Nativní kontakt - Native contact - Wikipedia
 | tento článek ne uvést žádný Zdroje. (Září 2009) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony) |
v skládání bílkovin, a nativní kontakt je kontakt mezi boční řetězy ze dvou aminokyseliny které nesousedí v aminokyselinová sekvence (tj. jsou v primární sekvenci od sebe vzdáleny více než čtyři zbytky, aby se odstranily triviální i až i + 4 kontakty podél alfa šroubovic), ale jsou prostorově blízko v proteinu rodný stát terciární struktura. Zlomek nativních kontaktů reprodukovaných v konkrétní struktuře se často používá jako a souřadnice reakce pro měření odchylky od nativního stavu struktur produkovaných během molekulární dynamika simulace nebo srovnávací testy z predikce proteinové struktury metody.
The kontaktní objednávka je měřítkem lokality přirozených kontaktů proteinu; to znamená vzdálenost sekvence mezi aminokyselinami, které tvoří kontakty. Předpokládá se, že bílkoviny s nízkým počtem kontaktů se skládají rychleji a některé mohou být kandidáty skládání z kopce.
 | Tento biochemie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |