Potlačovač nesmyslů - Nonsense suppressor - Wikipedia

A potlačovač nesmyslů je faktor, který může inhibovat účinek nesmyslná mutace. Potlačení nesmyslů lze obecně rozdělit do dvou tříd: a) mutovaný tRNA který se může vázat s terminačním kodonem mRNA; b) mutace zapnuta ribozomy snížení účinku terminačního kodonu. Předpokládá se, že potlačovače nesmyslů udržují v buňce nízkou koncentraci a nenarušují normální stav překlad většinu času. Mnoho genů navíc nemá pouze jeden terminační kodon a buňky běžně používají okrové kodony jako terminační signál, jehož potlačující nesmysly jsou obvykle neúčinné.[1][2][3]

Potlačovač nesmyslů je užitečný genetický nástroj, ale může také vést k problematickým vedlejším účinkům, protože všechny identické stop kodony v genomu budou také potlačeny ve stejné míře. Geny s různými nebo více stop kodony nebudou ovlivněny.

SUP35, potlačovač nesmyslů identifikovaný Wickner v roce 1994, je prionový protein.

V syntetické biologii se k začlenění používají umělé supresorové elongátorové tRNA nepřirozené aminokyseliny v nesmyslných kodonech umístěných v kódující sekvenci genu.[4] Start kodony lze také potlačit pomocí tRNA supresorových iniciátorů, jako je jantarová stop kodonová supresorová tRNAfMet2(CUA).[5] Žlutý iniciátor tRNA je nabitý methioninem[6] a glutamin[7].

Reference

  1. ^ David L. Nelson; et al. (2013). Principy biochemie (sv. 3). New York, NY: W. H. Freeman and Company. str. 1134. ISBN  978-1-4292-3414-6.
  2. ^ Hartwell, Leland; L. Hood; M. Goldberg; A. Reynolds; L. Silver; R. Veres (2004). Genetika: Od genů k genomům. New York, NY: McGraw-Hill. str. 267. ISBN  978-0-07-246248-7.
  3. ^ "Potlačující nesmysly". Státní univerzita v San Diegu.
  4. ^ Young, Douglas D; Schultz, Peter G (2018). „Hraní si s molekulami života“. ACS Chemická biologie. 13 (4): 854–870. doi:10.1021 / acschembio.7b00974. PMC  6061972. PMID  29345901.
  5. ^ Varshney, U .; RajBhandary, U. L. (01.02.1990). "Zahájení syntézy proteinů z terminačního kodonu". Sborník Národní akademie věd. 87 (4): 1586–1590. Bibcode:1990PNAS ... 87.1586V. doi:10.1073 / pnas.87.4.1586. ISSN  0027-8424. PMC  53520. PMID  2406724.
  6. ^ Vincent, Russel M .; Wright, Bradley W .; Jaschke, Paul R. (11.03.2019). „Měření jantarového iniciátoru tRNA ortogonality v genomicky překódovaném organismu“. ACS Syntetická biologie. 8 (4): 675–685. doi:10.1021 / acssynbio.9b00021. PMID  30856316.
  7. ^ Govindan, Ashwin; Miryala, Sandeep; Mondal, Sanjay; Varshney, Umesh (04.09.2018). „Vývoj testovacích systémů pro dekódování jantarových kodonů v krocích iniciace a prodloužení u mykobakterií“. Journal of Bacteriology. 200 (22). doi:10.1128 / jb.00372-18. ISSN  0021-9193. PMC  6199473. PMID  30181124.