Víceúrovňový formát elektrofyziologie - Multiscale Electrophysiology Format
Multiscale Electrophysiology Format (MEF) byl vyvinut pro zpracování velkého množství dat produkovaných ve velkém měřítku elektrofyziologie u lidí a zvířat. MEF může ukládat data jakékoli časové řady až do 24 bity na délku a využívá bezztrátový kódovaný rozsah rozdílová komprese. Identifikační údaje subjektu v záhlaví souboru mohou být šifrované pomocí 128bitového šifrování AES, aby bylo vyhověno HIPAA požadavky na soukromí pacientů při přenosu dat přes otevřenou síť.
Komprimovaná data jsou uložena v nezávislých blocích, aby umožňovala přímý přístup k datům, usnadňovala paralelní zpracování a omezovala účinky možného poškození souborů. Věrnost dat je zajištěna kontrolou 32bitové cyklické redundance v každém bloku komprimovaných dat pomocí Koopmanův polynom (0xEB31D82E), který má a Hammingova vzdálenost od 4 do 114 kbits.
Formální specifikace [1] a zdrojový kód [2] jsou k dispozici online. MEF_import[3] je EEGLAB plugin pro import dat MEF do EEGLAB.
Viz také
Reference
- ^ Specifikace formátu MEF
- ^ Zdrojový kód
- ^ Cui, Richard Jie (2019-05-23), Importujte data v souboru MEF (Mutiscale Electrophysiology Format) do EEGLAB: jiecui / MEF_import, vyvoláno 2019-05-23
Zdroje
- Martin, GNN. Kódování rozsahu: algoritmus pro odstranění nadbytečnosti z digitalizované zprávy. Konference o překódování videa a dat, Southampton, 1979.
- Koopman, P. 32bitové kódy cyklické redundance pro internetové aplikace. Mezinárodní konference o spolehlivých systémech a sítích (červen 2002). 459.
- Brinkmann, BH; et al. (2009). „Elektrofyziologie velkého rozsahu: získávání, komprese, šifrování a ukládání velkých dat“. Journal of Neuroscience Methods. 180 (1): 185–192. doi:10.1016 / j.jneumeth.2009.03.022. PMC 2720128. PMID 19427545.