizační tendence S. kudriavzevii mají potenciál pro použití při vyšetřování evoluce kvasinek, které se obecně používá jako modelový systém evoluce obecně (Botstein et al., 1997). Zejména to může sloužit jako model toho, jak se proteiny mění evolucí. Například glycerol, chemická látka široce spojená s organismy tolerujícími chlad, je ten, který může být produkován ve vyšších koncentracích v S. kudriavzevii ve srovnání s S. cerevisiae (Belloch et al., 2009). Pochopení vývoje bílkovin prostřednictvím tohoto modelového systému může pomoci předpovědět a pochopit, jak k vývoji bílkovin dochází za relativně normálních okolností, což nám umožňuje vidět v širokém měřítku, co se stane, když rakovina a genetické poruchy změní expresi bílkovin v lidech.
Sekvenování genomu
S. cerevisiae byl prvním eukaryotickým organismem, který měl celý svůj genom sekvence, jiný člen sensu stricto clade (Botstein et al., 1997). Od té doby bylo zjištěno, že alespoň 30% jeho genů má homology v lidském genomu (Botstein et al., 1997). Z tohoto důvodu jsou kvasinky považovány za modelový organismus pro různé experimenty. Založení společnosti S. kudriavzevii do tohoto výzkumu nabídl poznatky o tom, jak se kvasinky vyvíjejí, aby přežily v nových prostředích, a také o tom, jak hybridizují za vzniku nových druhů (Belloch et al., 2009).
Jiná použití
S. kudriavzevii lze hybridizovat s S. cerevisiae a běžně se používá při výrobě alkoholických nápojů, jako je ležácké pivo a víno Pinot noir (Bing, Han, Liu, Wang, & Bai, 2014).
Viz také
Reference
- ^ Naumov, GI; S A James; ES Naumova; E J Louis; I N Roberts (září 2000). „Tři nové druhy v komplexu Saccharomyces sensu stricto: Saccharomyces cariocanus, Saccharomyces kudriavzevii a Saccharomyces mikatae“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 50 (5): 1931–1942. doi:10.1099/00207713-50-5-1931. PMID 11034507.
- Belloch, C., Pérez-Torrado, R., González, S. S., JoseE, P.-O., García-Martínez, J., Querol, A., & Barrio, E. (2009). Chimérické genomy přírodních hybridů Saccharomyces cerevisiae a Saccharomyces kudriavzevii. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie, 75(8), 2534–2544. http://doi.org/10.1128/AEM.02282-08
- Bing, J., Han, P.-J., Liu, W.-Q., Wang, Q.-M., & Bai, F.-Y. (2014). Důkazy o původu dalekého východu ležáckých pivních kvasnic. Aktuální biologie, 24(10), R380 – R381. http://doi.org/10.1016/j.cub.2014.04.031
- Botstein, D., Chervitz, S. a, & Cherry, J. M. (1997). Kvasinky jako modelový organismus. Věda, 277(5330), 1259–1260. http://doi.org/10.1126/science.277.5330.1259
- Hittinger, C. T. (2013). Rozmanitost a vývoj Saccharomyces: rod začínajícího modelu. Trendy v genetice, 29(5), 309–317. http://doi.org/10.1016/j.tig.2013.01.002
- Naumov, G. I .; James, S. a .; Naumova, E. S .; Louis, E. J .; Roberts, I.N. (2000). „Tři nové druhy v komplexu Saccharomyces sensu stricto: Saccharomyces cariocanus, Saccharomyces kudriavzevii a Saccharomyces mikatae“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 50 (5): 1931–1942. doi:10.1099/00207713-50-5-1931. PMID 11034507.
- Sampaio, J. P., a Gonçalves, P. (2008). Přírodní populace Saccharomyces kudriavzevii v Portugalsku jsou spojeny s dubovou kůrou a jsou sympatické s S. cerevisiae a S. paradoxus. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie, 74(7), 2144–52. http://doi.org/10.1128/AEM.02396-07
Další čtení
- Liti, G .; Barton, D. B. H .; Louis, E. J. (2006). „Sekvenční rozmanitost, izolace reprodukce a koncepce druhů v Saccharomyces“. Genetika. 174 (2): 839–850. doi:10.1534 / genetika.106.062166. ISSN 0016-6731. PMC 1602076. PMID 16951060.
- Peris, David; Lopes, Christian A; Belloch, Carmela; Querol, Amparo; Barrio, Eladio (2012). „Srovnávací genomika mezi hybridními kmeny Saccharomyces cerevisiae × Saccharomyces kudriavzevii izolovanými z vína a piva odhaluje různý původ“. BMC Genomics. 13 (1): 407. doi:10.1186/1471-2164-13-407. ISSN 1471-2164. PMC 3468397. PMID 22906207.
- Erny, C .; Raoult, P .; Alais, A .; Butterlin, G .; Delobel, P .; Matei-Radoi, F .; Casaregola, S .; Legras, J. L. (2012). „Ekologický úspěch skupiny hybridů Saccharomyces cerevisiae / Saccharomyces kudriavzevii v severoevropském prostředí výroby vína“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 78 (9): 3256–3265. doi:10.1128 / AEM.06752-11. ISSN 0099-2240. PMC 3346444. PMID 22344648.
- Sampaio, J. P .; Goncalves, P. (2008). „Přírodní populace Saccharomyces kudriavzevii v Portugalsku jsou spojovány s dubovou kůrou a jsou sympatické se S. cerevisiae a S. paradoxus“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 74 (7): 2144–2152. doi:10.1128 / AEM.02396-07. ISSN 0099-2240. PMC 2292605. PMID 18281431.