Rodina NhaB - NhaB family

The Rodina NhaB (TC # 2.A.34 ) patří do Nadrodina iontových transportérů (IT).[1] Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny NhaB lze nalézt v Databáze klasifikace transportérů.

Homology NhaB mají obvykle délku přibližně 500 aminoacylových zbytků (aas) a mají přibližně 12 transmembránových a-šroubovicových klíčů (TMS), i když někteří členové se liší počtem TMS. NhaB homology také vykazují oblast s omezenou sekvenční podobností s 46 kDa membránovým proteinem neznámé funkce z Mycobacterium leprae (spP46838), který je také homologní se členem čerpadel rezistence bakterií, archea a eukaryot vůči rezistenci na arzeničnan (TC # 3.A.4 ). Pouze Gramnegativní bakteriální proteiny byly funkčně charakterizovány.

The E-coli NhaB je z 58% totožný s ortologickým Vibrio alginolyticus Na+/ H+ antiporter.[2] I když se předpokládá, že tento protein bude vykazovat 10 TMS, konstrukce NhaB-phoA fúze vedly k důkazu o modelu 9 TMS s N-koncem v cytoplazmě a C-koncem v periplazma.[3] Centrálně umístěný aspartylový zbytek ve 3. TMS je zachován u všech členů rodiny a je důležitý pro aktivitu.[4]

Zobecněná transportní reakce katalyzovaná NhaB z E-coli je:

2 Na+ (v) + 3 H. (in) + 3 H+ (out) ⇌ 2 Na+ (ven) + 3 H+ (v).

Viz také

Reference

  1. ^ Prakash, Shraddha; Cooper, Garret; Singhi, Soumya; Saier, Milton H. (03.12.2003). „Nadrodina iontových transportérů“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1618 (1): 79–92. doi:10.1016 / j.bbamem.2003.10.010. ISSN  0006-3002. PMID  14643936.
  2. ^ Pinner, E .; Padan, E .; Schuldiner, S. (06.06.1992). "Klonování, sekvenování a exprese genu nhaB, kódující antiporter Na + / H + v Escherichia coli". The Journal of Biological Chemistry. 267 (16): 11064–11068. ISSN  0021-9258. PMID  1317851.
  3. ^ Enomoto, H .; Unemoto, T .; Nishibuchi, M .; Padan, E .; Nakamura, T. (06.03.1998). „Topologická studie Vibrio alginolyticus NhaB Na + / H + antiporter s použitím genových fúzí v buňkách Escherichia coli“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1370 (1): 77–86. doi:10.1016 / s0005-2736 (97) 00245-9. ISSN  0006-3002. PMID  9518558.
  4. ^ Nakamura, T .; Fujisaki, Y .; Enomoto, H .; Nakayama, Y .; Takabe, T .; Yamaguchi, N .; Uozumi, N. (2001-10-01). „V jeho aktivitě hraje roli reziduum aspartát-147 ze třetí transmembránové oblasti Na (+) / H (+) antiporteru NhaB z Vibrio alginolyticus.“. Journal of Bacteriology. 183 (19): 5762–5767. doi:10.1128 / JB.183.19.5762-5767.2001. ISSN  0021-9193. PMC  95471. PMID  11544242.

Do tato úprava, tento článek používá obsah z „2.A.34 Rodina NhaB Na +: H + Antiporter (NhaB)“, který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.