Nussinovovy parcely - Nussinov plots

RNA a tRNA má obecně složitou dvourozměrnou strukturu. Ruth Nussinov si uvědomil, že existuje jednoduchý způsob, jak odhalit strukturu RNA a tRNA. Metodikou je vytvoření kruhu. Každá základna je očíslována. Pokud existují "n" báze, pak jsou čísla od 1 do n. Každé číslo je reprezentováno jako tečka na kruhu, postupně od 1 do n. U bází, které jsou spojeny dohromady (například 2 a 48, je nakreslena čára mezi 2 a 48. Výsledný Nussinovův graf snadno odhalí sekundární struktury, jako jsou struktury čtyřlístku v RNA nebo tRNA (přítomnost „květů“). nakreslené akordy se protínají, to odpovídá pseudoknoty ve struktuře tRNA. Pseudoknoty znamenají zvraty ve struktuře RNA nebo tRNA (RNA nebo tRNA ve skutečnosti nejsou rovinný ). Čáry (například vazby mezi květinami) vysvětlují trojrozměrné skládání (terciální skládání). To je bohužel obtížné vizualizovat, proto je nejlepší vidět vysvětlení pomocí diagramů.^[1]

The prostorová geometrie RNA může vysvětlit nemoci z lékařská genetika: konkrétně při skládání a kroucení se stává problém ribozomální zpracování.

Reference