Proteinová hudba - Protein music

Proteinová hudba (DNA hudba nebo genetická hudba) je hudební technika kde hudba je složen konvertováním proteinové sekvence nebo geny na hudební noty. Jedná se o teoretickou metodu, kterou vytvořil Joel Sternheimer, který je fyzik, skladatel a matematik. (Pro tuto teorii neexistoval žádný experiment.)[Citace je zapotřebí ]

První publikovanou zmínkou o proteinové hudbě ve vědecké literatuře je článek, jehož spoluautorem je člen Šamen od roku 1996.[1]

Teorie

v Gödel, Escher, Bach, Douglas Hofstadter kreslí podobnosti a analogie mezi geny a hudbou.[2]Dokonce navrhuje, aby byl význam konstruován v bílkovinách a v hudbě.[3]

Myšlenky, které podporují možnost vytváření harmonické hudby pomocí této metody, jsou:

  • Proces opakování řídí jak hudební kompozici, tak konstrukci sekvence DNA.[4]
  • Konformace a energetika proteinových sekundárních a terciárních struktur na atomové úrovni.[5]
  • Růžový šum (korelační struktura „1 / f spektra“) byly nalezeny jak v hudebních signálech, tak v DNA sekvencích.[6]
  • Modely s duplikačními a mutačními operacemi, jako je například „model expanze a modifikace“, jsou schopné generovat sekvence s 1 / f spektry.[7]
  • Když jsou sekvence DNA převedeny na hudbu, zní to hudebně.[8][9]
  • Projekt Human Genome Project odhalil podobná genetická témata nejen mezi druhy, ale také mezi proteiny.[10]

Hudební ztvárnění DNA a proteinů není jen metodou hudební kompozice, ale také technikou studia genetických sekvencí. Hudba je způsob, jak reprezentovat sekvenční vztahy v typu informačního řetězce, ke kterému je lidské ucho ostře naladěno. Analytický a vzdělávací potenciál použití hudby k reprezentaci genetických vzorců byl uznán od střední školy po univerzitní úroveň.[10]

Praxe

  • Příklady jednoduchých proteinových struktur převedených na midi hudební soubor[11] ukázat nezávislost proteinové hudby na hudebním nástroji a pohodlí využití proteinových struktur v hudební kompozici.[12]
  • Software Algoritmické umění umí převést surová genetická data (volně dostupná ke stažení na webu) na hudbu. Existuje mnoho příkladů hudby generovaných tímto softwarem, a to jak designérem[13] a další.[14]
  • Několik lidí skládalo hudbu pomocí proteinové struktury a několik studentů a profesorů použilo hudbu jako metodu ke studiu proteinů.[10] Záznam Zvuky HIV je hudební adaptace genetického materiálu HIV / AIDS.[15]

Reference

  1. ^ King, Ross; Angus, Colin (1996). „Proteinová hudba“. CABIOS. 12 (3): 251–2. doi:10.1093 / bioinformatika / 12.3.251. PMID  8872396.
  2. ^ Hofstadter, Douglas (1999). Gödel, Escher, Bach (1980 ed.). Vintage knihy. str. 519. ISBN  978-0-465-02656-2. Představte si, že mRNA je jako dlouhý kus magnetické záznamové pásky a ribozom jako magnetofon. Když páska prochází hrající hlavou rekordéru, je „přečtena“ a převedena na hudbu nebo jiné zvuky ... Když „páska“ mRNA prochází „přehrávací hlavou“ ribozomu, „poznámky“ produkované jsou aminokyseliny a hudbu, kterou tvoří, tvoří bílkoviny.
  3. ^ Hofstadter (1980) str. 525: „Hudba není pouhou lineární posloupností not. Naše mysl vnímá hudbu na mnohem vyšší úrovni. Děláme noty do frází, fráze do melodií, melodie do pohybů a pohyby do celých kousků podobně proteiny mají smysl pouze tehdy, když fungují jako blokové jednotky. Ačkoli primární struktura nese všechny informace pro vytvoření terciární struktury, stále se „cítí“ méně, protože její potenciál je realizován pouze tehdy, když je terciární struktura skutečně fyzicky vytvořeno. “
  4. ^ Ach, Susumu; Ohno, Midori (1986). „Všudypřítomný princip opakovaného opakování řídí nejen konstrukci kódující sekvence, ale také lidské úsilí v hudební kompozici“. Imunogenetika. 24 (2): 71–8. CiteSeerX  10.1.1.455.1625. doi:10.1007 / BF00373112. PMID  3744439. S2CID  31738506.
  5. ^ "Proteomusic". Proteomusic. Citováno 22. října 2016.
  6. ^ Greenwood, Priscilla; Ward, Lawrence (2007). „1 / f šum“. Scholarpedia. 2 (12): 1537. Bibcode:2007SchpJ ... 2,1537W. doi:10,4249 / scholarpedia.1537.
  7. ^ Li, Wentian (1991). „Systémy expanze a modifikace: model pro prostorová spektra 1 / f“. Fyzický přehled A. 43 (10): 5240–60. Bibcode:1991PhRvA..43,5240L. doi:10.1103 / PhysRevA.43.5240. PMID  9904836.
  8. ^ Sansom, Clare (2002), DNA dělá bílkoviny - dělá hudbu? (PDF), The Biochemical Society, vyvoláno 22. března 2014
  9. ^ "DNA hudba ", Centrum pro genomiku a lidskou genetiku Roberta S. Boase. Archivováno 30. listopadu 2012, v Wayback Machine
  10. ^ A b C Clark, M. A. (2. listopadu 2005). „Genetic Music: Annotated Source List“.
  11. ^ příklady z databáze nukleových kyselin Archivováno 7. června 2013, v Wayback Machine
  12. ^ de la Cruz, Joanna. Plain Melody & Composition. Databáze kyseliny nukleové. Archivovány od originál dne 9. března 2004. Citováno 13. září 2011.
  13. ^ "Genetická hudba z DNA a bílkovin ", AlgoArt.com.
  14. ^ whozoo.org/ mac/Hudba/Vzorky.htm
  15. ^ Vanhoose, Joe (30. listopadu 2010). „Zvuky HIV“. Athény Banner-Herald. Archivovány od originál dne 16. ledna 2014. Citováno 17. ledna 2014.

Další čtení

Články v časopisech, seřazené podle data zveřejnění:

externí odkazy