Michael Antonio Savageau - Michael Antonio Savageau

Michael A. Savageau
MAS2 2020.jpg
narozený (1940-12-03) 3. prosince 1940 (věk 80)
Fargo, Severní Dakota, USA
NárodnostUSA
VzděláníUniversity of Minnesota (BS ),
University of Iowa (SLEČNA ),
Stanfordská Univerzita (PhD )
Známý jakoTeorie biochemických systémů,
Matematicky řízené srovnání,
Návrh prostorového přístupu,
Fenotypově zaměřené modelování
Vědecká kariéra
InstituceUniversity of California, Davis
Doktorský poradceJohn Steward
webová stránkasavageaulab.bme.ucdavis.edu

Michael A. Savageau (narozen 3. prosince 1940) je významným profesorem na katedrách mikrobiologie a molekulární genetiky a biomedicínského inženýrství na University of California, Davis.[1] Byl jmenován Člen Institutu elektrotechnických a elektronických inženýrů (IEEE) v roce 2013[2] pro aplikaci koncepcí systémového inženýrství v molekulární biologii.

Raný život a vzdělávání

Michael Antonio Savageau, jedno ze sedmi dětí, se narodil v roce Fargo, Severní Dakota 3. prosince 1940. Jeho otec byl holič a jeho matka byla učitelka. Během střední školy byl vášnivým hokejistou a tenistou a připsal si sport tím, že ho naučil hodnotnému životu a profesionálním dovednostem. Během celé své akademické kariéry bojoval s nediagnostikovanou dyslexií, ale vyvinul kompenzační strategie. Například nebyl schopen dělat si poznámky na přednáškových kurzech, a tak si vytvořil impozantní soustředění a paměťové schopnosti. Jeho dyslexie vyvolala jeho zájem o matematiku a v těchto třídách vynikal. Savageau vystudoval Fargo Central High School v roce 1957 a pokračoval vydělávat jeho Bakalář věd titul v oboru strojírenství z University of Minnesota v roce 1961, a Mistr vědy stupně z University of Iowa v roce 1963. Byl přijat do Ph.D. program v Elektrotechnika v Stanfordská Univerzita v roce 1963 a právě tam začal rozvíjet svůj zájem o aplikaci technických principů a metodik na biologické systémy. Savageau byl postdoktorandem na obou The University of California, Los Angeles (1967 - 1968, v laboratoři prof. Isaaca Hararyho) a Stanfordská Univerzita (1968 - 1970) před nástupem na fakultu Michiganská univerzita v roce 1970. Inicioval interdisciplinární vzdělávací program v Michiganu v oboru buněčné biotechnologie a jeho interdisciplinární bioinformatický program. V letech 1992 až 2002 předsedal katedře mikrobiologie a imunologie a v roce 2002 byl jmenován významným univerzitním profesorem Nicolase Raševského. University of California, Davis v roce 2003 předsedal katedře biomedicínského inženýrství v letech 2003 až 2005[3]

Osobní život

Savageau se ve Stanfordu setkala se spolužačkou Ann Birky (v současnosti Ann Savageau, umělkyní a profesorkou umění a designu) a vzali se v roce 1967. Svou rodinu vychovali v Ann Arbor, Michigan, kde oba zastávali fakultní pozice v The Michiganská univerzita. Měli tři děti, Marka, Patricka a Elisu, které všechny předcházely smrti. Pomáhají vychovávat vnoučata Davise, Kalifornie.

Ceny a vyznamenání

Vyznamenání Dr. Savageaua zahrnuje Guggenheim Fellow,[4] Fulbright Senior Research Fellow, Michigan Society of Fellows,[5] Americká akademie mikrobiologie Chlapík,[6] Přednášející pro mikrobiologii,Americká asociace pro rozvoj vědy Chlapík,[7]Americký institut pro lékařské a biologické inženýrství Chlapík,[8] Institute of Electrical and Electronics Engineers Chlapík,[9] Moore Distinguished Scholar at the Kalifornský technologický institut,[10] Cena Institut des Hautes Études Scientifiques, 79. přednášející Josiah Willard Gibbs pro Americkou matematickou společnost,[11] Stanislaw Ulam Distinguished Scholar Award od Centra pro nelineární studia, Národní laboratoř Los Alamos,[12] Člen USA National Academy of Medicine,[13]Čestný doktor věd, Universitat de Lleida, Španělsko,[14] a Michael A. Savageau Collegiate Professorship in Computational Medicine and Bioinformatics trvale dotovaný Michiganská univerzita.

Vybrané publikace

Vědecká kariéra Dr. Savageaua zahrnuje jednu knihu a více než 200 recenzovaných vědeckých publikací,[15] které pokrývají různé matematické a biologické otázky. Níže jsou uvedeny některé z jeho klíčových publikací seřazené podle témat.

Teorie biochemických systémů

  • Savageau, MA (1969). Analýza biochemických systémů: I. Některé matematické vlastnosti rychlostního zákona pro jednotlivé enzymatické reakce. J. Theor. Biol. 25, 365-369
  • Savageau, MA (1969). Analýza biochemických systémů: II. Ustálená řešení pro systém n-pool využívající aproximaci podle zákona o výkonu. J. Theor. Biol. 25, 370–379.
  • Savageau, MA (1970). Analýza biochemických systémů: III. Dynamická řešení využívající aproximaci mocninového zákona. J. Theor. Biol. 26, 215-226
  • Savageau, M.A., Voit, E.O. (1987). Přepracování nelineárních diferenciálních rovnic jako S-systémů: kanonická nelineární forma. Matematika. Biosci. 87, 83-115.
  • Savageau, MA (1971). Citlivost parametru jako kritérium pro hodnocení a srovnání výkonnosti biochemických systémů. Příroda 229, 542-544

Principy genových obvodů a designu

  • Savageau. M.A. (1974). Porovnání klasických a autogenních systémů regulace u indukovatelných operonů. Příroda 252, 546-549
  • Hlaváček, W.S., Savageau, M.A. (1996). Pravidla pro vázanou expresi regulačních a efektorových genů v indukovatelných obvodech. J. Mol. Biol. 255, 121-139.
  • Savageau, M.A. (2001). Principy návrhu obvodů elementárních genů: Prvky, metody a příklady. Chaos 11, 142-159.
  • Atkinson, M.R., Savageau, M.A., Myers, J.T., Ninfa, A.J. (2003). Vývoj genetických obvodů vykazujících přepínací nebo oscilační chování u Escherichia coli. Buňka 113, 597-607.
  • Wall, M.E., Hlaváček, W.S., Savageau, M.A. (2004). Návrh genových obvodů: poučení z bakterií. Nat. Genet. 5, 34-42

Metoda matematicky řízeného srovnání

  • Savageau, M. A. (1972). Chování neporušených biochemických řídicích systémů. Curr. Horní. Buňka. Reg. 6, 63–130.
  • Savageau, MA (1974). Optimální návrh zpětnovazebního řízení inhibicí: úvahy v ustáleném stavu. J. Mol. Evol., 4, 139–156.
  • Irvine, D.H. a Savageau, M.A. (1985). Síťová regulace imunitní odpovědi: alternativní kontrolní body pro potlačující modulaci efektorových lymfocytů. J. Immunol., 134, 2100– 2116.
  • Hlaváček, W.S. a Savageau, M.A. (1996) Pravidla pro vázanou expresi regulačních a efektorových genů v indukovatelných obvodech. J. Mol. Biol. 255, 121–139.
  • Alves, R., Savageau, M.A. (2000). Rozšíření metody matematicky řízeného srovnání o numerická srovnání. Bioinformatika 16, 786–798.

Přístup k návrhovému prostoru, sada nástrojů pro návrhový prostor a strategie modelování zaměřená na fenotyp

  • Savageau, M.A., Coelho, P.M.B.M., Fasani, R.A., Tolla, D.A., Salvador, A. (2009). Fenotypy a tolerance v konstrukčním prostoru biochemických systémů. PNAS 106, 6435-6440.
  • Fasani, R.A., Savageau, M.A. (2010). Automatizovaná konstrukce a analýza návrhového prostoru pro biochemické systémy. Bioinformatika 26, 2601-2609
  • Lomnitz, J.G., Savageau, M.A. (2016). Design Space Toolbox V2: automatizovaný software umožňující novou strategii modelování zaměřenou na fenotyp pro přírodní a syntetické biologické systémy. Přední. Genet. 7, 118
  • Valderrama-Gómez, M.A., Parales, R.E., Savageau, M.A. (2018). Fenotypově centrické modelování pro objasnění principů biologického designu. J. Theor. Biol. 455, 281-292.
  • Valderrama-Gómez, M.A, Lomnitz, J.G., Fasani, RA, Savageau, M.A. (2020). Mechanické modelování biochemických systémů bez apriorních hodnot parametrů pomocí nástroje Design Space Toolbox v. 3.0. iScience 101200.

Knihy

  • Analýza biochemických systémů: Studie funkce a designu v molekulární biologii, Addison-Wesley 1976

Reference

  1. ^ „Adresář fakulty UC Davis“.
  2. ^ „2013 vyvýšený chlap“ (PDF). IEEE Fellows Directory.
  3. ^ „Michael A. Savageau. Stručná biografie“.
  4. ^ „Památná nadace Johna Simona Guggenheima“. Citováno 2020-11-14.
  5. ^ „University of Michigan. Society of Fellows“. Citováno 2020-11-14.
  6. ^ „Tisková zpráva. Členové zvolení do Americké akademie mikrobiologie“. Citováno 2020-11-14.
  7. ^ „Americká asociace pro rozvoj vědy. UC Davis Fellows“. Citováno 2020-11-14.
  8. ^ „Třída AIMBE College of Fellows 2007“. Citováno 2020-11-14.
  9. ^ „Institute of Electrical and Electronics Engineers. UC Davis Fellows“. Citováno 2020-11-14.
  10. ^ „Moore Distinguished Scholars“. Citováno 2020-11-14.
  11. ^ „Přednášky Josiah Willard Gibbs“. Citováno 2020-11-14.
  12. ^ „CNLS Ulam Scholars“. Citováno 2020-11-14.
  13. ^ „National Academy of Medicine. UC Davis Honorees“. Citováno 2020-11-14.
  14. ^ „Tisková zpráva. University of Lleida“. Citováno 2020-11-14.
  15. ^ „Profil Google Scholar“. Citováno 2020-11-22.