Národní centrum pro funkční glykomiku - National Center for Functional Glycomics - Wikipedia

Národní centrum pro funkční glykomiku (NCFG)

The Národní centrum pro funkční glykomiku je organizace zaměřená na vývoj technologického vývoje v glykosciences. Specificky se zaměřují na analýzu glykanů a molekulární mechanismy rozpoznávání glykanů proteiny důležité v lidské biologii a nemoci. Středisko bylo založeno v Emory University v roce 2013 s financováním do 5,5 milionu USD Národní institut zdraví[1][2][3] pod vedením Richard D. Cummings. Střed se přesunul do Harvardská Univerzita v září 2015 a aktuálně se nachází na Lékařské centrum Beth Israel Deaconess v Boston Massachusetts.[4][5] Centrum je přidruženo k Konsorcium pro funkční glykomiku.

The National Center for Functional Glycomics is one of four glycomics-related biomedical technology research resource střediska ve Spojených státech.[6] Tato centra poskytují jedinečnou technologii a metody v oblasti výzkumu glykomiky. Středisko je odpovědné za služby a školení pro externí vyšetřovatele a také za poskytování přístupu a šíření technologií, metod a softwaru.[7]

Výzkumné projekty

Projekty centra jsou:[8]

  • Analýza potenciálních proteinů vázajících glykan na různých glykanových polích (pole glykanů CFG, pole mikrobiálních glykanů, pole odvozená od NCFG)[je zapotřebí objasnění ]
  • Strukturní analýza glykanů
  • Výroba přirozeně se vyskytujících glykanů izolací

Brokovnice glycomics

Centrum zkoumá techniky brokovnicových glykomik, při nichž se glykany sklízejí a čistí z různých materiálů, jako je mateřské mléko a prasečí plíce. Takové techniky vyvinuté centrem a dalšími glykomickými skupinami lze dále aplikovat na tkáně za účelem generování celkového glykátu tkáně pro výzkum různých onemocnění, jako je rakovina, zánět a autoimunitní onemocnění.[9][10]

Oxidační uvolňování přírodních glykanů

Ve středu byla vyvinuta technika oxidačního uvolňování přírodních glykanů. Tento proces zahrnuje ošetření tkání v domácnosti bělením za účelem uvolnění glykanů pro glykomiku.[11] Konečným cílem tohoto přístupu je zpřístupnit glykomiku větší komunitě vědců pomocí vývoje snadno dostupných nástrojů.

GlycoVzorek

Národní centrum pro funkční glykomiku vyvinulo GlycoPattern, webový zdroj bioinformatiky, který pomáhá při analýze dat glykanového pole. Web GlycoPattern nabízí nástroje a algoritmy k objevování strukturních motivů, vizualizace teplotní mapy pro více srovnání experimentů, shlukování proteinů vázajících glykan.[12][13]

Služby

Národní centrum pro funkční glykomiku nabízí následující služby:

  • Tisk vlastních mikročipů na skleněné diapozitivy
  • Analýza kvalitativních a kvantitativních změn glykanů spojených s chorobami a poruchami pomocí značení glykanu redukčním izotopem a hmotnostní spektrometrie.

externí odkazy

Reference

  1. ^ NIH financuje nové Národní centrum pro funkční glykomiku v Emory
  2. ^ Novinky GenomeWeb - Emory vyhrává 5,5 mil. USD za spuštění Centra funkční glykomiky
  3. ^ DDNews- NIH bude financovat glykomické centrum v Emory
  4. ^ NIAID CEIRS - renomovaný glykobiolog a výzkumník chřipky, Dr. Richard Cummings, se stěhuje na Harvard Medical School
  5. ^ Konverzace s Richardem Cummingsem
  6. ^ Zdroje pro výzkum biomedicínských technologií NIH pro glykomiku
  7. ^ Technology.org - Glycans: Sweet Spot (18. října 2016)
  8. ^ Informace o projektu NIH: 5P41GM103694-05 Národní centrum pro funkční glykomiku
  9. ^ Vědec - oprava cukru (1. dubna 2015)
  10. ^ Song, Xuezheng; Lasanajak, Yi; Xia, Baoyun; Heimburg-Molinaro, Jamie; Rhea, Jeanne M; Ju, Hong; Zhao, Chunmei; Molinaro, Ross J.; Cummings, Richard D; Smith, David F (5. prosince 2010). „Broková glykomika: strategie microarray pro funkční glykomiku“. Přírodní metody. 8 (1): 85–90. doi:10.1038 / nmeth.1540. PMC  3074519. PMID  21131969.
  11. ^ Song, Xuezheng; Ju, Hong; Lasanajak, Yi; Kudelka, Matthew R; Smith, David F; Cummings, Richard D (2. května 2016). „Oxidační uvolňování přírodních glykanů pro funkční glykomiky“. Přírodní metody. 13 (6): 528–534. doi:10.1038 / nmeth.3861. PMC  4887297. PMID  27135973.
  12. ^ Agravat, S. B .; Saltz, J. H .; Cummings, R. D .; Smith, D. F. (20. srpna 2014). „GlycoPattern: webová platforma pro těžbu glykanových polí“. Bioinformatika. 30 (23): 3417–3418. doi:10.1093 / bioinformatika / btu559. PMC  4296152. PMID  25143288.
  13. ^ GlycoVzorek