Rodina holinů Phi11 - Phi11 holin family

The Rodina Phi11 Holin (φ11 Holin) (TC # 1.E.11 ) představuje Holin Superfamily I.^[1]

Jeden charakterizovaný člen této rodiny, pneumokokový EJ-1 fágový holin (EJh; TC # 1.E.11.1.3 ), je hydrofobní peptid o délce 85 aminoacylových zbytků (aas) se 2 domnělými transmembránovými segmenty (TMS) vykazujícími smrtící aktivitu vnitřní membrány.^[2] Syntetický N-koncový TMS ohraničený svými N-koncovými kladně nabitými zbytky se složí do transmembránové a-šroubovice, která zvyšuje permeabilitu membrány. Oligomerní kanály různých velikostí se tvoří v závislosti na poměru peptid k lipidu. Mikroskopií s atomovou silou lze pozorovat díry membrány vyvolané peptidem.^[3]

Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny φ11 holinů lze najít v Databáze klasifikace transportérů.

Viz také

Další čtení

Bon, J .; Mani, N .; Jayaswal, R. K. (01.07.1997). "Molekulární analýza lytických genů bakteriofága 80 alfa Staphylococcus aureus". Canadian Journal of Microbiology 43 (7): 612–616. ISSN 0008-4166.PMID 9246739.
Cerca, N .; Oliveira, R .; Azeredo, J. (01.09.2007). „Náchylnost planktonických buněk a biofilmů Staphylococcus epidermidis k lytickému působení bakteriofága Staphylococcus K“. Dopisy v aplikované mikrobiologii 45 (3): 313–317. doi:10.1111 / j.1472-765X.2007.02190.x. ISSN 0266-8254. PMID 17718845.
Curtin, John J .; Donlan, Rodney M. (04.04.2006). „Použití bakteriofágů ke snížení tvorby biofilmů souvisejících s katetrem Staphylococcus epidermidis“.Antimikrobiální látky a chemoterapie 50 (4): 1268–1275. doi:10.1128 / AAC.50.4.1268-1275.2006. ISSN 0066-4804. PMC 1426991. PMID 16569839.
Iandolo, John J .; Worrell, Veronica; Groicher, Kajetan H .; Qian, Yudong; Tian, Runying; Kenton, Steve; Dorman, Angela; Ji, Honggui; Lin, Shaoping (01.05.2002).„Srovnávací analýza genomů mírných bakteriofágů φ11, φ12 a φ13 Staphylococcus aureus 8325“. Gen 289 (1–2): 109–118.doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00481-X.
Loessner, M. J .; Gaeng, S .; Wendlinger, G .; Maier, S.K .; Scherer, S. (1998-05-15). „Dvousložkový lýzový systém bakteriofága Twap Staphylococcus aureus: velký holin s TTG startem a související amidázový endolysin“. Mikrobiologické dopisy FEMS162 (2): 265–274. ISSN 0378-1097. PMID 9627962.
Martínez, Virginie; García, Pedro; García, José Luis; Prieto, María Auxiliadora (01.07.2011). „Řízená autolýza usnadňuje regeneraci polyhydroxyalkanoátu u Pseudomonas putida KT2440“. Mikrobiální biotechnologie 4(4): 533–547. doi:10.1111 / j.1751-7915.2011.00257.x.ISSN 1751-7915. PMC 3815265. PMID 21418544.
Seal, Bruce S .; Fouts, Derrick E .; Simmons, Mustafa; Garrish, Johnna K .; Kuntz, Robin L .; Woolsey, Rebekah; Schegg, Kathleen M .; Kropinski, Andrew M .; Ackermann, Hans-W. (01.01.2011). „Bakteriofágy Clostridium perfringens ΦCP39O a ΦCP26F: genomová organizace a proteomická analýza virionů“. Archivy virologie 156 (1): 25–35.doi:10.1007 / s00705-010-0812-z. ISSN 1432-8798.PMC 4127328. PMID 20963614.
Xia, Guoqing; Wolz, Christiane (01.01.2014).„Fágy Staphylococcus aureus a jejich dopad na evoluci hostitele“. Infekce, genetika a evoluce 21: 593–601. doi:10.1016 / j.meegid.2013.04.022.

Reference

^ Reddy, Bhaskara L .; Saier, Milton H. (01.11.2013). „Topologické a fylogenetické analýzy bakteriálních rodin holinů a superrodin“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1828 (11): 2654–2671. doi:10.1016 / j.bbemem.2013.07.004. ISSN 0006-3002. PMC 3788059. PMID 23856191.
^ Diaz, E .; Munthali, M .; Lunsdorf, H .; Holtje, J. V .; Timmis, K. N. (01.02.1996). „Dvoustupňový systém lýzy pneumokokového bakteriofága EJ-1 je funkční u gramnegativních bakterií: spuštění hlavního pneumokokového autolyzinu v Escherichia coli.“ Molekulární mikrobiologie. 19 (4): 667–681. doi:10.1046 / j.1365-2958.1996.399929.x. ISSN 0950-382X. PMID 8820638. S2CID 22961185.
^ Haro, Amparo; Vélez, Marisela; Goormaghtigh, Erik; Lago, Santiago; Vázquez, Jesús; Andreu, David; Gasset, María (07.02.2003). "Rekonstituce holinové aktivity se syntetickým peptidem obsahujícím 1-32 sekvenční oblast EJh, fágový holin EJ-1". The Journal of Biological Chemistry. 278 (6): 3929–3936. doi:10,1074 / jbc.M211334200. ISSN 0021-9258. PMID 12464609.

Od 10. března 2016 je tento článek zcela nebo zčásti odvozen od Databáze klasifikace transportérů (TCDB). Držitel autorských práv licencoval obsah způsobem, který umožňuje jeho opětovné použití pod CC BY-SA 3.0 a GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky. Původní text byl v „1.E.11 Rodina φ11 Holin (φ11 Holin)“

[1] Reddy, Bhaskara L .; Saier, Milton H. (01.11.2013). „Topologické a fylogenetické analýzy bakteriálních rodin holinů a superrodin“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1828 (11): 2654–2671. doi:10.1016 / j.bbemem.2013.07.004. ISSN 0006-3002. PMC 3788059. PMID 23856191.

[2] Diaz, E .; Munthali, M .; Lunsdorf, H .; Holtje, J. V .; Timmis, K. N. (01.02.1996). „Dvoustupňový systém lýzy pneumokokového bakteriofága EJ-1 je funkční u gramnegativních bakterií: spuštění hlavního pneumokokového autolyzinu v Escherichia coli.“ Molekulární mikrobiologie. 19 (4): 667–681. doi:10.1046 / j.1365-2958.1996.399929.x. ISSN 0950-382X. PMID 8820638. S2CID 22961185.

[3] Haro, Amparo; Vélez, Marisela; Goormaghtigh, Erik; Lago, Santiago; Vázquez, Jesús; Andreu, David; Gasset, María (07.02.2003). "Rekonstituce holinové aktivity se syntetickým peptidem obsahujícím 1-32 sekvenční oblast EJh, fágový holin EJ-1". The Journal of Biological Chemistry. 278 (6): 3929–3936. doi:10,1074 / jbc.M211334200. ISSN 0021-9258. PMID 12464609.

[1]

[2]

[3]