Místo vstupu interního ribozomu pikoraviru (IRES) - Picornavirus internal ribosome entry site (IRES) - Wikipedia

Místo vstupu interního ribozomu pikoraviru (IRES)
RF00229.jpg
Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence IRES_Picorna
Identifikátory
SymbolIRES_Picorna
RfamRF00229
Další údaje
RNA typCis-reg; IRES
DoményViry
JÍTGO: 0043022
TAKSO: 0000243
PDB strukturPDBe

Tato rodina představuje Picornavirus interní místo vstupu ribozomu (IRES) prvek přítomný v jejich 5 'nepřekládané oblasti.[1] Tyto prvky byly objeveny u pikornavirů.[2] Jsou to cis působící RNA sekvence, které přijímají různé trojrozměrné struktury, získávají translační aparát a které často fungují ve spojení se specifickými proteiny vázajícími RNA.[2] Prvky IRES umožňují čepici a koncovku nezávislou překlad z mRNA v hostitelské buňce. Bylo zjištěno, že je vyžadován La autoantigen (La) Coxsackievirus B3 (CVB3) IRES zprostředkovaný překlad a bylo navrženo, že La může být vyžadována pro efektivní translaci virové RNA v slinivka břišní.[3][4] Na základě své sekundární struktury jsou pikornaviry IRES rozděleny do čtyř hlavních typů. Typ I zahrnuje enteroand rhinovirus IRES a typ II, mimo jiné kardio- a aftovirus. Typ III se používá k označení hepatitidy A IRES.[2]

Reference

  1. ^ Fernández-Miragall, Olga; Quinto, Sonia López de; Martínez-Salas, Encarnación (únor 2009). "Relevance struktury RNA pro aktivitu prvků IRES picornaviru". Virový výzkum. 139 (2): 172–182. doi:10.1016 / j.virusres.2008.07.009. PMID  18692097.
  2. ^ A b C Martínez-Salas, Encarnación; Francisco-Velilla, Rosario; Fernandez-Chamorro, Javier; Lozano, Gloria; Diaz-Toledano, Rosa (srpen 2015). "Pikornavirové prvky IRES: struktura RNA a interakce hostitelského proteinu". Virový výzkum. 206: 62–73. doi:10.1016 / j.virusres.2015.01.012. hdl:10261/140186. PMID  25617758.
  3. ^ Ray PS, Das S (říjen 2002). „La autoantigen je vyžadován pro interní překlad zprostředkovaný místem vstupu ribozomu RNA Coxsackievirus B3“. Výzkum nukleových kyselin. 30 (20): 4500–4508. doi:10.1093 / nar / gkf583. PMC  137146. PMID  12384597.
  4. ^ Liu Z, Carthy CM, Cheung P, Bohunek L, Wilson JE, McManus BM, Yang D (prosinec 1999). „Strukturální a funkční analýza 5 'nepřekládané oblasti coxsackieviru B3 RNA: studie translace a infekčnosti in vivo mutantů plné délky“. Virologie. 265 (2): 206–217. doi:10.1006 / viro.1999.0048. PMID  10600593.

externí odkazy