MiRTarBase - MiRTarBase
![]() | |
---|---|
Obsah | |
Popis | Experimentálně ověřeno mikroRNA -cílové interakce (MTI). |
Typy dat zajat | Interakce miRNA-cíl |
Kontakt | |
Výzkumné centrum | Národní univerzita Chiao Tung |
Laboratoř | Ústav bioinformatiky a systémové biologie |
Autoři | Sheng-Da Hsu |
Primární citace | Hsu & al. (2011)[1] |
Datum vydání | 2013 |
Přístup | |
webová stránka | http://miRTarBase.mbc.nctu.edu.tw/ |
Stáhnout URL | http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/download.php |
Smíšený | |
Verze | 4.5 |
miRTarBase [1] je upravená databáze Interakce mikroRNA-cíl. Jako databáze nashromáždil miRTarBase více než padesát tisíc miRNA-cílových interakcí (MTI), které jsou shromažďovány ručním průzkumem relevantní literatury po systematickém dolování dat k filtrování výzkumných článků souvisejících s funkčními studiemi miRNA. Obecně jsou shromážděné MTI validovány experimentálně pomocí reportérového testu, Western blotu, microarray a sekvenčních experimentů nové generace. Zatímco obsahuje největší množství validovaných MTI, miRTarBase poskytuje nejaktuálnější kolekci ve srovnání s jinými podobnými, dříve vyvinutými databázemi.
![](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/48/MiRTarBase_Improvements.jpg/220px-MiRTarBase_Improvements.jpg)
vylepšení miRTarBase
Viz také
Reference
- ^ A b Hsu SD, Lin FM, Wu WY, Liang C, Huang WC, Chan WL, Tsai WT, Chen GZ, Lee CJ, Chiu CM, Chien CH, Wu MC, Huang CY, Tsou AP, Huang HD (2011). „miRTarBase: databáze kurátoruje experimentálně ověřené interakce microRNA-cíl“. Výzkum nukleových kyselin. 39 (Problém s databází): D163-9. doi:10.1093 / nar / gkq1107. PMC 3013699. PMID 21071411.
externí odkazy
![]() | Tento Biologická databáze související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |