Rodina NhaC - NhaC family
The Rodina NhaC (TC # 2.A.35 ) patří do Nadrodina iontových transportérů (IT).[1] Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny NhaC lze nalézt v Databáze klasifikace transportérů.
Byli funkčně charakterizováni dva členové rodiny NhaC. Jeden je považován za Na+: H+ antiporter;[2] druhý je malát · H+: laktát · Na+ antiporter.[3] Několik paralogů se nachází v Vibrio cholerae, a dva paralogy jsou nalezeny kódované v kompletně sekvenovaných genomech obouHaemophilus influenzae a Bacillus subtilis. E-coli postrádá takový homolog. Pyrococcus druhy mají také alespoň jeden homolog. Členové rodiny NhaC se tedy nacházejí v obou Gramnegativní bakterie a Grampozitivní bakterie stejně jako archaea. NhaC z B. firmus je dlouhý 462 aminoacylových zbytků a má 12 domnělých transmembránových a-šroubovicových segmentů. MleN z B. subtilis (468 aas; TC # 2.A.35.1.2 ) také vykazuje 12 domnělých TMS.
Transportní reakce katalyzovaná NhaC je pravděpodobně:
Na + (vstup) + nH + (výstup) ⇌ Na + (výstup) + nH + (vstup). (n> 1)
Katalyzováno MleN je pravděpodobně:
Malát (out) + H+ (out) + laktát (in) + Na+ (in) ⇌ Malát (in) + H+ (dovnitř) + laktát (ven) + Na+ (ven)
Viz také
Další čtení
- Ivey, D. M .; Guffanti, A. A .; Bossewitch, J. S .; Padan, E .; Krulwich, T. A. (05.12.1991). „Molekulární klonování a sekvenování genu z alkalifilního Bacillus firmus OF4, který funkčně doplňuje kmen Escherichia coli nesoucí deleci v nhaA Na + / H + antiporterovém genu“. The Journal of Biological Chemistry 266 (34): 23483–23489. ISSN 0021-9258. PMID 1660475.
- Liew, Chong Wai; Illias, Rosli Md; Mahadi, Nor Muhammad; Najimudin, Nazalan (01.11.2007)."Exprese Na + / H + antiporterového genu (g1-nhaC) alkalifilního Bacillus sp. G1 v Escherichia coli". Mikrobiologické dopisy FEMS 276 (1): 114–122. doi:10.1111 / j.1574-6968.2007.00925.x. ISSN 0378-1097. PMID 17937670.
- Panina, Ekaterina M .; Vitreschak, Alexey G .; Mironov, Andrey A .; Gelfand, Mikhail S. (2003-05-28).„Regulace biosyntézy a transportu aromatických aminokyselin v grampozitivních bakteriích s nízkým GC“. Mikrobiologické dopisy FEMS 222 (2): 211–220. ISSN 0378-1097.PMID 12770710.
- Ravcheev, Dmitrij A .; Nejlepší, Aarone A .; Tintle, Nathan; Dejongh, Matthew; Osterman, Andrei L .; Novichkov, Pavel S .; Rodionov, Dmitrij A. (01.07.2011).„Odvoz transkripční regulační sítě u Staphylococcus aureus integrací experimentálních a genomických důkazů“. Journal of Bacteriology 193(13): 3228–3240. doi:10.1128 / JB.00350-11. ISSN 1098-5530. PMC 3133287. PMID 21531804.
- Rodionov, Dmitrij A .; Hebbeln, Peter; Eudes, Aymerick; ter Beek, Josy; Rodionova, Irina A .; Erkens, Guus B .; Slotboom, Dirk J .; Gelfand, Mikhail S .; Osterman, Andrei L. (01.01.2009). „Nová třída modulárních transportérů pro vitamíny u prokaryot“. Journal of Bacteriology 191 (1): 42–51. doi:10.1128 / JB.01208-08.ISSN 1098-5530. PMC 2612444. PMID 18931129.
Reference
- ^ Prakash, Shraddha; Cooper, Garret; Singhi, Soumya; Saier, Milton H. (03.12.2003). „Nadrodina iontových transportérů“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1618 (1): 79–92. doi:10.1016 / j.bbamem.2003.10.010. ISSN 0006-3002. PMID 14643936.
- ^ Ito, M .; Guffanti, A. A .; Zemsky, J .; Ivey, D. M .; Krulwich, T. A. (01.06.1997). „Role nhaC kódovaného antiporteru Na + / H + alkalifilního Bacillus firmus OF4“. Journal of Bacteriology. 179 (12): 3851–3857. doi:10.1128 / jb.179.12.3851-3857.1997. ISSN 0021-9193. PMC 179192. PMID 9190799.
- ^ Wei, Y .; Guffanti, A. A .; Ito, M .; Krulwich, T. A. (2000-09-29). „Bacillus subtilis YqkI je nový antiporter jablečného / Na + -laktátu, který podporuje růst malátu při nízké protonmotivní síle“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (39): 30287–30292. doi:10,1074 / jbc.M001112200. ISSN 0021-9258. PMID 10903309.
Do tato úprava, tento článek používá obsah z „2.A.35 Rodina NhaC Na +: H + Antiporter (NhaC)“, který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.