Funkce rozdělení pro interakci RNA - Partition function for Interacting RNAs

Funkce rozdělení pro interakci RNA (piRNA) je paralela C ++ balíček pro výpočet funkcí kloubů a jednotlivých oddílů pro dvě sekvence RNA. Z dělících funkcí vypočítá piRNA rovnovážné koncentrace jednoduchého a dvojitého druhu, energii seskupení, teploty tání a pravděpodobnosti párů bází. piRNA je část TaveRNA Softwarová sada RNA.

Algoritmus piRNA byl publikován v Bioinformatika 25 (12): i365-i373; doi:10.1093 / bioinformatika / btp212 PMID  19478011.[1]

Reference

  1. ^ H. Chitsaz et al., Algoritmus rozdělení funkcí pro interakci řetězců nukleových kyselin, http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/full/25/12/i365