Rodina NhaD - NhaD family
The Rodina NhaD (TC # 2.A.62 ) patří do Nadrodina iontových transportérů (IT).[1] Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny NhaD lze nalézt v Databáze klasifikace transportérů.
NhaD Na+/ H+ antiporter byl charakterizován ze dvou Vibrio druh: V. parahaemolyticus a V. cholerae a v haloalkalifile, Alkalimonas amylolytica.[2][3] Tyto proteiny a jejich homology jsou dlouhé 400-500 a vykazují 10-13 TMS. Katalyzují Na+/ H+ a Li+/ H+ antiport. Vykazují aktivitu při zásaditém pH (8 až 10) bez aktivity při pH 7,5. The Amylolytica antiporter má nízký Na+ afinitu a má optimální aktivitu při 600 mM Na+. Homology se nacházejí v proteobakteriích všech skupin, Flavobakterie a Chlamydie. Vzdálení homologové IT nadčeleď jsou všudypřítomné.
Zobecněná reakce katalyzovaná NhaD je:
nH+ (v) + mNa+ (out) ⇌ nH+ (out) + mNa+ (v).
Viz také
Další čtení
- Barrero-Gil, Javier; Rodríguez-Navarro, Alonso; Benito, Begoña (01.01.2007). „Klonování transportéru PpNHAD1 z Physcomitrella patens, transportéru chloroplastů vysoce konzervovaného u fotosyntetických eukaryotických organismů“. Journal of Experimental Botany 58(11): 2839–2849. doi:10.1093 / jxb / erm094. ISSN 0022-0957. PMID 17617660.
- Kurz, Matthias; Brünig, Anika N. S .; Galinski, Erwin A. (01.01.2006). „Sodík typu NhaD / proton-antiporter Halomonas elongata: mechanismus reakce na stres solí v mořských stanovištích?“. Solné systémy 2: 10.doi:10.1186/1746-1448-2-10. ISSN 1746-1448.PMC 1552076. PMID 16872527.
- Liu, červen; Xue, Yanfen; Wang, Quanhui; Wei, Yi; Swartz, Talia H .; Hicks, David B .; Ito, Masahiro; Ma, Yanhe; Krulwich, Terry A. (01.11.2005). „Profil aktivity antiporteru Na + (Li +) / H + typu NhaD ze sódového jezera Haloalkaliphile Alkalimonas amylolytica je adaptivní pro extrémní prostředí.“. Journal of Bacteriology 187 (22): 7589–7595.doi:10.1128 / JB.187.22.7589-7595.2005. ISSN 0021-9193.
- Melo, Ana M. P .; Felix, Nuno A. M .; Carita, João N .; Saraiva, Lígia M .; Teixeira, Miguel (2006-09-29).„Antiporter Na + / H + termohalofilní bakterie Rhodothermus marinus“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu 348 (3): 1011–1017.doi:10.1016 / j.bbrc.2006.07.134. ISSN 0006-291X.PMID 16904646.
- Zhong, Nai-Qin; Han, Li-Bo; Wu, Xiao-Min; Wang, Li-Li; Wang, Fang; Ma, Yan-He; Xia, Gui-Xian (01.06.2012). „Ektopická exprese bakteriálního antiporteru typu Na + / H + typu NhaD vede ke zvýšené toleranci ke kombinovaným stresům solí a zásadám“. Journal of Integrative Plant Biology 54 (6): 412–421. doi:10.1111 / j.1744-7909.2012.01129.x. ISSN 1744-7909. PMID 22583823.
Reference
- ^ Prakash, Shraddha; Cooper, Garret; Singhi, Soumya; Saier, Milton H. (03.12.2003). „Nadrodina iontových transportérů“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1618 (1): 79–92. doi:10.1016 / j.bbamem.2003.10.010. ISSN 0006-3002. PMID 14643936.
- ^ Nozaki, K .; Kuroda, T .; Mizushima, T .; Tsuchiya, T. (02.03.1998). „Nový antiporter Na + / H +, NhaD, Vibrio parahaemolyticus“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1369 (2): 213–220. doi:10.1016 / s0005-2736 (97) 00223-x. ISSN 0006-3002. PMID 9518619.
- ^ Ostroumov, Elena; Dzioba, Judith; Loewen, Peter C .; Dibrov, Pavel (2002-08-19). „Asp (344) a Thr (345) jsou kritické pro kationtovou výměnu zprostředkovanou NhaD, Na (+) / H (+) antiporterem Vibrio cholerae“. Biochimica et Biophysica Acta. 1564 (1): 99–106. doi:10.1016 / s0005-2736 (02) 00407-8. ISSN 0006-3002. PMID 12101001.
Do tato úprava, tento článek používá obsah z „2.A.62 Rodina NhaD Na +: H + Antiporter (NhaD)“, který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.